116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0331 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0331  putative lipoprotein signal peptide  100 
 
 
343 aa  684    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.435973  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0800  putative lipoprotein signal peptide  34.72 
 
 
373 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4713  putative lipoprotein signal peptide  35.53 
 
 
365 aa  159  8e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.405813 
 
 
-
 
NC_003296  RS03192  lipoprotein signal peptide  38.14 
 
 
372 aa  158  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5358  putative lipoprotein signal peptide  35.67 
 
 
374 aa  153  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2487  putative lipoprotein signal peptide  36.14 
 
 
334 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3848  hypothetical protein  34.04 
 
 
330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1306  hypothetical protein  33.79 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0371731 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6097  hypothetical protein  35.4 
 
 
332 aa  126  7e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6835  putative lipoprotein signal peptide  32.55 
 
 
328 aa  124  3e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.544443  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1405  hypothetical protein  31.31 
 
 
342 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.301855  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0309  putative lipoprotein signal peptide  32.71 
 
 
352 aa  116  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.45814 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3135  hypothetical protein  32.36 
 
 
339 aa  110  3e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0222063  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3002  hypothetical protein  32.85 
 
 
346 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2607  hypothetical protein  31.19 
 
 
345 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.313351 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0878  hypothetical protein  30.94 
 
 
347 aa  106  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2838  hypothetical protein  30.11 
 
 
348 aa  105  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.540199  normal  0.173901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2934  hypothetical protein  30.86 
 
 
348 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2757  hypothetical protein  30.88 
 
 
348 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3411  hypothetical protein  31.47 
 
 
347 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.505618  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0990  hypothetical protein  29.9 
 
 
278 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3713  hypothetical protein  28.7 
 
 
346 aa  94  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0425  dienelactone hydrolase  29.39 
 
 
338 aa  93.2  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0555723  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.95 
 
 
568 aa  93.2  7e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0877  hypothetical protein  31.3 
 
 
345 aa  91.3  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2590  hypothetical protein  26.07 
 
 
341 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1024  hypothetical protein  30.28 
 
 
330 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.401843  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3583  protein of unknown function DUF1400  30.05 
 
 
572 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3930  protein of unknown function DUF1400  28.64 
 
 
607 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2531  protein of unknown function DUF1400  28.1 
 
 
572 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.732033  normal  0.144228 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1076  dienelactone hydrolase-like protein  28.92 
 
 
476 aa  80.5  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2716  hypothetical protein  27.2 
 
 
546 aa  80.1  0.00000000000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0494  protein of unknown function DUF1400  32.69 
 
 
569 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0319024  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4229  protein of unknown function DUF1400  30.54 
 
 
568 aa  78.2  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4546  protein of unknown function DUF1400  30.24 
 
 
551 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2964  hypothetical protein  26.73 
 
 
543 aa  76.6  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3315  lipoprotein signal peptide  31.05 
 
 
302 aa  76.6  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.222705  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2032  hypothetical protein  27.45 
 
 
565 aa  75.1  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.347615  normal  0.0686681 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.71 
 
 
382 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1441  hypothetical protein  23.51 
 
 
312 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0733  hypothetical protein  27.92 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.266553  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2285  putative secreted lipase  32.43 
 
 
410 aa  73.2  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00039639  normal  0.79101 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  28.37 
 
 
545 aa  72.8  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4547  protein of unknown function DUF1400  26.47 
 
 
533 aa  72.8  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0076  hypothetical protein  29.11 
 
 
341 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.15541  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3241  protein of unknown function DUF1400  27.86 
 
 
567 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3825  protein of unknown function DUF1400  28.71 
 
 
547 aa  72  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3976  hypothetical protein  26.32 
 
 
601 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.671278  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2117  hypothetical protein  26.57 
 
 
567 aa  70.9  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.383292  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  26.41 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1800  protein of unknown function DUF1400  26.92 
 
 
542 aa  70.1  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0630  hypothetical protein  37.41 
 
 
410 aa  69.7  0.00000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  27.85 
 
 
318 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  24.55 
 
 
430 aa  68.2  0.0000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  27.42 
 
 
380 aa  68.2  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1136  protein of unknown function DUF1400  25.68 
 
 
600 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1166  protein of unknown function DUF1400  25.68 
 
 
600 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  26.7 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  26.7 
 
 
318 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  27.81 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2145  protein of unknown function DUF1400  26.05 
 
 
570 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.367657 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5886  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  37.61 
 
 
361 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.695825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  24.86 
 
 
464 aa  62  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  23.05 
 
 
449 aa  62.4  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4384  protein of unknown function DUF1400  26.11 
 
 
605 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.101972 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0009  hypothetical protein  29.44 
 
 
298 aa  60.8  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0593  hydrolase protein  29.73 
 
 
320 aa  59.7  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2566  dienelactone hydrolase-like  25.86 
 
 
439 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1126  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  38.94 
 
 
350 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1237  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  38.79 
 
 
350 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136395  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  30.34 
 
 
426 aa  57.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2723  protein of unknown function DUF1400  25 
 
 
571 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.128578  hitchhiker  0.00368016 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2316  hypothetical protein  29.03 
 
 
498 aa  55.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1172  dienelactone hydrolase-like protein  24.5 
 
 
449 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.22553  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1295  hypothetical protein  23.51 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.103756  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0371  putative lipoprotein signal peptide  40.91 
 
 
146 aa  55.1  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.797629 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1107  dienelactone hydrolase-like protein  23.73 
 
 
369 aa  54.7  0.000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.12853  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4065  putative hydrolase, putative exported protein  27.05 
 
 
336 aa  55.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263411  normal  0.489337 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1117  dienelactone hydrolase-like protein  27.88 
 
 
313 aa  53.5  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.218404  normal  0.24228 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2163  platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  24.9 
 
 
330 aa  53.1  0.000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0271635  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0856  putative hydrolase, putative exported protein  26.84 
 
 
337 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0896455 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5444  hypothetical protein  29.08 
 
 
327 aa  51.6  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0680915  normal  0.105622 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1079  hypothetical protein  23.15 
 
 
369 aa  50.4  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.000000000122089  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001493  hypothetical protein  23.31 
 
 
339 aa  50.1  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.271715  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4564  dienelactone hydrolase  27.98 
 
 
335 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0882  triacylglycerol lipase  30.63 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2690  hypothetical protein  29.8 
 
 
498 aa  48.9  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165896  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4327  hypothetical protein  34.51 
 
 
319 aa  48.9  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3493  dienelactone hydrolase-like protein  26.62 
 
 
433 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.44711  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30181  esterase/lipase/thioesterase family protein  25.38 
 
 
505 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.157772 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1021  hypothetical protein  30.81 
 
 
389 aa  48.1  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2084  hypothetical protein  32.39 
 
 
322 aa  47.8  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4675  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 
334 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.719467  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  27.62 
 
 
474 aa  46.6  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3170  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5198  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.581838  hitchhiker  0.00844034 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5079  alpha/beta hydrolase fold  45.16 
 
 
277 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5818  hypothetical protein  32.41 
 
 
300 aa  46.2  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  28.25 
 
 
314 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  27.27 
 
 
713 aa  46.2  0.0008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>