More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0317 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0317  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
471 aa  947  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0477765  normal  0.138289 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4890  histidine kinase  32.93 
 
 
465 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2528  histidine kinase  32.92 
 
 
475 aa  163  5e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00877701 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3845  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.65 
 
 
454 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.340802  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0881  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 
453 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.236572 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3137  histidine kinase  38.08 
 
 
469 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00554367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1392  sensor histidine kinase  32 
 
 
455 aa  159  1e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1604  sensor histidine kinase  32 
 
 
455 aa  158  2e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
488 aa  157  5e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3773  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
488 aa  157  5e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.996229 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1211  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.38 
 
 
461 aa  155  1e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  2.0096e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2739  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
449 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.479222  normal  0.0168851 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0252  ATPase domain-containing protein  33 
 
 
449 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00902295  hitchhiker  2.6524e-09 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1194  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
535 aa  154  3e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00846308  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3099  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.03 
 
 
461 aa  153  6e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  4.30471e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 
639 aa  153  6e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4461  histidine kinase  32.63 
 
 
452 aa  153  6e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1328  signal transduction histidine-protein kinase BaeS  31.03 
 
 
461 aa  153  6e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1749  sensor protein CpxA  31.58 
 
 
472 aa  153  7e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0671148  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0251  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
449 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00216243  hitchhiker  0.000495811 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
639 aa  152  1e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3770  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
449 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00735278  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0870  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 
469 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0562  sensor histidine kinase  28.31 
 
 
463 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2591  sensor protein RstB  33.75 
 
 
434 aa  152  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1570  sensor protein RstB  32.75 
 
 
433 aa  151  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0165885  normal  0.0828626 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4493  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.55 
 
 
458 aa  151  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.130131  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1351  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.68 
 
 
461 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0650  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
463 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1333  histidine kinase  34 
 
 
461 aa  150  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249082  normal  0.153676 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0718  sensor histidine kinase  27.59 
 
 
463 aa  150  4e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0617  sensor histidine kinase  28.62 
 
 
463 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0675  Signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
459 aa  150  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  4.58656e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0290  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.98 
 
 
639 aa  150  6e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.400694  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1639  sensor protein RstB  32.46 
 
 
433 aa  149  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.449501  normal  0.84146 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2702  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  34.29 
 
 
443 aa  149  1e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.118263 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1580  sensor protein RstB  32.46 
 
 
433 aa  149  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.118094  normal  0.442453 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1872  sensor protein RstB  32.16 
 
 
433 aa  149  1e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00123019  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3766  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
466 aa  148  2e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.120654 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4652  sensor histidine kinase  29.31 
 
 
463 aa  149  2e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00165985  unclonable  1.79315e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0707  sensor histidine kinase  27.5 
 
 
461 aa  148  2e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2320  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.2 
 
 
523 aa  148  2e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1703  sensor protein RstB  31.87 
 
 
436 aa  147  4e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0181104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1806  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
455 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4221  two-component sensor  33.22 
 
 
538 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1212  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 
535 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.111449  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3147  sensor histidine kinase  34.02 
 
 
478 aa  147  6e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0895878  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
463 aa  146  6e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0561  sensor histidine kinase  27.19 
 
 
462 aa  146  7e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3194  histidine kinase  34.4 
 
 
480 aa  146  7e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3274  histidine kinase  36.07 
 
 
465 aa  146  7e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000371883  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0686  sensor histidine kinase  27.65 
 
 
463 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.191562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49420  two-component sensor  34.6 
 
 
452 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0003153  normal  0.529806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4478  sensor protein CpxA  32.6 
 
 
449 aa  145  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
458 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00578995  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2021  signal transduction histidine kinase sensor  30.97 
 
 
561 aa  145  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.887772 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1182  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
535 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.955625  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0255  histidine kinase  30.77 
 
 
458 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.126812  decreased coverage  1.37847e-05 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3063  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  33.44 
 
 
433 aa  145  2e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9979  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1083  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
453 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.205423  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1740  sensor histidine kinase  34.75 
 
 
442 aa  145  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.187783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1891  histidine kinase  31.49 
 
 
508 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00129948  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0310  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 
466 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.445983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00536  putative sensor histidine kinase protein  33.9 
 
 
453 aa  144  3e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0193  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
426 aa  144  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2798  two-component sensor protein  31.51 
 
 
462 aa  144  4e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.1676  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4100  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 
477 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0212  histidine kinase  33.45 
 
 
408 aa  144  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0631257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0260  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
454 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.018475  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1009  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
455 aa  144  5e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0253  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 
458 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0323249  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0214  sensor histidine kinase  28.89 
 
 
455 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.178766  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0253  sensor histidine kinase  28.89 
 
 
455 aa  143  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16897e-16 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0464  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 
614 aa  143  6e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.778528  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4234  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
535 aa  143  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7582  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3645  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.34 
 
 
443 aa  143  8e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0765  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
438 aa  143  8e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.776621  normal  0.225366 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1817  sensor protein RstB  32.04 
 
 
433 aa  143  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0672231  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.24 
 
 
524 aa  142  9e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2034  histidine kinase  32.04 
 
 
433 aa  142  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0105815  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2752  sensor histidine kinase CpxA  31.43 
 
 
449 aa  142  9e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.10804e-08  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2260  histidine kinase  38.4 
 
 
471 aa  142  1e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.188662  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1320  histidine kinase  28.35 
 
 
457 aa  142  1e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000161164  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1955  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
484 aa  142  1e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000793353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4244  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
536 aa  142  1e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.484771  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0715  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
445 aa  142  1e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2324  histidine kinase  30.65 
 
 
561 aa  142  1e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00982982  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1902  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.48 
 
 
493 aa  142  2e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1314  sensor histidine kinase CpxA  31.43 
 
 
449 aa  141  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.20791e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3499  sensor kinase RpeA  33.66 
 
 
428 aa  141  2e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.106985  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1425  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
449 aa  141  2e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00554351  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1590  sensor protein RstB  31.72 
 
 
433 aa  142  2e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00520331  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2319  sensor protein RstB  31.72 
 
 
433 aa  141  2e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0220654  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0280  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
459 aa  141  2e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.34801e-06  unclonable  3.36351e-08 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3934  histidine kinase  32.43 
 
 
458 aa  141  2e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000220344  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0366  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
449 aa  141  3e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00215301  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0772  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 
457 aa  141  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0937198 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.76 
 
 
406 aa  140  4e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1229  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
396 aa  140  4e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.177188 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1006  histidine kinase  33.22 
 
 
503 aa  140  4e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.553516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>