109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0313 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  100 
 
 
887 aa  1712    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  54.55 
 
 
1383 aa  367  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  47.96 
 
 
1183 aa  354  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  52.86 
 
 
714 aa  351  3e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.36 
 
 
540 aa  328  3e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.3 
 
 
810 aa  325  3e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.41 
 
 
1126 aa  324  4e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.84 
 
 
1221 aa  320  6e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.27 
 
 
826 aa  313  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.11 
 
 
1507 aa  312  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  46.63 
 
 
1026 aa  311  4e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  49.72 
 
 
805 aa  310  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.24 
 
 
1130 aa  310  1.0000000000000001e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  43.72 
 
 
862 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.46 
 
 
408 aa  305  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  48.09 
 
 
1848 aa  305  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  50.48 
 
 
884 aa  304  5.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  48.55 
 
 
633 aa  303  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.59 
 
 
1607 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  36.48 
 
 
1292 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  46.26 
 
 
1176 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  46.78 
 
 
1178 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  39.04 
 
 
721 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  48.39 
 
 
462 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  46.59 
 
 
1195 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  46.79 
 
 
2802 aa  289  2e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  50.18 
 
 
1285 aa  285  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  45.4 
 
 
1176 aa  285  3.0000000000000004e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  47.37 
 
 
701 aa  283  1e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.32 
 
 
664 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  44.94 
 
 
1255 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  45.61 
 
 
920 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  47.77 
 
 
933 aa  266  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  42.31 
 
 
640 aa  259  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  42.64 
 
 
791 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  42.56 
 
 
3563 aa  232  3e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  43.65 
 
 
648 aa  227  7e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  45.19 
 
 
288 aa  216  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  41.78 
 
 
1083 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  33.22 
 
 
683 aa  137  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  34.18 
 
 
1672 aa  110  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  25.86 
 
 
2402 aa  110  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  30 
 
 
3544 aa  109  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  25.48 
 
 
1779 aa  105  5e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  29.89 
 
 
2522 aa  104  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3053  Ig family protein  31.35 
 
 
3244 aa  104  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  31.52 
 
 
1232 aa  103  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.67 
 
 
3699 aa  100  9e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  28.43 
 
 
3699 aa  99  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1197  PKD domain containing protein  30.92 
 
 
2079 aa  98.2  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.65 
 
 
1673 aa  97.8  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  28.29 
 
 
3542 aa  92  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  50 
 
 
14944 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  32.01 
 
 
1222 aa  80.5  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  33.49 
 
 
1879 aa  80.1  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  55.13 
 
 
1869 aa  77.8  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  27.19 
 
 
11716 aa  72.4  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0933  hypothetical protein  30.08 
 
 
2636 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  28.02 
 
 
3598 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7461  Ig family protein  38.89 
 
 
672 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1154  Ig family protein  41.44 
 
 
1991 aa  66.2  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.525003 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1999  immunoglobulin I-set domain-containing protein  31.07 
 
 
1362 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.354516  normal  0.677634 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2737  Ricin B lectin  39.38 
 
 
1148 aa  65.5  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.285354  normal  0.294912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  35.32 
 
 
3911 aa  61.6  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0496  Immunoglobulin I-set domain protein  39.56 
 
 
1550 aa  61.2  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0179971  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  38.51 
 
 
1394 aa  60.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4878  PKD domain containing protein  30.19 
 
 
1081 aa  59.3  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846856  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2052  Ig family protein  31.43 
 
 
2506 aa  59.3  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.504555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3739  outer membrane adhesin like proteiin  27.79 
 
 
4231 aa  58.9  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3550  Dystroglycan-type cadherin domain protein  27.2 
 
 
962 aa  57.4  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  47.19 
 
 
1969 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  26.92 
 
 
1544 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2887  Alpha-galactosidase  37.86 
 
 
658 aa  57  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00523951  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.67 
 
 
692 aa  55.5  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4374  Ig family protein  34.69 
 
 
731 aa  54.7  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.176149  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2167  YD repeat-containing protein  38.27 
 
 
2003 aa  54.7  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.154621 
 
 
-
 
NC_003296  RS04803  hypothetical protein  44.87 
 
 
441 aa  54.3  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.576008  normal  0.151498 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  39.51 
 
 
1030 aa  53.9  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0136  Ig family protein  36.05 
 
 
622 aa  54.3  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  37.8 
 
 
1100 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3220  Alpha-galactosidase  41.67 
 
 
535 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.528539  normal  0.253195 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6216  outer membrane adhesin like proteiin  28.31 
 
 
1728 aa  53.5  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0355107  normal  0.0464168 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  39 
 
 
815 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  30.32 
 
 
1626 aa  51.6  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2885  Alpha-galactosidase  40.48 
 
 
677 aa  51.6  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.14976  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3244  Immunoglobulin I-set domain protein  34.23 
 
 
532 aa  50.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000478897  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  37.8 
 
 
1132 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  44.44 
 
 
1976 aa  49.3  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  40.24 
 
 
972 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32 
 
 
618 aa  48.9  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  29.33 
 
 
2476 aa  48.5  0.0005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1839  Alpha-galactosidase  36.9 
 
 
535 aa  48.5  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0992  putative Vgr-related protein  39.78 
 
 
979 aa  48.5  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.3 
 
 
1343 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0715  Alpha-galactosidase  36 
 
 
532 aa  48.1  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1221  glucose/sorbosone dehydrogenase-related  37.78 
 
 
1657 aa  47  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.141757  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  34.95 
 
 
2375 aa  47.8  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0677  Ig family protein  45.33 
 
 
3222 aa  47.4  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5658  Ricin B lectin  49.15 
 
 
840 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.51688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2981  Ig family protein  27.94 
 
 
857 aa  46.6  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>