More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0227 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0227  ribosomal protein S10  100 
 
 		 102 aa  206  7e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0305  ribosomal protein S10  72.55 
 
 		 102 aa  160  7e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.33988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5071  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.755306 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3668  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1363  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.562313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2689  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.283235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2294  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.335659 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3449  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.852431 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3185  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.887844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1544  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1234  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.159706  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0985  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.547253  normal  0.0405609 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1955  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158653  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1839  30S ribosomal protein S10  67.65 
 
 		 102 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.051766  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1197  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  148  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.56445  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1678  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  149  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.196634  hitchhiker  0.0000449756 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2018  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1911  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.253834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1429  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0117668  normal  0.0108914 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1946  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1331  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  147  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.104333  normal  0.0980723 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1933  30S ribosomal protein S10  67.33 
 
 		 101 aa  147  4e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0278  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  146  7e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078248  unclonable  0.0000000940306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1907  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  146  9e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000187857  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0354  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  146  9e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.953045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1353  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.777643  normal  0.0177608 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2965  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.118126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0581  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1679  30S ribosomal protein S10  66.67 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00213683  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0697  ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  145  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000581864  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0665  ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  145  3e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000232715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0766  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  144  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.300244  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2161  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  144  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.589096 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1947  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  144  6e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2439  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  144  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.605965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3298  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  143  6e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000231204  hitchhiker  0.000170279 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2122  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  144  6e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.854148  normal  0.454228 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2951  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  143  6e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00000133875  hitchhiker  0.000000722255 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0404  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 102 aa  143  7.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000000016581  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3181  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000486821  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3339  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  142  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000104246  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3323  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  142  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.434875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2217  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.507157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2535  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.112296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1715  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.380329  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3444  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  142  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.000018475  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0707  ribosomal protein S10  66.33 
 
 		 101 aa  142  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00179336  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0360  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  142  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1796  SSU ribosomal protein S10P  65.69 
 
 		 104 aa  142  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.13057  normal  0.040484 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3020  30S ribosomal protein S10  63.37 
 
 		 104 aa  141  3e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000044729  hitchhiker  0.00550197 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1613  30S ribosomal protein S10  65.69 
 
 		 102 aa  141  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.215544 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1554  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 103 aa  141  3e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.0000633059  normal  0.961708 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2066  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 105 aa  140  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000145478  normal  0.204549 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0275  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 106 aa  140  6e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2735  ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.796099  normal  0.119445 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0245  30S ribosomal protein S10  63.73 
 
 		 104 aa  140  6e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.814405  normal  0.941593 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2819  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3865  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  140  6e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0052  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  139  9e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000149229  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0421  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  139  9e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000238297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2858  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.800784  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0625  30S ribosomal protein S10  64.71 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000558853  hitchhiker  0.0000000000000328358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1354  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  139  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.546745  normal  0.0408576 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0758  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 102 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.389687  normal  0.459809 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3645  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000000475308  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_002620  TC0720  30S ribosomal protein S10  68.69 
 
 		 105 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0939005  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3170  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000357931  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0326  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00113902  normal  0.0302801 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2633  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000272648  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0275  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000312385  normal  0.114579 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1766  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00000557802  normal  0.938375 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3747  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000000016598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3777  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000424797  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3446  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122515  normal  0.0314834 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2258  30S ribosomal protein S10  64.29 
 
 		 105 aa  138  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000323057  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0212  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000277123  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3069  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000998747  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0248  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127153  normal  0.202124 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0313  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000233009  normal  0.0207604 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0169  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000585443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0319  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0188597  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0183  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140291  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1225  30S ribosomal protein S10  65.66 
 
 		 123 aa  138  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00268366  unclonable  0.00000899576 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1923  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000013045  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2760  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000915461  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4691  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000838307  unclonable  0.0000000216996 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2841  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000513436  normal  0.19032 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3805  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  hitchhiker  0.00677019  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0266  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00303963  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4318  30S ribosomal protein S10  61.76 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000242072  unclonable  0.0000000000477389 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3477  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000483294  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0347  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0012099  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0230  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1248  30S ribosomal protein S10  59.8 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0157  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000255753  decreased coverage  0.0000448668 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0277  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0000127009  decreased coverage  0.000000000926134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0193  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000424599  decreased coverage  0.00027939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0147  ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000495355  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0390  30S ribosomal protein S10  60.78 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000705562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0198  30S ribosomal protein S10  62.75 
 
 		 103 aa  138  3e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000267319  hitchhiker  0.0000000013297 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>