More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0211 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0211  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
178 aa  350  8e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0928  50S ribosomal protein L6  56.74 
 
 
179 aa  202  1e-51  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000870536  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  183  9e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.44 
 
 
181 aa  182  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3652  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  181  6e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3169  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  180  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.351306  normal  0.462877 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  50.57 
 
 
178 aa  179  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2310  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 
177 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0792245  normal  0.18579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  54.4 
 
 
184 aa  178  4e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  49.43 
 
 
179 aa  177  5.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  177  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 
180 aa  176  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1780  50S ribosomal protein L6P  49.71 
 
 
177 aa  176  1e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0224285  normal  0.119374 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  51.41 
 
 
178 aa  176  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2049  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 
180 aa  175  4e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0140339  normal  0.441838 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  52 
 
 
177 aa  174  5e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3302  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  174  6e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.207153  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0199  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
176 aa  174  8e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586968  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3164  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  174  8e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000424619  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1931  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
177 aa  174  8e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.551471  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3004  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0215907  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1379  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  173  9.999999999999999e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.803766 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  49.43 
 
 
179 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1560  50S ribosomal protein L6  52.57 
 
 
177 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.269274  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 
181 aa  171  3.9999999999999995e-42  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0185  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000922994  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  46.86 
 
 
178 aa  171  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2935  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  171  5e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0214974  hitchhiker  0.00000101172 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  171  5e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  49.16 
 
 
180 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2751  ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  171  5.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.22493  normal  0.2065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2803  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  170  7.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.536694  normal  0.461526 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1264  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  170  9e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0989629  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  46.59 
 
 
179 aa  170  9e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 
180 aa  169  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  50.29 
 
 
177 aa  169  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0163  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  169  2e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000387746  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3282  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
177 aa  169  2e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000490691  hitchhiker  0.00000852439 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 
177 aa  169  3e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 
180 aa  168  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2281  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 
179 aa  169  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000000308698  hitchhiker  0.00356938 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 
179 aa  168  5e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000375197  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2408  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
179 aa  167  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000952005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2159  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  167  8e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000302064  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0228  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  167  9e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000431714  unclonable  0.00000804298 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
178 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 
179 aa  166  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
180 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1004  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  166  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00326754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
178 aa  166  1e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  44.89 
 
 
178 aa  166  1e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00953  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  166  1e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0734749  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
178 aa  166  2e-40  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0214  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
177 aa  165  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000010053  hitchhiker  0.00000000158568 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0512  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000124699  unclonable  0.0000000000161683 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0342  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
174 aa  165  2.9999999999999998e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.202734  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  46.02 
 
 
181 aa  165  2.9999999999999998e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000625305  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1969  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  46.59 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3053  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000512294  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16641  50S ribosomal protein L6  46.02 
 
 
179 aa  165  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0214  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000958159  unclonable  0.0000000000152518 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0209  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
177 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000225303  hitchhiker  0.00711343 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4675  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 
176 aa  164  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000105609  unclonable  0.00000000908127 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
179 aa  165  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  48.59 
 
 
179 aa  165  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3744  50S ribosomal protein L6  48 
 
 
177 aa  165  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000000640948  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0264  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 
176 aa  164  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000279479  hitchhiker  0.0041278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  45.45 
 
 
179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4261  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 
177 aa  164  6.9999999999999995e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000121964  unclonable  0.00000000000281926 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0304  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
179 aa  164  8e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.361286  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 
178 aa  164  8e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4302  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 
176 aa  164  8e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000025349  unclonable  0.0000000000636307 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0246  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 
177 aa  163  9e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5055  50S ribosomal protein L6  46.29 
 
 
177 aa  163  9e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.0037225  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001727  LSU ribosomal protein L6p (L9e)  48 
 
 
177 aa  163  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000194026  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00745  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
177 aa  163  9e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2981  50S ribosomal protein L6  47.43 
 
 
177 aa  163  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  46.29 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0862  50S ribosomal protein L6P  44.57 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0120235  hitchhiker  0.00179777 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
178 aa  163  1.0000000000000001e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0774  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  163  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.498464  normal  0.859655 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  47.16 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  45.45 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0716  50S ribosomal protein L6  47.73 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00767728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  45.45 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  45.71 
 
 
181 aa  162  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0382  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 
180 aa  162  3e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.95579  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0396  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 
177 aa  162  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0491976  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3462  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 
176 aa  162  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000287307  decreased coverage  0.00473222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1836  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 
179 aa  162  3e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.532668  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0388  50S ribosomal protein L6  46.86 
 
 
177 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000757352  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  45.2 
 
 
179 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0173  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 
176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000111848  decreased coverage  0.0000538106 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3731  50S ribosomal protein L6  45.71 
 
 
176 aa  161  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000218121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>