More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0175 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0175  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 
381 aa  787    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0276  queuine tRNA-ribosyltransferase  56.95 
 
 
377 aa  438  9.999999999999999e-123  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000356589  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 
369 aa  397  1e-109  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  54.74 
 
 
376 aa  398  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1428  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.17 
 
 
369 aa  392  1e-108  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00175971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.48 
 
 
368 aa  390  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1791  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 
370 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000378979  hitchhiker  0.00274251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3258  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 
368 aa  389  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000643926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
371 aa  381  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
368 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3622  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
372 aa  381  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00110996  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0382  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.84 
 
 
357 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1228  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 
369 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114064  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.01 
 
 
373 aa  376  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0911  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.19 
 
 
368 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8642e-32 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3335  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.19 
 
 
368 aa  375  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00131766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.94 
 
 
373 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.37 
 
 
375 aa  377  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.54 
 
 
379 aa  376  1e-103  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
373 aa  378  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.17 
 
 
370 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1203  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.91 
 
 
379 aa  373  1e-102  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.261953  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.03 
 
 
372 aa  374  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.46 
 
 
376 aa  373  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.64 
 
 
379 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.76 
 
 
371 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.64 
 
 
379 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.46 
 
 
376 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3870  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.26 
 
 
390 aa  368  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.550256 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  53.26 
 
 
355 aa  371  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.56 
 
 
370 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.23 
 
 
376 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1347  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.82 
 
 
372 aa  369  1e-101  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.49 
 
 
373 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.5 
 
 
370 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3143  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.26 
 
 
390 aa  367  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3438  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.67 
 
 
378 aa  365  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000261691  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3733  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.33 
 
 
375 aa  365  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812012  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0596  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.33 
 
 
390 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1330  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.42 
 
 
365 aa  364  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.442991  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.34 
 
 
387 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1756  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.93 
 
 
377 aa  363  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.185271  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0549  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 
390 aa  363  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.41 
 
 
367 aa  363  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.39 
 
 
391 aa  364  2e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.63 
 
 
372 aa  364  2e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4079  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.51 
 
 
376 aa  363  2e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.137728 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.01 
 
 
380 aa  363  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.35 
 
 
372 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 
399 aa  362  4e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.37 
 
 
367 aa  362  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0605  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.02 
 
 
395 aa  362  4e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1759  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.58 
 
 
377 aa  362  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.78 
 
 
370 aa  362  9e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4502  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000575969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4312  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000048864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4150  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000148017  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4161  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000310592  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4647  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000256565  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4551  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000170513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4497  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.83 
 
 
379 aa  361  1e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000628432 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0626  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.36 
 
 
405 aa  360  2e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2484  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.9 
 
 
373 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000370638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4536  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.55 
 
 
379 aa  360  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000578318  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.55 
 
 
379 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000227158  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4264  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.28 
 
 
379 aa  358  8e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000851523  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1430  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.28 
 
 
376 aa  357  9.999999999999999e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.143529  normal  0.876583 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.6 
 
 
367 aa  358  9.999999999999999e-98  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3134  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
379 aa  358  9.999999999999999e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.212476  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2017  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.44 
 
 
380 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000528319  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.74 
 
 
373 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.13 
 
 
377 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0466  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.45 
 
 
398 aa  357  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114256  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.8 
 
 
399 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.18 
 
 
392 aa  357  1.9999999999999998e-97  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  50 
 
 
395 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3359  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.06 
 
 
377 aa  356  5e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.142206  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.98 
 
 
370 aa  355  5.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.72 
 
 
369 aa  355  6.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.85 
 
 
374 aa  355  6.999999999999999e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
395 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1699  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.58 
 
 
382 aa  355  6.999999999999999e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4479  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.74 
 
 
390 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0710937 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
472 aa  355  7.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2542  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.15 
 
 
387 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.213207  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.27 
 
 
395 aa  354  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0045  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.85 
 
 
376 aa  354  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.642849  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.62 
 
 
379 aa  354  1e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1408  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.47 
 
 
387 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.971065  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
397 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
397 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1307  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.47 
 
 
387 aa  353  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
397 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.81 
 
 
375 aa  353  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
397 aa  353  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.73 
 
 
397 aa  353  4e-96  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2957  queuine tRNA-ribosyltransferase  52.07 
 
 
383 aa  353  4e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.38 
 
 
392 aa  352  5e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.34 
 
 
396 aa  352  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0930  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.42 
 
 
380 aa  352  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>