More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0104 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0104  peptidase S41  100 
 
 
389 aa  782    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2857  peptidase S41  31.97 
 
 
482 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0002  peptidase S41  28.9 
 
 
465 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.220655  hitchhiker  0.000027007 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1251  peptidase S41  31.11 
 
 
483 aa  126  6e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4807  peptidase S41  24.35 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0814  peptidase S41  24.64 
 
 
425 aa  113  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.411583  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1579  peptidase S41  26.87 
 
 
427 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603016 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  26.7 
 
 
431 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3153  peptidase S41  26.17 
 
 
1090 aa  106  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  25.75 
 
 
440 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1110  carboxyl-terminal protease  30.83 
 
 
535 aa  105  1e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00431691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1111  carboxyl-terminal protease  30.34 
 
 
533 aa  104  3e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0155619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2312  peptidase S41  26.4 
 
 
1082 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.481981  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2615  peptidase S41  27.13 
 
 
427 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  24.61 
 
 
447 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3650  carboxyl-terminal protease  24.08 
 
 
426 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000241587  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2310  peptidase S41  28.83 
 
 
1067 aa  101  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1119  peptidase S41  28.97 
 
 
432 aa  100  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0605  carboxyl-terminal protease  24.81 
 
 
413 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0620  carboxyl-terminal protease  24.81 
 
 
413 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210968  normal  0.919859 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1138  C-terminal processing peptidase-2  24.08 
 
 
412 aa  99  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00750441 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3957  peptidase S41  28.31 
 
 
457 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.604883  normal  0.196815 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1001  peptidase S41  29.96 
 
 
533 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.489176  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1002  peptidase S41  29.32 
 
 
535 aa  97.4  4e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2415  protease, putative  26.97 
 
 
1084 aa  97.4  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.779539  normal  0.819629 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2406  C-terminal processing peptidase-2  26.62 
 
 
434 aa  97.1  5e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.304858 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  25.34 
 
 
458 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  25.34 
 
 
458 aa  96.7  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3812  peptidase S41  26.85 
 
 
444 aa  96.7  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0205907  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3440  C-terminal processing peptidase-2  26.61 
 
 
417 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0509581  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  25.74 
 
 
409 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5025  carboxyl-terminal protease  25.33 
 
 
429 aa  94.4  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.849578 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4255  carboxyl-terminal protease  25.58 
 
 
430 aa  93.2  6e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1705  carboxyl-terminal protease  25.06 
 
 
413 aa  93.2  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.880099  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4901  carboxyl-terminal protease  24.24 
 
 
410 aa  93.2  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.972047 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4316  carboxyl-terminal protease  25.58 
 
 
430 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000068708  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0432  C-terminal processing peptidase-2  23.48 
 
 
428 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116039  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1420  carboxyl-terminal protease  26.46 
 
 
444 aa  92.4  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.14041  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  26.06 
 
 
446 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1102  carboxyl-terminal protease  23.67 
 
 
418 aa  92  2e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000689115  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  25.39 
 
 
427 aa  92  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  25.89 
 
 
394 aa  92  2e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2258  carboxyl-terminal protease  28.62 
 
 
421 aa  92  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0647499  unclonable  0.0000000459659 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4518  C-terminal processing peptidase-2  22.19 
 
 
430 aa  91.3  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03481  carboxyl-terminal protease  25.27 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5713  peptidase S41  25.74 
 
 
1097 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0183414 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14351  carboxyl-terminal processing protease  25.2 
 
 
453 aa  90.9  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  23.7 
 
 
423 aa  91.3  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03561  carboxyl-terminal protease  26.06 
 
 
429 aa  91.3  3e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.748457  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0618  carboxyl-terminal protease  27.07 
 
 
444 aa  90.9  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.982226  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0710  peptidase, S41 family  24.16 
 
 
438 aa  90.9  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02346  carboxy-terminal protease  27.6 
 
 
664 aa  90.1  5e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1234  peptidase S41  26.13 
 
 
1104 aa  90.1  6e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00254816  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3158  carboxyl-terminal protease  28.36 
 
 
433 aa  89.7  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0549247 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003431  tail-specific protease precursor  25.14 
 
 
668 aa  89.7  7e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00461835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2052  carboxyl-terminal protease  24.44 
 
 
416 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.774311 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  25.87 
 
 
1016 aa  89.4  9e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2935  peptidase S41  29.19 
 
 
691 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000791887  normal  0.0220512 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  26.07 
 
 
440 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  24.79 
 
 
407 aa  88.6  2e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3315  peptidase S41  24.74 
 
 
1097 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000987383 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0539  carboxyl-terminal protease  27.39 
 
 
444 aa  88.6  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.206911  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  24.65 
 
 
397 aa  87.8  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1161  peptidase S41  29.33 
 
 
415 aa  87.4  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.724073  decreased coverage  0.00200018 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13600  predicted protein  24.18 
 
 
389 aa  87  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.29725  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1853  carboxy-terminal protease  25.71 
 
 
671 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.535922  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2713  peptidase S41A, C-terminal protease  27.81 
 
 
457 aa  86.7  6e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  25.14 
 
 
434 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4927  peptidase S41  28.73 
 
 
416 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.966695 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03501  carboxyl-terminal protease  25.94 
 
 
428 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0492  peptidase S41A, C-terminal protease  26.38 
 
 
439 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4219  carboxyl-terminal protease  27.53 
 
 
401 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0351  peptidase S41  26.92 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1143  peptidase S41  25 
 
 
1093 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1214  peptidase S41  25 
 
 
1093 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.126026  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1144  peptidase S41  25 
 
 
1093 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00183878  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3207  peptidase S41  28.38 
 
 
692 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000881492  normal  0.0220331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2141  carboxy-terminal protease  25.71 
 
 
671 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0896  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
443 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000020194  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1232  peptidase S41  24.74 
 
 
1094 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000524055  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3808  carboxyl-terminal protease  27.46 
 
 
401 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.756218 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1276  peptidase S41  24.74 
 
 
1094 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000396794  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3081  peptidase S41  24.74 
 
 
1094 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00024555  hitchhiker  0.00566406 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0799  carboxyl-terminal protease  22.06 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1339  peptidase S41  25.81 
 
 
1094 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0115783  normal  0.655881 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_3061  predicted protein  25 
 
 
356 aa  84.3  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1215  peptidase S41  24.31 
 
 
1092 aa  84  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000736755  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0923  carboxyl-terminal protease  26.35 
 
 
428 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.315177  normal  0.478971 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2159  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
422 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.272376 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2868  carboxyl-terminal protease  22.48 
 
 
423 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.11568  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3411  protease, putative  24.74 
 
 
1094 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0820  carboxyl-terminal protease  26 
 
 
426 aa  83.2  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.00000170776  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0330  carboxyl-terminal protease  24.71 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0298  carboxyl-terminal protease  24.59 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1309  peptidase S41  24.74 
 
 
1094 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00413627  normal  0.677768 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
457 aa  83.2  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  25 
 
 
436 aa  82  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4589  peptidase S41  35.12 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2731  peptidase S41  24.49 
 
 
1094 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0131  peptidoglycan associated lipoprotein  26.47 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00102865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>