68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0088 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  504  9.999999999999999e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  32.69 
 
 
256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  31.73 
 
 
260 aa  113  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  30.49 
 
 
235 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  29.88 
 
 
242 aa  102  5e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  33.19 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  30.74 
 
 
242 aa  94  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  28.92 
 
 
235 aa  92.8  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  31.93 
 
 
242 aa  92  8e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  29.95 
 
 
240 aa  92  9e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  29.32 
 
 
770 aa  89  6e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  36.25 
 
 
235 aa  88.6  9e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  28.35 
 
 
241 aa  88.6  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  32.58 
 
 
235 aa  86.7  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  27.35 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  32.46 
 
 
240 aa  82.4  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  36 
 
 
287 aa  79.7  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  29.5 
 
 
244 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  29.75 
 
 
243 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  29.22 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  29.07 
 
 
244 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  35.45 
 
 
972 aa  76.6  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  31.95 
 
 
964 aa  75.5  0.0000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  31.63 
 
 
256 aa  75.1  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  28.42 
 
 
244 aa  73.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  24 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  27.67 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  29.75 
 
 
244 aa  72.4  0.000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  28.24 
 
 
244 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  28.42 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  27.85 
 
 
244 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  25.36 
 
 
270 aa  68.9  0.00000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  29.6 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  30.8 
 
 
234 aa  66.6  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  27.42 
 
 
247 aa  66.6  0.0000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  28.46 
 
 
977 aa  65.5  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  25.84 
 
 
260 aa  65.9  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  25.73 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  28.43 
 
 
242 aa  63.2  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 
267 aa  62.8  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  25.64 
 
 
248 aa  62  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  28.74 
 
 
244 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  27.23 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  24.8 
 
 
736 aa  58.9  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  31.33 
 
 
891 aa  56.6  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  27.69 
 
 
998 aa  56.2  0.0000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  27.42 
 
 
266 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  25.18 
 
 
748 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  26 
 
 
768 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  26.67 
 
 
767 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  28.5 
 
 
250 aa  50.8  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  29.5 
 
 
242 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  25 
 
 
254 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 
261 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.09 
 
 
247 aa  48.9  0.00008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  36.27 
 
 
384 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  30.37 
 
 
270 aa  47.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2484  ABC-2 type transporter  30.36 
 
 
371 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2863  ABC transporter, permease protein, putative  30.36 
 
 
371 aa  46.2  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.633584  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0718  hypothetical protein  26.55 
 
 
356 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0698  hypothetical protein  26.55 
 
 
374 aa  44.7  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  29.75 
 
 
379 aa  43.9  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  25.25 
 
 
278 aa  43.9  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  32.35 
 
 
384 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  27.5 
 
 
378 aa  42  0.009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  26.92 
 
 
370 aa  42  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  30.48 
 
 
384 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>