More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0083 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0083  gamma-glutamyl phosphate reductase  100 
 
 
425 aa  855    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.775503 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0953  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.7 
 
 
446 aa  426  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135756  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3598  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.31 
 
 
418 aa  425  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2579  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.73 
 
 
418 aa  421  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000246583  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0563  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.78 
 
 
418 aa  419  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0090  gamma-glutamyl phosphate reductase  54.61 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3508  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.83 
 
 
418 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000876636  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4131  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.95 
 
 
418 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000457014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3862  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
418 aa  410  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.332079 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3778  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.64 
 
 
418 aa  408  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0020576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3211  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.99 
 
 
418 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2884  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.59 
 
 
428 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2129  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.36 
 
 
434 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0315956 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1552  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.39 
 
 
418 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.554956  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3743  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
423 aa  405  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3644  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.07 
 
 
416 aa  402  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0817389  normal  0.521871 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0781  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
456 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2499  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.549579  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.41 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2450  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
423 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3199  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.36 
 
 
418 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000241705  unclonable  2.3922e-23 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2585  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
423 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000881796 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3412  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.41 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0367  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.41 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2637  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.41 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1226  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.41 
 
 
458 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0540  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.48 
 
 
418 aa  395  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2175  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.85 
 
 
418 aa  395  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.202609  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3447  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
423 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.928975  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2662  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.65 
 
 
418 aa  395  1e-109  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00209734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01930  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.94 
 
 
418 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2729  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
435 aa  396  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3208  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.42 
 
 
420 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.751856  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2276  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.25 
 
 
427 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616003  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0624  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
423 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0578  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
423 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.295302  normal  0.735276 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0674  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
441 aa  392  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0528  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.25 
 
 
429 aa  392  1e-108  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1644  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.7 
 
 
419 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1312  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.46 
 
 
411 aa  394  1e-108  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0695125  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0763  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.92 
 
 
423 aa  393  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.208576 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0552  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
423 aa  395  1e-108  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.468514  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3348  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  48.47 
 
 
423 aa  392  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00243599  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1741  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.61 
 
 
425 aa  391  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.542201  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
424 aa  389  1e-107  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1880  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.1 
 
 
430 aa  391  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2456  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.75 
 
 
418 aa  389  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.690341  normal  0.130366 
 
 
-
 
NC_004310  BR1843  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 
421 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.246188  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1776  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.42 
 
 
427 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0514  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.29 
 
 
421 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1214  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
423 aa  389  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.818935  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4584  gamma-glutamyl phosphate reductase  50 
 
 
436 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.792503 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1071  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.39 
 
 
425 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0174  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
423 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0657  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.54 
 
 
435 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.291837  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4447  gamma-glutamyl phosphate reductase  56.05 
 
 
423 aa  391  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0509531 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1169  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.08 
 
 
415 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0289018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1199  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.36 
 
 
425 aa  386  1e-106  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.30933  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1520  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.65 
 
 
414 aa  385  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3345  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.03 
 
 
435 aa  388  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000234228  normal  0.0212307 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2720  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
423 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.857443  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0269  gamma-glutamyl phosphate reductase  53.19 
 
 
429 aa  385  1e-106  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.303722  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2903  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.09 
 
 
415 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2079  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.5 
 
 
432 aa  385  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1607  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  47.42 
 
 
419 aa  387  1e-106  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2417  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.05 
 
 
418 aa  386  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00400511  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1099  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.15 
 
 
424 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1645  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.76 
 
 
431 aa  382  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.212287  hitchhiker  0.00108459 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1503  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.85 
 
 
419 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.690049  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2600  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.58 
 
 
415 aa  384  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0823147  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1870  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.59 
 
 
419 aa  382  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0481707  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1268  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.51 
 
 
409 aa  382  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2582  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.09 
 
 
415 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3802  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.12 
 
 
421 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1716  gamma-glutamyl phosphate reductase  45.56 
 
 
413 aa  383  1e-105  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00240  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.77 
 
 
417 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0188  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.75 
 
 
419 aa  379  1e-104  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.240991  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0288  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.01 
 
 
417 aa  380  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.619087  normal  0.592818 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00243  hypothetical protein  48.77 
 
 
417 aa  379  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2570  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.23 
 
 
426 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.968824 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12010  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.01 
 
 
421 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1675  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.24 
 
 
416 aa  380  1e-104  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3350  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.67 
 
 
422 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000409724 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0769  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.29 
 
 
417 aa  380  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0826655 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1102  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.01 
 
 
421 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0826689  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1303  gamma-glutamyl phosphate reductase  44.66 
 
 
415 aa  375  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0297  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.26 
 
 
417 aa  375  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000952781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7267  Glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  51.39 
 
 
429 aa  375  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0694677  normal  0.109566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0579  gamma-glutamyl phosphate reductase  51.77 
 
 
423 aa  378  1e-103  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1541  glutamate-5-semialdehyde dehydrogenase  50.35 
 
 
428 aa  378  1e-103  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0892613  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0235  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.21 
 
 
429 aa  377  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2980  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.75 
 
 
426 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.316248  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2671  gamma-glutamyl phosphate reductase  48.66 
 
 
417 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0425  gamma-glutamyl phosphate reductase  49.88 
 
 
437 aa  376  1e-103  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1056  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.04 
 
 
427 aa  376  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00342  gamma-glutamyl phosphate reductase  50.93 
 
 
414 aa  375  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0175641  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0217  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.32 
 
 
416 aa  376  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1194  gamma-glutamyl phosphate reductase  52.28 
 
 
420 aa  375  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0345  gamma-glutamyl phosphate reductase  46.79 
 
 
414 aa  377  1e-103  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3011  gamma-glutamyl phosphate reductase  47.16 
 
 
427 aa  376  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.61903  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>