64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0082 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 1300 aa  2513    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  30.03 
 
 		 3506 aa  154  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  29.91 
 
 		 2906 aa  131  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  29.9 
 
 		 2642 aa  125  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  29.16 
 
 		 2578 aa  109  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.17 
 
 		 3629 aa  108  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  27.72 
 
 		 1881 aa  105  4e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 		 1971 aa  105  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  26.77 
 
 		 1530 aa  99  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  29.64 
 
 		 2346 aa  92  7e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  33.05 
 
 		 3391 aa  89.4  4e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.27 
 
 		 3322 aa  85.9  0.000000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  28.73 
 
 		 2396 aa  85.5  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  32.35 
 
 		 994 aa  85.1  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  29.69 
 
 		 2365 aa  84.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  43.17 
 
 		 2926 aa  82.8  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 1571 aa  77.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  28.89 
 
 		 2711 aa  76.6  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.36 
 
 		 1227 aa  75.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  28.64 
 
 		 1882 aa  70.5  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  38.24 
 
 		 3415 aa  70.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  41.91 
 
 		 2407 aa  68.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 2366 aa  68.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  35.2 
 
 		 2003 aa  65.1  0.000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.36 
 
 		 1357 aa  64.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  29.47 
 
 		 1119 aa  62  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.82 
 
 		 1285 aa  61.6  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  29.58 
 
 		 4238 aa  61.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  39.07 
 
 		 3420 aa  61.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  34.87 
 
 		 861 aa  60.8  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.8 
 
 		 1029 aa  60.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  40.94 
 
 		 1078 aa  59.3  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  37.88 
 
 		 1113 aa  58.9  0.0000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  27.65 
 
 		 1806 aa  57  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  28.32 
 
 		 1782 aa  57.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  31.03 
 
 		 1180 aa  57.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  36.46 
 
 		 1093 aa  56.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  36.46 
 
 		 1093 aa  56.6  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.37 
 
 		 3089 aa  56.6  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.88 
 
 		 950 aa  56.2  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  28.23 
 
 		 1111 aa  55.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  26.97 
 
 		 1632 aa  55.5  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  36.53 
 
 		 4238 aa  54.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  36.53 
 
 		 3822 aa  54.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  32.44 
 
 		 1508 aa  53.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  26.84 
 
 		 1458 aa  52.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.87 
 
 		 1741 aa  50.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.48 
 
 		 1532 aa  50.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.24 
 
 		 1322 aa  50.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  30.71 
 
 		 1130 aa  49.7  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  27.67 
 
 		 550 aa  49.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  30.96 
 
 		 1861 aa  48.9  0.0007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.91 
 
 		 2057 aa  48.5  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.79 
 
 		 1081 aa  47.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  29.76 
 
 		 1459 aa  46.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  37.24 
 
 		 852 aa  46.2  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  27.96 
 
 		 2363 aa  46.2  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  32.5 
 
 		 1099 aa  46.2  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  54.39 
 
 		 1451 aa  46.2  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  29.92 
 
 		 1108 aa  45.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3319  autotransporter-associated beta strand repeat protein  52.17 
 
 		 634 aa  45.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.631506  normal  0.371955 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  41.94 
 
 		 1115 aa  45.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3064  autotransporter-associated beta strand repeat protein  56.1 
 
 		 634 aa  45.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.782614 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  39.13 
 
 		 2371 aa  45.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>