More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0064 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0064  response regulator receiver protein  100 
 
 		 137 aa  282  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.273047  normal  0.307579 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 		 934 aa  72  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1914  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.11 
 
 		 815 aa  68.6  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.979442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4410  virulence sensor protein BvgS  34.45 
 
 		 948 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.213714  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1259  sensory box sensor histidine kinase/response regulator VieS  35.09 
 
 		 1146 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4963  two-component sensor response receiver component, histidine kinase  34.13 
 
 		 1122 aa  67  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.341676 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3298  response regulator receiver protein  27.87 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0268  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 227 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.509377 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.15 
 
 		 921 aa  65.5  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2401  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 		 991 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3728  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 		 750 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4868  sensor histidine kinase/response regulator RetS  33.85 
 
 		 929 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0155  chemotaxis response regulator  29.57 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0203  chemotaxis response regulator  29.57 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.989482  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3079  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 480 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00177638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4408  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:histidine kinase:histidine kinase  33.85 
 
 		 929 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0237  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.235206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  34.45 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2852  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0255  response regulator receiver protein  27.64 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.308564  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4812  response regulator receiver protein  31.93 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00197217 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0672  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.4 
 
 		 770 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0164  response regulator receiver protein  28.69 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.498492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 907 aa  62.8  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.552072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 785 aa  62.4  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0611  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  33.08 
 
 		 925 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.62789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3357  response regulator receiver protein  28.46 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356565  normal  0.648001 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0754  response regulator receiver domain-containing protein  31.03 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0181  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1951  GAF sensor hybrid histidine kinase  45.61 
 
 		 603 aa  62.8  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0168  response regulator receiver protein  30.4 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1896  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.19 
 
 		 865 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0083  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.06 
 
 		 874 aa  61.6  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146368  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1961  CheA signal transduction histidine kinase  36.11 
 
 		 1057 aa  61.6  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 		 750 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1003  nitrogen regulation protein NR(I)  40.48 
 
 		 481 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.158383  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0611  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3051  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.318857  hitchhiker  0.00830995 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0223  PAS  32.81 
 
 		 1214 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4677  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  33.03 
 
 		 301 aa  60.8  0.000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2513  ATP-binding region, ATPase-like  32.5 
 
 		 945 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.543755  normal  0.160676 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0685  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 		 770 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000495863 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3814  response regulator receiver protein  32.52 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.466742  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.59 
 
 		 981 aa  60.5  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2142  chemotaxis protein cheY  32.43 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00069  two component sensor-regulator hybrid protein RpfC  30.08 
 
 		 718 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.397596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2035  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 		 750 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 2035 aa  59.7  0.00000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4952  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 317 aa  59.7  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4824  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 923 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.688381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2714  DNA-binding response regulator  38.55 
 
 		 228 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.462686  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1023  response regulator receiver modulated diguanylate phosphodiesterase  31.2 
 
 		 399 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0438319 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  44.44 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 		 877 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  41.67 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4614  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 923 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.863482  normal  0.296425 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4699  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 923 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.200679  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1398  response regulator receiver domain-containing protein  38.37 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.503734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2108  Hpt sensor hybrid histidine kinase  27.87 
 
 		 924 aa  59.3  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.154995  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3183  chemotaxis response regulator  31.82 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.258509  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  29.37 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  42.25 
 
 		 238 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4389  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 495 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.205713  normal  0.107293 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0118  response regulator receiver domain-containing protein  29.17 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3816  response regulator receiver protein  29.17 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4423  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.94 
 
 		 1361 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.498632 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3680  response regulator receiver domain-containing protein  31.97 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.383377  normal  0.047176 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  31.36 
 
 		 529 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1536  response regulator receiver protein  29.41 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0284047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.79 
 
 		 1509 aa  58.9  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4877  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 		 923 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.876139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  42.25 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2860  chemotaxis response regulator  31.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1703  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.24 
 
 		 1408 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.433463  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3115  chemotaxis response regulator  31.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0078  chemotaxis two-component response regulator CheY1  31.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3436  chemotaxis response regulator  31.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.487873  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3937  chemotaxis protein CheY  31.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.450944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2758  response regulator receiver domain-containing protein  36.94 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04710  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0584  chemotaxis signal transduction protein CheY  31.58 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3108  response regulator receiver domain-containing protein  31.53 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0706  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.84 
 
 		 928 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357941  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0893  diguanylate cyclase  36.97 
 
 		 566 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3856  chemotaxis protein CheY  31.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.119201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  43.06 
 
 		 237 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2507  response regulator receiver protein  32.11 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  30.7 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1683  chemotaxis response regulator  31.82 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.058459  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2975  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000459905 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  42.67 
 
 		 808 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0907  CheA signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 911 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0908129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3730  response regulator receiver protein  31.75 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.44 
 
 		 776 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0581  chemotaxis response regulator  28.1 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1192  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.71 
 
 		 912 aa  58.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>