224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0057 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0057  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 449 aa  888    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.616267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3063  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  25.34 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.576257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3377  ABC-2 type transporter  27.64 
 
 		 440 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.163163 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  26.98 
 
 		 413 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1890  ABC-2 type transporter  23.01 
 
 		 414 aa  92.4  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.394039  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.24 
 
 		 380 aa  90.9  4e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1095  ABC-2 type transporter  20.32 
 
 		 427 aa  90.9  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5035  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 402 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4131  ABC-2 type transporter  33.17 
 
 		 396 aa  84.7  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24313 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0495  ABC-2 type transporter  26.79 
 
 		 365 aa  79.3  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3438  ABC-2 type transporter  26.18 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0748672 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3634  ABC-2 type transporter  25.66 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135402  normal  0.0306752 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1709  ABC-2 type transporter  24.38 
 
 		 407 aa  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0615816  normal  0.147772 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3747  ABC-2 type transporter  25.62 
 
 		 403 aa  77  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.359711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4703  ABC-2 type transporter  22.3 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1867  hypothetical protein  22.88 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.205494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0165  hypothetical protein  27.46 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0147217  normal  0.470058 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3534  hypothetical protein  23.28 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1806  hypothetical protein  23.11 
 
 		 381 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1660  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 		 381 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102355  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_460  ABC-type transport system, permease component  23.44 
 
 		 365 aa  72.8  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.185192  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10200  ABC-type multidrug transport system, permease component  31.76 
 
 		 257 aa  72.8  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0158104  normal  0.0492855 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0131  ABC-2 type transporter  26.6 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0390339  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0519  ABC transporter, permease protein, putative  26.79 
 
 		 365 aa  71.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.180275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1917  hypothetical protein  23.11 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4114  ABC-2 type transporter  26.19 
 
 		 437 aa  71.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1610  multidrug ABC transporter, permease  21.85 
 
 		 381 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.476781  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  25.24 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  25.56 
 
 		 360 aa  68.6  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0216  ABC-2 type transporter  19.54 
 
 		 398 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.316621  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  25 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  25.13 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9333  hypothetical protein  29.14 
 
 		 244 aa  67.4  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.312033 
 
 
-
 
NC_002936  DET0795  ABC transporter, permease protein  23.81 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0125503  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 384 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4702  ABC-2 type transporter  32.76 
 
 		 397 aa  67  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.595604  normal  0.45539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29670  ABC-type multidrug transport system, permease component  22.77 
 
 		 396 aa  66.2  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.347708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  26.2 
 
 		 368 aa  65.9  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  28.37 
 
 		 380 aa  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0386  ABC transporter, permease component  19.73 
 
 		 428 aa  66.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.246762  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  25.79 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 384 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6846  ABC-2 type transporter  20.51 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5132  ABC-2 type transporter  26.14 
 
 		 358 aa  63.9  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.033585  normal  0.150856 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0425  ABC-2 type transporter  24.19 
 
 		 366 aa  63.9  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1790  ABC-2 transporter component  26.15 
 
 		 371 aa  63.5  0.000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.10213  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0275  ABC-2 type transporter  31.98 
 
 		 231 aa  63.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  24.16 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3153  ABC-2 type transporter  23.65 
 
 		 395 aa  63.2  0.000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128052 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  27.87 
 
 		 378 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 388 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  24 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1663  hypothetical protein  20.51 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0766835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1641  multidrug ABC transporter, permease  20.51 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000991751  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1795  hypothetical protein  20.51 
 
 		 380 aa  62  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4363  ABC-2 type transporter  25.86 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0057  ABC-2 type transporter  26.67 
 
 		 387 aa  62.4  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2056  export ABC transporter permease protein  26.29 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00520961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0698  putative transmembrane protein  29.71 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2479  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 376 aa  61.2  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.664004  normal  0.270232 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  26.32 
 
 		 370 aa  60.8  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1843  hypothetical protein  20.51 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0585  ABC-2 type transporter  24.49 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000556211 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0406  ABC-2 type transporter  28.14 
 
 		 279 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0129272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2573  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2640  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 373 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2748  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4230  ABC-2 type transporter  24.39 
 
 		 375 aa  58.9  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2831  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.335891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1524  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1422  ABC-2 type transporter  24.6 
 
 		 373 aa  58.9  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1515  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1551  ABC-2 type transporter  25.13 
 
 		 373 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3454  hypothetical protein  21.63 
 
 		 374 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.206797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1063  ABC-2 type transporter  20.63 
 
 		 381 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3548  ABC transporter protein  28.47 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.705683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3574  ABC-2 type transporter  28.97 
 
 		 443 aa  57.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  24.06 
 
 		 376 aa  57  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  24 
 
 		 369 aa  56.6  0.0000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0481  ABC-2 type transporter  35.71 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5801  ABC-2 type transporter  21.78 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552117  normal  0.846192 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3319  ABC-2 type transporter  34.15 
 
 		 267 aa  55.8  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1082  ABC-2 type transport system permease protein  25.6 
 
 		 378 aa  56.6  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2358  ABC-2 type transporter  25.99 
 
 		 376 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0656  hypothetical protein  23.89 
 
 		 377 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  24.61 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0216  ABC-2 type transporter  28.49 
 
 		 257 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.692272 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  25.3 
 
 		 370 aa  56.6  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1707  ABC transporter, permease protein, putative  22.99 
 
 		 373 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3539  ABC-2 type transporter  25.36 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3587  ABC transporter, permease protein, putative  29.75 
 
 		 375 aa  55.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3253  ABC-2 type transporter  24.11 
 
 		 369 aa  55.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0790326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1490  ABC-2 type transporter  27.93 
 
 		 384 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.726724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.89 
 
 		 371 aa  54.7  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3040  hypothetical protein  26.44 
 
 		 371 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0504  ABC-2 type transporter  23.21 
 
 		 368 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0820778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3970  hypothetical protein  28.5 
 
 		 383 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  24.72 
 
 		 370 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1781  ABC transporter, inner membrane subunit  23.44 
 
 		 365 aa  53.9  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1589  ABC-2 type transporter  22.02 
 
 		 369 aa  53.9  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.548124  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>