More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0052 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1895  CTP synthetase  59.74 
 
 		 536 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1610  CTP synthetase  55.82 
 
 		 542 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.103111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4305  CTP synthetase  59.96 
 
 		 555 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0563  CTP synthetase  57.82 
 
 		 547 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2785  CTP synthetase  59.29 
 
 		 538 aa  652    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.963897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2613  CTP synthetase  59.96 
 
 		 533 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1607  CTP synthetase  58.23 
 
 		 546 aa  642    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.353292 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0546  CTP synthetase  58 
 
 		 547 aa  645    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2304  CTP synthetase  61.44 
 
 		 533 aa  660    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0258787  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1600  CTP synthetase  60.34 
 
 		 533 aa  642    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1945  CTP synthetase  58.98 
 
 		 534 aa  678    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000498786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0291  CTP synthetase  58.25 
 
 		 534 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1276  CTP synthetase  60.15 
 
 		 538 aa  661    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000541143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2409  CTP synthetase  60.34 
 
 		 537 aa  657    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4174  CTP synthetase  59.77 
 
 		 555 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0051  CTP synthetase  59.85 
 
 		 547 aa  646    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1164  CTP synthetase  55.82 
 
 		 542 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2751  CTP synthase  56.27 
 
 		 555 aa  639    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0184273 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1250  CTP synthase  58.6 
 
 		 530 aa  644    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0052  CTP synthetase  100 
 
 		 554 aa  1139    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.431062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4167  CTP synthetase  55.82 
 
 		 542 aa  638    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18060  CTP synthetase  58.65 
 
 		 535 aa  636    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2180  CTP synthetase  58.92 
 
 		 540 aa  658    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0078  CTP synthetase  59.85 
 
 		 541 aa  659    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1841  CTP synthetase  57.41 
 
 		 540 aa  639    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.41222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1923  CTP synthetase  59.89 
 
 		 542 aa  658    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0447943  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4064  CTP synthetase  55.82 
 
 		 542 aa  635    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000300969 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1716  CTP synthase  59.13 
 
 		 545 aa  642    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4327  CTP synthetase  59.77 
 
 		 555 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0170  CTP synthetase  63.21 
 
 		 535 aa  708    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.357981 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4318  CTP synthetase  60.22 
 
 		 555 aa  663    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13902 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3859  CTP synthetase  57.66 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5468  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  632  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516404  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5187  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537125  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5022  CTP synthetase  57.39 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5038  CTP synthetase  57.39 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483501  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3337  CTP synthetase  57.55 
 
 		 531 aa  632  1e-180  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5516  CTP synthetase  57.39 
 
 		 535 aa  633  1e-180  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00176439  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5491  CTP synthetase  57.39 
 
 		 535 aa  631  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000497505  unclonable  2.37661e-25 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1119  CTP synthetase  55.47 
 
 		 543 aa  632  1e-180  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1743  CTP synthetase  57.36 
 
 		 534 aa  631  1e-180  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5583  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  632  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.426963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5431  CTP synthetase  57.39 
 
 		 535 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.6711200000000003e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2979  CTP synthetase  59.58 
 
 		 534 aa  634  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.535852  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5136  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  632  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2418  CTP synthetase  57.01 
 
 		 542 aa  631  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00522161  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1182  CTP synthetase  56.88 
 
 		 547 aa  632  1e-180  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.154303  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3181  CTP synthetase  56.39 
 
 		 533 aa  633  1e-180  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000127982  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1762  CTP synthetase  56.64 
 
 		 533 aa  630  1e-179  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.55526  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5461  CTP synthetase  57.2 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4844  CTP synthetase  57.01 
 
 		 532 aa  630  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00361153  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1954  CTP synthetase  57.77 
 
 		 546 aa  629  1e-179  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2034  CTP synthetase  56.44 
 
 		 558 aa  628  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3670  CTP synthetase  57.68 
 
 		 558 aa  629  1e-179  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2472  CTP synthetase  57.84 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2182  CTP synthetase  57.84 
 
 		 535 aa  630  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0919  CTP synthetase  55.64 
 
 		 542 aa  629  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3446  CTP synthetase  57.09 
 
 		 531 aa  629  1e-179  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1184  CTP synthetase  58.91 
 
 		 546 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0154566  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2267  CTP synthetase  57.36 
 
 		 545 aa  625  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2887  CTP synthetase  57.74 
 
 		 537 aa  625  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.691762 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1727  CTP synthetase  58.57 
 
 		 535 aa  625  1e-178  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0701  CTP synthetase  56.26 
 
 		 533 aa  627  1e-178  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.202095  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1563  CTP synthetase  56.12 
 
 		 534 aa  627  1e-178  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0141  CTP synthetase  56.45 
 
 		 533 aa  625  1e-178  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.226323  normal  0.0230809 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0230  CTP synthetase  57.82 
 
 		 534 aa  625  1e-178  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000181921  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1911  CTP synthetase  55.54 
 
 		 542 aa  626  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.884152  normal  0.767011 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0054  CTP synthetase  58.11 
 
 		 536 aa  625  1e-178  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000543339  hitchhiker  0.00121166 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4054  CTP synthase  57.39 
 
 		 545 aa  622  1e-177  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.384479  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1661  CTP synthetase  57.04 
 
 		 550 aa  622  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1289  CTP synthetase  57.97 
 
 		 545 aa  622  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.934915  hitchhiker  0.00000000280114 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1552  CTP synthase  55.29 
 
 		 543 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.873983  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1361  CTP synthetase  55.47 
 
 		 543 aa  624  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0802006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1262  CTP synthetase  55.91 
 
 		 543 aa  624  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3035  CTP synthetase  55.12 
 
 		 543 aa  622  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0036123 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1502  CTP synthetase  55.41 
 
 		 542 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17290  CTP synthetase  55.41 
 
 		 542 aa  624  1e-177  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2366  CTP synthetase  54.5 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.863535  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2515  CTP synthetase  56.77 
 
 		 546 aa  620  1e-176  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000298041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1448  CTP synthetase  56.72 
 
 		 551 aa  620  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38964  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1093  CTP synthetase  55.83 
 
 		 533 aa  620  1e-176  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38810  CTP synthetase  54.75 
 
 		 543 aa  620  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2075  CTP synthetase  55.58 
 
 		 557 aa  620  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.138589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1614  CTP synthetase  57.36 
 
 		 535 aa  620  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.23037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1035  CTP synthetase  58.72 
 
 		 545 aa  620  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.946581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2586  CTP synthetase  56.42 
 
 		 538 aa  617  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0528943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2963  CTP synthetase  56.66 
 
 		 555 aa  615  1e-175  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000435948  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0817  CTP synthetase  56.47 
 
 		 545 aa  616  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.351659  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2026  CTP synthetase  56.77 
 
 		 545 aa  618  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000406175  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1892  CTP synthetase  57.56 
 
 		 553 aa  615  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3546  CTP synthetase  56.47 
 
 		 545 aa  615  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.319246  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3115  CTP synthetase  55.91 
 
 		 557 aa  616  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000124409  hitchhiker  0.00148298 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1872  CTP synthetase  56.1 
 
 		 555 aa  617  1e-175  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1195  CTP synthetase  57.33 
 
 		 545 aa  615  1e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.111429  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1439  CTP synthetase  56.07 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0767506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2536  CTP synthetase  56.74 
 
 		 539 aa  618  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1051  CTP synthetase  58.05 
 
 		 545 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333074  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03526  CTP synthetase  56.59 
 
 		 546 aa  615  1e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1204  CTP synthetase  57.38 
 
 		 545 aa  615  1e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000204322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0899  CTP synthetase  57.46 
 
 		 558 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.995561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>