More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0032 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0032  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  100 
 
 
664 aa  1327    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.468114  decreased coverage  0.00512066 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4610  glycoside hydrolase family protein  47.86 
 
 
721 aa  350  4e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4304  hypothetical protein  50.54 
 
 
920 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.126578  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1618  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.75 
 
 
540 aa  342  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.490097  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4616  immunoglobulin I-set domain-containing protein  50.79 
 
 
408 aa  336  7e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0797  immunoglobulin I-set domain-containing protein  49.21 
 
 
826 aa  334  3e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.431236  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3823  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  44.69 
 
 
1255 aa  332  1e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816549  normal  0.385041 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4612  immunoglobulin I-set domain-containing protein  48.3 
 
 
714 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.830673  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2120  fibronectin type III domain-containing protein  46.04 
 
 
1178 aa  322  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.348152  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  46.67 
 
 
1026 aa  316  9.999999999999999e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4126  hypothetical protein  48.8 
 
 
640 aa  311  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.657356  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0031  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase  46.58 
 
 
701 aa  295  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0166776 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2042  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.48 
 
 
805 aa  292  2e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.218324 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  46.8 
 
 
2802 aa  290  6e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0313  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.44 
 
 
887 aa  286  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.488254  normal  0.343901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  45.84 
 
 
810 aa  285  1.0000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  44.12 
 
 
1383 aa  283  7.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  45.48 
 
 
633 aa  282  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1253  peptidase C10 streptopain  41.09 
 
 
884 aa  277  4e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.662646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  44.09 
 
 
1607 aa  277  5e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.04 
 
 
1848 aa  274  3e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1394  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.88 
 
 
1126 aa  273  8.000000000000001e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2256  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.36 
 
 
1183 aa  268  2e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0104124 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  43.32 
 
 
1507 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0327  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.69 
 
 
1221 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.495752  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  40.05 
 
 
1292 aa  258  3e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  40.57 
 
 
1130 aa  256  8e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  40 
 
 
3563 aa  255  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  40.92 
 
 
1195 aa  241  2.9999999999999997e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0853  hypothetical protein  36.19 
 
 
1176 aa  239  1e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0561524  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0638  PKD domain-containing protein  47.4 
 
 
1285 aa  235  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3660  peptidase S41  38.57 
 
 
791 aa  234  3e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.120532  normal  0.922939 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0852  immunoglobulin I-set domain-containing protein  38.37 
 
 
1176 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3163  beta-lactamase  38.73 
 
 
862 aa  217  5e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111664  normal  0.813914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3151  beta-lactamase  39.44 
 
 
933 aa  200  6e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0651  hypothetical protein  36.69 
 
 
462 aa  189  1e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.168362  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3371  GDSL family lipase  37.54 
 
 
648 aa  179  1e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754827  normal  0.777259 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0346  hypothetical protein  39.44 
 
 
288 aa  176  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0253  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  46.7 
 
 
279 aa  150  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0866934  normal  0.441111 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1023  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50 
 
 
260 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  39.34 
 
 
1083 aa  140  7.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1403  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  32.84 
 
 
595 aa  117  5e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0643  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A  46.92 
 
 
290 aa  113  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03214  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  46.38 
 
 
190 aa  111  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.244491  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03166  hypothetical protein  46.38 
 
 
190 aa  111  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.366103  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3669  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  46.38 
 
 
190 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3669  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  46.38 
 
 
190 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.085019  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01021  hypothetical protein  36.62 
 
 
595 aa  110  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.273299 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3742  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  46.38 
 
 
190 aa  110  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0280812 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3777  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  46.38 
 
 
190 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.796351 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3840  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  46.38 
 
 
190 aa  110  9.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.740676  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3832  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  45.65 
 
 
190 aa  109  2e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0349  Peptidylprolyl isomerase  45.65 
 
 
190 aa  109  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4673  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  45.65 
 
 
190 aa  109  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.427116 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3738  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  45.65 
 
 
190 aa  109  2e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3559  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  45.65 
 
 
190 aa  109  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.878909  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3644  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  45.65 
 
 
190 aa  109  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.899987  hitchhiker  0.0000271496 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0349  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  45.65 
 
 
190 aa  109  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0922  peptidylprolyl isomerase  45.45 
 
 
209 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.216688  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1939  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A  43.92 
 
 
208 aa  107  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0746  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45.27 
 
 
191 aa  106  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.407837  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2547  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  42.76 
 
 
191 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1658  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A  43.24 
 
 
191 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0120817  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2683  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A precursor  43.24 
 
 
191 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.208532  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2598  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin-type  43.24 
 
 
191 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.188705  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2161  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A  43.24 
 
 
191 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3154  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A  43.24 
 
 
191 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1434  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A  43.24 
 
 
191 aa  105  3e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4051  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.15 
 
 
192 aa  104  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1884  peptidylprolyl isomerase  45.52 
 
 
207 aa  105  4e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1201  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.25 
 
 
191 aa  105  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0896861 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3111  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  38.14 
 
 
219 aa  104  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2424  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  45.32 
 
 
203 aa  104  5e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.025157  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4541  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A  42.86 
 
 
185 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1349  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  42.86 
 
 
185 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.418656  normal  0.161831 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2047  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  40.97 
 
 
219 aa  103  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0814057  normal  0.454375 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1073  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  41.86 
 
 
191 aa  103  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.626374  normal  0.148013 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0268  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  42.76 
 
 
191 aa  103  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.389525  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0664  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  42.07 
 
 
171 aa  103  1e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000119398  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19090  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  43.75 
 
 
184 aa  103  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.456758  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0346  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  45.11 
 
 
190 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0693  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  42.07 
 
 
171 aa  102  2e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000520477  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0508  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  40.26 
 
 
199 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3835  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.86 
 
 
185 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.537295 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3965  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.84 
 
 
192 aa  102  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000414248  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3319  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A  41.61 
 
 
198 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0813  peptidylprolyl isomerase  40.69 
 
 
194 aa  102  3e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000375711  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4048  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.86 
 
 
185 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3790  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase A (rotamase A)  43.48 
 
 
190 aa  102  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00509615 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1294  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45.93 
 
 
184 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.81534 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2115  peptidylprolyl isomerase  39.24 
 
 
191 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1428  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.53 
 
 
187 aa  101  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.348391  normal  0.155775 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2868  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  44.27 
 
 
169 aa  101  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.552255 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1624  peptidylprolyl isomerase  43.75 
 
 
193 aa  101  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.671491  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1985  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  39.35 
 
 
191 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.659579  normal  0.529934 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4229  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  43.51 
 
 
168 aa  101  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1891  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  39.88 
 
 
183 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2512  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  43.06 
 
 
193 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0168533  hitchhiker  0.00023497 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3826  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  45 
 
 
187 aa  100  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.648801  hitchhiker  0.00409126 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1392  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase cyclophilin type  42.36 
 
 
193 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00476468 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>