More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0024 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0024  ABC transporter related  100 
 
 		 221 aa  452  1.0000000000000001e-126  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.247291  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4898  ABC transporter related  63.64 
 
 		 220 aa  292  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0131171  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1201  ABC transporter related protein  63.01 
 
 		 228 aa  289  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0961  ABC transporter related  62.27 
 
 		 220 aa  288  6e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000589963  normal  0.143962 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0372  ABC transporter, ATPase subunit  64.55 
 
 		 236 aa  288  6e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.473605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  50.91 
 
 		 225 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  49.55 
 
 		 225 aa  218  6e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  47.73 
 
 		 229 aa  216  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  47.96 
 
 		 238 aa  210  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  46.12 
 
 		 238 aa  209  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  47.73 
 
 		 220 aa  208  5e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  49.55 
 
 		 220 aa  207  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  47.96 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1083  ABC transporter related  44.34 
 
 		 240 aa  204  8e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 230 aa  203  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2042  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 		 236 aa  203  2e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0308  ABC transporter ATP-binding protein  47.06 
 
 		 237 aa  202  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0332817 
 
 
-
 
NC_002950  PG0685  ABC transporter, ATP-binding protein  47.95 
 
 		 219 aa  201  6e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246956 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0471  ABC transporter related  46.82 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1330  ABC transporter related  46.12 
 
 		 235 aa  200  9.999999999999999e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.514657  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3186  ABC transporter related  44.75 
 
 		 252 aa  198  5e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1792  ABC transporter, ATP-binding protein  43.05 
 
 		 233 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3708  ABC transporter-related protein  44.29 
 
 		 254 aa  198  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00747361 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2478  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 222 aa  198  7e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.866087  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  44.55 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0015  ABC transporter, ATP-binding protein  44.75 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3004  ABC transporter ATP-binding protein  46.12 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000190264  hitchhiker  0.00000432285 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2576  ABC transporter related  46.12 
 
 		 222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2054  ABC transporter related protein  47.27 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.198062  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  45.66 
 
 		 277 aa  195  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_002950  PG0282  ABC transporter, ATP-binding protein  44.91 
 
 		 223 aa  195  5.000000000000001e-49  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2972  ABC transporter-like protein  43.38 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0741  ABC transporter related  48.4 
 
 		 228 aa  194  7e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00469755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  44.09 
 
 		 230 aa  194  9e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000435089  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3020  ABC transporter related  45.25 
 
 		 233 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0897255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3549  ABC transporter related  43.84 
 
 		 255 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  44.84 
 
 		 240 aa  192  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  45.25 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4416  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 244 aa  192  3e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1979  transporter  45.45 
 
 		 227 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  43.89 
 
 		 247 aa  191  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2991  ABC transporter related  43.18 
 
 		 246 aa  192  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1725  ABC transporter related protein  44.29 
 
 		 236 aa  191  6e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000108052  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0036  ABC transporter related  40.45 
 
 		 232 aa  191  9e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00248641  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  44.34 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  42.86 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1341  ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 234 aa  190  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1360  ABC transporter, ATP-binding protein  45 
 
 		 236 aa  190  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00540247  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3692  ABC transporter, ATP-binding protein  42.27 
 
 		 246 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  42.99 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2864  ABC transporter related  41.82 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2313  ABC transporter related  45.66 
 
 		 256 aa  189  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2824  ABC transporter related  45.66 
 
 		 256 aa  189  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.715212  normal  0.546422 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  43.44 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2055  ABC transporter related  42.92 
 
 		 222 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000459409 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0384  ABC transporter related protein  44.55 
 
 		 237 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  44.29 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2150  ABC transporter related  42.92 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.548805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1813  ABC transporter related  42.27 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1031  ABC transporter related  42.27 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  42.99 
 
 		 239 aa  188  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3364  ABC transporter related  41.36 
 
 		 243 aa  188  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3865  hypothetical protein  45.25 
 
 		 233 aa  189  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.255505  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2850  ABC transporter related  41.82 
 
 		 240 aa  189  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0863  ABC transporter related  42.27 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3159  ABC transporter related  42.27 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3260  ABC transporter related  42.27 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1019  ABC transporter related  42.27 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3341  ABC transporter related  42.27 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0095  ABC transporter related  42.99 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0998  ABC transporter related  42.27 
 
 		 247 aa  188  5e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1041  ABC transporter related  43.44 
 
 		 251 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3722  ABC transporter related  41.36 
 
 		 263 aa  188  7e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.323053 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0898  ABC transporter related  41.82 
 
 		 232 aa  188  7e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  44.34 
 
 		 225 aa  187  8e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3917  ABC transporter related  43.38 
 
 		 232 aa  187  8e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0723  ABC transporter-related protein  41.36 
 
 		 240 aa  187  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0781  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 238 aa  187  1e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000706757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  42.86 
 
 		 235 aa  187  1e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1128  ABC transporter related  42.53 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3374  ABC efflux transporter, ATPase subunit  47.52 
 
 		 211 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2167  ABC transporter related protein  42.92 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 229 aa  186  3e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2202  ABC transporter related protein  43.44 
 
 		 241 aa  185  6e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.87291  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  42.47 
 
 		 230 aa  184  6e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  43.89 
 
 		 242 aa  184  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2025  ABC transporter related  43.44 
 
 		 241 aa  184  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000164483 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 228 aa  184  7e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2199  ABC transporter, ATP-binding protein  44.09 
 
 		 221 aa  184  8e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.517578  hitchhiker  0.0000000011345 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8342  ABC transporter related  43.93 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  44.75 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  44.75 
 
 		 234 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  44.84 
 
 		 657 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  43.44 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4072  ABC transporter related  40.45 
 
 		 253 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2919  ABC transporter related  43.84 
 
 		 256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.388484 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  43.69 
 
 		 226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1530  ABC transporter related  42.53 
 
 		 224 aa  183  2.0000000000000003e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0701501 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3501  ABC transporter related  40.91 
 
 		 241 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.667044 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>