More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0021 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0021  permease  100 
 
 		 861 aa  1711    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0686049  normal  0.167334 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1899  permease  42.97 
 
 		 848 aa  572  1.0000000000000001e-162  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1886  permease  39.1 
 
 		 844 aa  501  1e-140  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1878  permease  33.72 
 
 		 817 aa  381  1e-104  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.159783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3459  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.91 
 
 		 817 aa  369  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0129037 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2047  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.18 
 
 		 882 aa  360  9e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1368  permease  33.68 
 
 		 814 aa  355  2e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654458 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0369  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.41 
 
 		 855 aa  354  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.476838 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0754  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.27 
 
 		 878 aa  354  4e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1856  permease  34.17 
 
 		 887 aa  350  7e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3500  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.29 
 
 		 823 aa  346  8e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0297  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.48 
 
 		 813 aa  346  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1993  permease  33.41 
 
 		 808 aa  345  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483054  normal  0.18288 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1883  permease  33.06 
 
 		 808 aa  346  1e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.142413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1875  permease  34.3 
 
 		 796 aa  343  8e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3041  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.64 
 
 		 844 aa  340  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0235871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4627  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.82 
 
 		 915 aa  341  4e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.618125 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0341  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.54 
 
 		 874 aa  338  1.9999999999999998e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.474901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1852  permease  32.16 
 
 		 869 aa  333  7.000000000000001e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.155469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1894  permease  32.44 
 
 		 802 aa  333  8e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1869  permease  31.96 
 
 		 811 aa  331  3e-89  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0984  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.83 
 
 		 817 aa  331  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000176456 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3155  hypothetical protein  34.29 
 
 		 931 aa  327  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1890  ABC efflux pump, inner membrane subunit  33.79 
 
 		 883 aa  325  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.911566  normal  0.0476843 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1876  permease  32.91 
 
 		 804 aa  323  9.999999999999999e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1829  permease  32.26 
 
 		 797 aa  320  9e-86  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1893  permease  32.73 
 
 		 805 aa  320  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.628552  normal  0.326735 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4159  permease  32 
 
 		 804 aa  315  1.9999999999999998e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.437191 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1897  permease  31.88 
 
 		 831 aa  313  7.999999999999999e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3350  permease  34.02 
 
 		 816 aa  313  1e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.156293  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3887  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.57 
 
 		 807 aa  311  2.9999999999999997e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1995  permease  32.23 
 
 		 821 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.70072  normal  0.177853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1814  permease  34.01 
 
 		 809 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736977 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1892  permease  31.36 
 
 		 798 aa  310  5.9999999999999995e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.723684  normal  0.478639 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1896  permease  33.03 
 
 		 810 aa  307  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0368  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.24 
 
 		 816 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3609  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.99 
 
 		 849 aa  306  8.000000000000001e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.123947 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1285  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.89 
 
 		 913 aa  306  1.0000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1874  permease  32.64 
 
 		 800 aa  301  4e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.219896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0618  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.29 
 
 		 822 aa  301  5e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0289  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.38 
 
 		 805 aa  300  6e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1088  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.62 
 
 		 880 aa  300  8e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0674976 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1890  permease  30.9 
 
 		 845 aa  299  1e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.485646 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1827  permease  32.61 
 
 		 805 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360396  normal  0.426274 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1898  permease  32.99 
 
 		 808 aa  296  1e-78  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4284  ABC efflux pump, inner membrane subunit  32.64 
 
 		 871 aa  294  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4528  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.78 
 
 		 809 aa  294  4e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.697087 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0370  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.69 
 
 		 805 aa  293  8e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.701449 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1828  permease  33.75 
 
 		 803 aa  291  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.762234 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1889  permease  31.69 
 
 		 803 aa  290  5.0000000000000004e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1888  permease  31.05 
 
 		 810 aa  290  9e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.712719 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3604  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.49 
 
 		 884 aa  289  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.729467  normal  0.137279 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1708  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.05 
 
 		 888 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.232779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3461  ABC efflux pump, inner membrane subunit  31.08 
 
 		 919 aa  280  1e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00119144  decreased coverage  0.00373054 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1681  permease  32.65 
 
 		 819 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1933  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.12 
 
 		 805 aa  278  2e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0418  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.17 
 
 		 807 aa  275  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0396229 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3471  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.41 
 
 		 893 aa  274  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.440617  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1895  permease  32.75 
 
 		 835 aa  273  1e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.88407 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4572  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.9 
 
 		 812 aa  270  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.443646  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0616  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.67 
 
 		 862 aa  268  2e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0371  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.33 
 
 		 805 aa  266  2e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.646893 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3156  permease  30.64 
 
 		 887 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.76534 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1906  permease  32.54 
 
 		 806 aa  266  2e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2896  ABC efflux pump, inner membrane subunit  30.39 
 
 		 846 aa  261  3e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0101  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.57 
 
 		 808 aa  254  6e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.965673 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1877  permease  31.71 
 
 		 808 aa  251  4e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3647  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.76 
 
 		 821 aa  247  6e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.737099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1855  permease  29.97 
 
 		 865 aa  245  3e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1885  permease  31.79 
 
 		 843 aa  241  5e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.47484  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1873  permease  27.93 
 
 		 803 aa  237  7e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1887  permease  28.06 
 
 		 809 aa  236  2.0000000000000002e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.556655  normal  0.69487 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3350  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.99 
 
 		 828 aa  225  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0096  protein of unknown function DUF214  25.52 
 
 		 813 aa  223  9.999999999999999e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0760  permease  30.76 
 
 		 819 aa  215  2.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.21573  normal  0.423972 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4395  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.92 
 
 		 879 aa  210  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3591  ABC efflux pump, inner membrane subunit  27.25 
 
 		 820 aa  208  4e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171313  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0307  peptide ABC transporter permease  26.71 
 
 		 810 aa  203  9.999999999999999e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.341925  normal  0.050461 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2120  putative ABC transporter, permease protein  25.49 
 
 		 809 aa  201  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.5337  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0619  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.02 
 
 		 810 aa  198  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0081  protein of unknown function DUF214  25.98 
 
 		 810 aa  193  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.484332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0776  putative permease  24.41 
 
 		 807 aa  167  8e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4848  protein of unknown function DUF214  22.94 
 
 		 804 aa  127  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00205753  normal  0.159868 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4847  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 818 aa  119  3e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.119483  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3314  protein of unknown function DUF214  24.65 
 
 		 806 aa  116  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4623  protein of unknown function DUF214  24.52 
 
 		 808 aa  112  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.417059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4628  protein of unknown function DUF214  25.17 
 
 		 795 aa  111  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4417  putative ABC transporter, permease protein  23.06 
 
 		 830 aa  110  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.56334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4849  protein of unknown function DUF214  22.47 
 
 		 802 aa  110  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.011256  normal  0.10572 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4627  protein of unknown function DUF214  24.79 
 
 		 795 aa  108  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.689235 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0947  protein of unknown function DUF214  25.09 
 
 		 805 aa  108  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0140  protein of unknown function DUF214  22.27 
 
 		 816 aa  108  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4594  protein of unknown function DUF214  23.16 
 
 		 813 aa  108  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4858  protein of unknown function DUF214  25.8 
 
 		 809 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0512952 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4905  protein of unknown function DUF214  27.15 
 
 		 798 aa  107  9e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0532186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4593  protein of unknown function DUF214  25 
 
 		 805 aa  107  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4630  protein of unknown function DUF214  25.26 
 
 		 816 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4591  protein of unknown function DUF214  22.9 
 
 		 795 aa  105  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.597016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4616  protein of unknown function DUF214  22.55 
 
 		 807 aa  103  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.413807 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0330  acetylornithine deacetylase ArgE  24.14 
 
 		 835 aa  102  4e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.277971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>