More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0014 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0014  dienelactone hydrolase  100 
 
 
273 aa  558  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332863  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1920  dienelactone hydrolase  44.53 
 
 
264 aa  205  7e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4242  dienelactone hydrolase  42.91 
 
 
263 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.194983  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2303  dienelactone hydrolase  42.97 
 
 
264 aa  204  1e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0347  dienelactone hydrolase  45.31 
 
 
262 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.971139  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1196  dienelactone hydrolase  42.8 
 
 
263 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.372002  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3711  dienelactone hydrolase  43.02 
 
 
262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00138504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1370  dienelactone hydrolase  44.18 
 
 
280 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.591445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1677  dienelactone hydrolase family protein  42.64 
 
 
262 aa  198  7e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1184  dienelactone hydrolase  42.42 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00788305  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1214  dienelactone hydrolase  42.05 
 
 
263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.602009  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0499  dienelactone hydrolase  39.1 
 
 
261 aa  196  3e-49  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.300856  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33270  Dienelactone hydrolase protein  42.05 
 
 
261 aa  196  5.000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.669671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0790  dienelactone hydrolase  43.37 
 
 
269 aa  195  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4232  dienelactone hydrolase  40.91 
 
 
263 aa  193  2e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.215176  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4214  hypothetical protein  42.8 
 
 
262 aa  190  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0163  dienelactone hydrolase  41.06 
 
 
318 aa  188  5.999999999999999e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0661  dienelactone hydrolase  39.75 
 
 
263 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2536  dienelactone hydrolase family protein  42.51 
 
 
270 aa  184  9e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49330  hypothetical protein  43.1 
 
 
262 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.295044  normal  0.0937035 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0914  dienelactone hydrolase  38.58 
 
 
263 aa  183  3e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1093  dienelactone hydrolase  40 
 
 
237 aa  183  3e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2218  dienelactone hydrolase  40.16 
 
 
264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.000562202  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1497  dienelactone hydrolase  39.83 
 
 
246 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2490  dienelactone hydrolase  41.22 
 
 
262 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56422  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2350  dienelactone hydrolase  39.27 
 
 
259 aa  176  5e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.722074  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1015  dienelactone hydrolase  38.76 
 
 
261 aa  176  5e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0264245  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0480  dienelactone hydrolase family protein  39.68 
 
 
260 aa  175  6e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1803  dienelactone hydrolase family protein  37.7 
 
 
239 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.100178  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1264  dienelactone hydrolase family protein  38.17 
 
 
237 aa  165  6.9999999999999995e-40  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1616  dienelactone hydrolase  40.32 
 
 
263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.555158 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1219  carboxymethylenebutenolidase  38.17 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0189806  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1399  dienelactone hydrolase  36.4 
 
 
250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4659  dienelactone hydrolase  36.47 
 
 
257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0787  dienelactone hydrolase family protein  41.27 
 
 
356 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.307266  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0597  dienelactone hydrolase family protein  42.56 
 
 
243 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0612  dienelactone hydrolase family protein  42.15 
 
 
243 aa  158  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2592  hypothetical protein  36.02 
 
 
238 aa  158  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2719  hypothetical protein  36.02 
 
 
238 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2739  hypothetical protein  35.66 
 
 
238 aa  155  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2775  dienelactone hydrolase  39.36 
 
 
269 aa  155  9e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2612  hypothetical protein  35.25 
 
 
238 aa  153  2e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4157  dienelactone hydrolase  39.67 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.138582  normal  0.0101627 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0501  dienelactone hydrolase family protein  41.32 
 
 
242 aa  151  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.821381  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3611  dienelactone hydrolase  34.23 
 
 
267 aa  150  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000690208  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2163  dienelactone hydrolase  39 
 
 
237 aa  149  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163998  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2018  dienelactone hydrolase  35.63 
 
 
242 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.426068  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0170  dienelactone hydrolase  33.48 
 
 
246 aa  145  5e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000135133  normal  0.545513 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3134  dienelactone hydrolase  39.02 
 
 
234 aa  145  9e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0587579  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2209  dienelactone hydrolase family protein  35.22 
 
 
242 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.670258  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02015  dienelactone hydrolase  35.39 
 
 
264 aa  142  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1980  dienelactone hydrolase  33.05 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.228213 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2281  dienelactone hydrolase  32.62 
 
 
245 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187081 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1690  dienelactone hydrolase  32.52 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0305937  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43840  hypothetical protein  36.33 
 
 
241 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0425  dienelactone hydrolase  31.66 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.18094  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4178  dienelactone hydrolase  32.11 
 
 
241 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119095  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0694  dienelactone hydrolase  36.9 
 
 
271 aa  140  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.115096  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3677  hypothetical protein  36.33 
 
 
241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.308069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4133  dienelactone hydrolase  37.7 
 
 
237 aa  139  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.850524  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3749  dienelactone hydrolase  31.3 
 
 
241 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2104  dienelactone hydrolase  37.44 
 
 
234 aa  137  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0464175  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3501  dienelactone hydrolase  31.56 
 
 
241 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.572778  normal  0.863924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1626  dienelactone hydrolase  33.2 
 
 
242 aa  135  9e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0197057 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1525  dienelactone hydrolase  35.96 
 
 
241 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.4212  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3656  dienelactone hydrolase  34.98 
 
 
263 aa  133  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4080  dienelactone hydrolase  34.66 
 
 
244 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.240265  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0940  dienelactone hydrolase  35.14 
 
 
279 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1805  dienelactone hydrolase  29.92 
 
 
245 aa  124  2e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.341986  normal  0.0741289 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7419  hypothetical protein  35.35 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.140169  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3045  dienelactone hydrolase  33.47 
 
 
249 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2650  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 
265 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2621  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 
265 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2665  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 
265 aa  117  3e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.858071  normal  0.690988 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0569  dienelactone hydrolase  29.05 
 
 
267 aa  113  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000352652  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1245  dienelactone hydrolase  31.54 
 
 
261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00955102  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0559  dienelactone hydrolase  29.25 
 
 
265 aa  110  3e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4947  dienelactone hydrolase  31.82 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.316291  normal  0.300582 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.07 
 
 
254 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4373  dienelactone hydrolase  29.76 
 
 
256 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.68292 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3032  dienelactone hydrolase  30.45 
 
 
296 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2805  Carboxymethylenebutenolidase  30.31 
 
 
290 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.103542  normal  0.354876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3312  Carboxymethylenebutenolidase  30.31 
 
 
290 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1898  Carboxymethylenebutenolidase  29.18 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.668e-17 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0298  Carboxymethylenebutenolidase  28.63 
 
 
227 aa  80.9  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5840  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.163865  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6207  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00179618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2003  dienelactone hydrolase  28.5 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5750  carboxymethylenebutenolidase  30.4 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.588229  normal  0.622374 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6683  carboxymethylenebutenolidase  29.52 
 
 
237 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00301563  normal  0.110469 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6385  carboxymethylenebutenolidase  28.57 
 
 
234 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5994  carboxymethylenebutenolidase  29.96 
 
 
237 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5328  carboxymethylenebutenolidase  28.95 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0616123 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4061  carboxymethylenebutenolidase  30.4 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.86952  normal  0.797437 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6610  carboxymethylenebutenolidase  28.19 
 
 
237 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04764  putative transmembrane protein  28.33 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05691  putative transmembrane protein  28.33 
 
 
238 aa  73.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46214  predicted protein  31.06 
 
 
367 aa  74.3  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4121  Carboxymethylenebutenolidase  32.96 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1276  carboxymethylenebutenolidase  29.13 
 
 
227 aa  74.7  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>