More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0013 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0013  signal-transduction protein  100 
 
 
147 aa  301  2.0000000000000002e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0100  putative signal transduction protein with CBS domains  37.59 
 
 
143 aa  111  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1220  signal-transduction protein  38.89 
 
 
145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.348501 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3686  CBS domain containing protein  35.25 
 
 
142 aa  108  3e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.364538  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2360  signal-transduction protein  40.88 
 
 
142 aa  107  6e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0426332  normal  0.516588 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1852  putative signal transduction protein with CBS domains  41.67 
 
 
144 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.260866  normal  0.0125119 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5408  putative signal transduction protein with CBS domains  40.3 
 
 
146 aa  102  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000447829  normal  0.196172 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2203  hypothetical protein  38.19 
 
 
144 aa  102  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0233  putative signal transduction protein with CBS domains  38.46 
 
 
140 aa  101  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.193926  normal  0.17761 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3725  signal-transduction protein  37.59 
 
 
143 aa  101  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2052  putative signal transduction protein with CBS domains  38.89 
 
 
144 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3907  signal-transduction protein  35 
 
 
142 aa  98.6  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.184794  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1044  putative signal transduction protein with CBS domains  36.17 
 
 
143 aa  97.8  5e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0420  signal-transduction protein  37.76 
 
 
158 aa  97.4  6e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0623  CBS  36.81 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3056  putative signal-transduction protein with CBS domains  33.8 
 
 
143 aa  97.4  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.185367  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0631  signal-transduction protein  35.97 
 
 
142 aa  97.1  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0667586  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1462  putative signal transduction protein with CBS domains  35.34 
 
 
145 aa  96.3  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0493403  normal  0.625814 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1650  signal-transduction protein  35.51 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2707  signal-transduction protein  35.61 
 
 
141 aa  96.3  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5213  hypothetical protein  37.96 
 
 
142 aa  95.9  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.995327  normal  0.0487848 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2219  putative signal-transduction protein with CBS domains  36.96 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0827472 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1026  signal-transduction protein  36.99 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0490462 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4587  signal-transduction protein  36.3 
 
 
153 aa  95.5  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00378118  hitchhiker  0.00177049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2362  signal-transduction protein  36.96 
 
 
143 aa  94.7  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.67854  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4123  signal-transduction protein  36.3 
 
 
153 aa  95.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00087962  normal  0.0202046 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2153  signal-transduction protein  33.58 
 
 
142 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.268313  normal  0.0990163 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1938  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 
143 aa  94.4  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.704039  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3635  signal-transduction protein  35.62 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.295786  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4732  signal-transduction protein  35.62 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00820406  normal  0.0168857 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3943  signal-transduction protein  34.93 
 
 
153 aa  94.4  5e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69222 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5550  signal-transduction protein  35.62 
 
 
153 aa  94  6e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2262  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.175418 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2537  putative signal transduction protein with CBS domains  35.51 
 
 
143 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.482232 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2768  putative signal transduction protein with CBS domains  33.33 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0620195  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0004  signal-transduction protein  37.68 
 
 
142 aa  92.4  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2661  signal-transduction protein  35 
 
 
177 aa  92  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.63207  normal  0.665873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3826  putative signal transduction protein with CBS domains  40.68 
 
 
120 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.950929 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0202  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.025801  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3539  signal-transduction protein  36.64 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.278615 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0016  signal-transduction protein  33.33 
 
 
146 aa  91.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2620  CBS domain protein  34.56 
 
 
146 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0225  CBS domain-containing protein  33.59 
 
 
145 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.791993 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0338  signal-transduction protein  35.46 
 
 
147 aa  91.3  4e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0272  CBS domain-containing protein  34.38 
 
 
145 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1409  signal-transduction protein  35.17 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3241  signal-transduction protein  34.11 
 
 
144 aa  90.9  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.484063 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1217  CBS domain-containing protein  35.97 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0153  signal-transduction protein  36.22 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0228  CBS domain-containing protein  32.81 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1676  signal-transduction protein  36.36 
 
 
147 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.780489  normal  0.354622 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1616  putative CBS domain-containing signal transduction protein  36.43 
 
 
142 aa  89.7  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3631  putative signal transduction protein with CBS domains  34.45 
 
 
142 aa  89.4  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1649  signal-transduction protein  35.04 
 
 
142 aa  88.6  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2769  CBS domain containing protein  34.31 
 
 
153 aa  88.2  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3735  signal transduction protein  33.82 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4121  signal-transduction protein  32.88 
 
 
146 aa  88.2  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1515  CBS domain-containing protein  33.56 
 
 
153 aa  87.8  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.257726  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4974  putative signal-transduction protein with CBS domains  35.66 
 
 
147 aa  88.2  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0816417 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2834  signal-transduction protein  36.36 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.316088  normal  0.231791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2771  hypothetical protein  35.9 
 
 
125 aa  87.4  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.372067 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0957  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1350  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0725634  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1218  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2480  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2247  putative signal transduction protein with CBS domains  36.43 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000297093  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1290  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.427954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1358  hypothetical protein  34.31 
 
 
153 aa  87.8  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.512036  normal  0.639451 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0612  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735232  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0334  CBS domain-containing protein  34.25 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1321  hypothetical protein  35.04 
 
 
142 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2323  putative signal transduction protein with CBS domains  36.36 
 
 
145 aa  87.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.170904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4635  signal-transduction protein  35.51 
 
 
143 aa  87  8e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.574258  normal  0.318433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1046  signal-transduction protein  34.29 
 
 
142 aa  86.3  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.460697  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  36.11 
 
 
145 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2374  signal-transduction protein  36.36 
 
 
146 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.425597  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3271  putative signal-transduction protein with CBS domains  32.61 
 
 
143 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00311988 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3231  signal-transduction protein  34.53 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00933533  normal  0.19525 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0824  CBS domain containing membrane protein  35.25 
 
 
143 aa  84.7  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.117875 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0040  CBS  30.56 
 
 
146 aa  85.1  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.847902  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3128  signal-transduction protein  36.23 
 
 
142 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.192632  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1423  hypothetical protein  33.58 
 
 
154 aa  85.1  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0175905 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0335  hypothetical protein  29.37 
 
 
144 aa  84.3  4e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0527  CBS domain containing protein  33.87 
 
 
147 aa  84  6e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2670  signal-transduction protein  33.57 
 
 
142 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0199897  normal  0.983064 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03090  CBS domain-containing protein  28.67 
 
 
144 aa  83.6  9e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.17742  hitchhiker  0.000000481482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5124  putative signal transduction protein with CBS domains  35.97 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.922703  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1571  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 
165 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.249229  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2095  hypothetical protein  32.19 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.040556  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1135  signal-transduction protein  32.12 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.289663  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2757  CBS domain-containing protein  30.66 
 
 
151 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.212289  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2352  signal-transduction protein  38.89 
 
 
142 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.103406  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2880  signal-transduction protein  36.62 
 
 
145 aa  82  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.982708  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1687  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0944  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1864  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0408714  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0637  signal-transduction protein  32.17 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0404  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1710  CBS domain-containing protein  34.31 
 
 
154 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.351573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>