More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_R0050 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0711  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0050  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0840957  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t08  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.657243  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0768  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.28458  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0047  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0039  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0039  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0035  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4244  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0032  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.832737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1702  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535582  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1501  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.287153  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0039  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266264  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2759  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0341238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0052  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0034  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0024  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1308  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.585322  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0590  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.532151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0039  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00372537  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0037  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448716  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1531  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0562  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.60431  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0047  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4311  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0041  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0010  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.475805  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0002  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS03760  tRNA-Pro  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  90.41 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  91.18 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0046  tRNA-Pro  90.54 
 
 
78 bp  83.8  0.000000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0073  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00652705  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0013  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368769 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0079  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.604341  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0049  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0032  tRNA-Pro  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994624  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0003  tRNA-Pro  89.71 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.769558  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0035  tRNA-Pro  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000578249  normal  0.604017 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0031  tRNA-Pro  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0023  tRNA-Pro  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.247258  normal  0.475897 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0047  tRNA-Pro  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0011  tRNA-Pro  92.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.253488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0012  tRNA-Pro  92.59 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00369197  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6001  tRNA-Pro  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0238611 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0007  tRNA-Pro  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0007  tRNA-Pro  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.845776 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0064  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  87.01 
 
 
79 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0063  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305975  normal  0.0658798 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0063  tRNA-Pro  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0031  tRNA-Pro  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0049  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.241293 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0037  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201404  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0036  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00692633  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  87.01 
 
 
79 bp  73.8  0.000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0001  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0207392  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0002  tRNA-Pro  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.815773  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0067  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.750062  normal  0.274534 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0009  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0034  tRNA-Pro  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.155615  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1575  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1610  tRNA-Pro  92.45 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.815519 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  87.01 
 
 
79 bp  73.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0066  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.645419 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0061  tRNA-Pro  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000960142  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0033  tRNA-Pro  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  87.5 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0054  tRNA-Pro  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000175558  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0029  tRNA-Pro  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0173  tRNA-Pro  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.485215  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0057  tRNA-Pro  93.75 
 
 
74 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000568305  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0001  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  87.32 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>