More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4841 on replicon NC_009672
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009672  Oant_4841  cupin 2 domain-containing protein  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0230  transcriptional regulator  40.43 
 
 		 197 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0641  XRE family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.199173  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2294  XRE family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 211 aa  119  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.328361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1539  MerR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 292 aa  111  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0172454  normal  0.655759 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65950  putative transcriptional regulator  34.67 
 
 		 199 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5722  putative transcriptional regulator  35.18 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2821  XRE family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3586  XRE family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.101767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2868  Cro/CI family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 199 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2913  XRE family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0638  putative transcriptional regulator  35.36 
 
 		 184 aa  101  9e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06970  Cro/CI family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 184 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2125  transcriptional regulator  35.36 
 
 		 182 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.318777 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2571  transcriptional regulator, XRE family  33.88 
 
 		 192 aa  94.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00000000481124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1712  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.526366  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2705  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.15 
 
 		 203 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.847169  normal  0.058179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1727  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170715  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6366  XRE family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  94.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0311191  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2901  DNA-binding protein  33.7 
 
 		 182 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5414  XRE family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1441  XRE family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 227 aa  92.8  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0636175 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4867  XRE family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 192 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1027  XRE family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 223 aa  92.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.944907 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1831  DNA-binding protein  27.22 
 
 		 181 aa  92.4  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2884  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0819457  normal  0.480487 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2898  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2806  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 181 aa  92  5e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.675672 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1629  MerR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 181 aa  91.7  7e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000044317  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0188  XRE family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 229 aa  91.7  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.054457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2387  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 181 aa  91.3  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3329  transcriptional regulator  32.81 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.855836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3867  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1854  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 181 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.653009  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1906  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 181 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0011859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3313  transcriptional regulator, XRE family  29.85 
 
 		 201 aa  90.5  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2635  XRE family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 185 aa  90.9  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.362634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3546  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 181 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1650  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000412674  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1649  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 181 aa  89.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.176921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4807  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.730727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5003  XRE family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 191 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.10951 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0803  XRE family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 185 aa  90.1  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215741  normal  0.130979 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1781  DNA-binding protein  26.67 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0772  transcriptional regulator  30.73 
 
 		 204 aa  89.7  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.855503 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1795  DNA-binding protein  26.7 
 
 		 181 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2578  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 		 182 aa  89  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1599  MerR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 181 aa  88.6  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6084  XRE family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 234 aa  88.6  6e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.207069 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4279  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 185 aa  88.2  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.195081 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4729  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5543  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.827143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5317  XRE family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 192 aa  87.4  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.221767  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2181  Cro/CI family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 184 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1083  XRE family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 199 aa  86.3  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0846857  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0758  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 190 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3556  XRE family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 184 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.427188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4439  transcriptional regulator, XRE family  31.91 
 
 		 190 aa  85.9  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0274  transcriptional regulator, XRE family  35.16 
 
 		 205 aa  85.9  4e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.64998  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0751  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000101746  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0114  XRE family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 193 aa  84.7  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3720  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.310668  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5384  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 185 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.840154  normal  0.424249 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0361  XRE family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 205 aa  84  0.000000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4506  XRE family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3262  XRE family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0174683 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1846  XRE family transcriptional regulator  34.59 
 
 		 183 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.677123  hitchhiker  0.00632075 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4902  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.634753 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3464  XRE family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 185 aa  83.6  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1254  DNA-binding protein  31.84 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2220  DNA-binding protein  31.84 
 
 		 236 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2046  XRE family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.298774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0544  XRE family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 203 aa  82  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2995  transcriptional regulator  30.58 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0735878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1446  transcriptional regulator, XRE family  31.34 
 
 		 191 aa  82.4  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2904  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.311354  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0384  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1533  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0350  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3020  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1723  DNA-binding protein  32.78 
 
 		 179 aa  81.3  0.000000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0900931  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0273  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 176 aa  80.9  0.00000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000144131  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0275  cupin 2 domain-containing protein  31.49 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000353927  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2948  transcriptional regulator, XRE family  32.12 
 
 		 225 aa  80.9  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0211039  hitchhiker  0.000112709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1788  XRE family transcriptional regulator  34.68 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1265  transcriptional regulator, putative  33.92 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0888  transcriptional regulator, XRE family  30.73 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118183  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1046  XRE family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0847  XRE family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1163  cupin 2 domain-containing protein  33.92 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.967119  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1104  cupin 2 domain-containing protein  33.92 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.183758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3195  transcriptional regulator, XRE family  33.92 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0639399 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1195  XRE family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.152731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2540  Cro/CI family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 181 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0965  transcriptional regulator, XRE family  30.39 
 
 		 191 aa  77.8  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3100  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.510523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2921  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.899455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3003  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1128  XRE family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0901  XRE family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 181 aa  77  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000108423 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>