More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4808 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4808  secretion protein HlyD family protein  100 
 
 
330 aa  644    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2703  secretion protein HlyD family protein  46.13 
 
 
367 aa  249  4e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0499  secretion protein HlyD family protein  39.46 
 
 
323 aa  203  3e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1026  secretion protein HlyD family protein  36.96 
 
 
326 aa  200  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0412  secretion protein HlyD family protein  38.1 
 
 
323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.604128  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1728  hypothetical protein  40.14 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0534587  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20080  hypothetical protein  39.12 
 
 
323 aa  194  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003317  membrane-fusion protein  35.87 
 
 
326 aa  188  9e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0583  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 
324 aa  186  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3639  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 
324 aa  185  9e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0488  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 
324 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4089  HlyD family secretion protein  36 
 
 
324 aa  183  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3463  secretion protein HlyD family protein  36.31 
 
 
324 aa  183  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0567  secretion protein HlyD family protein  36.92 
 
 
323 aa  182  7e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.142155 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0527  secretion protein HlyD family protein  35.08 
 
 
324 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0568004  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0531  secretion protein HlyD family protein  35.08 
 
 
324 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0396  secretion protein HlyD family protein  35.4 
 
 
330 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0506  secretion protein HlyD family protein  35.08 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3729  secretion protein HlyD family protein  34.57 
 
 
329 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3745  secretion protein HlyD family protein  38.29 
 
 
323 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0093  HlyD family secretion protein  35.6 
 
 
331 aa  177  3e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0320304 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1212  hypothetical protein  35.76 
 
 
324 aa  177  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000214097  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3813  secretion protein HlyD family protein  34.77 
 
 
324 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0478  HlyD family secretion protein  36.62 
 
 
322 aa  176  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.161841 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0477  hypothetical protein  34.16 
 
 
332 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0653  secretion protein HlyD family protein  34.25 
 
 
357 aa  172  5e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0618  putative secretion protein, HlyD family  36.1 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4393  secretion protein HlyD family protein  35.84 
 
 
323 aa  169  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0150137  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1173  secretion protein HlyD family protein  37.11 
 
 
337 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02435  hypothetical protein  34.91 
 
 
326 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1189  secretion protein HlyD  37.24 
 
 
323 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.315896  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2701  secretion protein HlyD family protein  38.57 
 
 
333 aa  159  4e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2777  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 
323 aa  159  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.991626  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2682  secretion protein HlyD family protein  37.24 
 
 
323 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.430212  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4571  secretion protein HlyD family protein  35.67 
 
 
349 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.707913  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1039  secretion protein HlyD  31.6 
 
 
427 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1840  hypothetical protein  32.78 
 
 
332 aa  153  5e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.137202  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0604  secretion protein HlyD family protein  36.77 
 
 
326 aa  153  5e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1925  secretion protein HlyD family protein  32.58 
 
 
328 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0178624 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3060  secretion protein HlyD family protein  31.58 
 
 
353 aa  125  9e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.83 
 
 
397 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0179  secretion protein HlyD  27.16 
 
 
334 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.235811  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2328  secretion protein HlyD  25.27 
 
 
398 aa  105  8e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1286  hypothetical protein  28.21 
 
 
331 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3464  secretion protein HlyD  29.17 
 
 
335 aa  102  8e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3037  secretion protein HlyD  31.33 
 
 
344 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.714598  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  30.28 
 
 
379 aa  97.8  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69090  hypothetical protein  27.32 
 
 
357 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  29.12 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  25.97 
 
 
400 aa  95.1  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1329  hypothetical protein  28.57 
 
 
328 aa  95.1  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2812  hypothetical protein  29.03 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.659594  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3881  HlyD family secretion protein  34.85 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.266197  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2900  hypothetical protein  29.03 
 
 
328 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.441654  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2823  HlyD family secretion protein  27.74 
 
 
329 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0472  HlyD family secretion protein  29.76 
 
 
349 aa  94  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.776692  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0916  secretion protein HlyD family protein  31.23 
 
 
335 aa  94  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0411  HlyD family secretion protein  29.76 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5975  hypothetical protein  28.05 
 
 
382 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2942  hypothetical protein  29.82 
 
 
342 aa  91.7  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.495568  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0317  secretion protein HlyD family protein  28.06 
 
 
354 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3578  secretion protein HlyD  30.11 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.551051  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0913  hypothetical protein  29.04 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.16155  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0853  hypothetical protein  29.04 
 
 
331 aa  90.1  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0945  hypothetical protein  29.04 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0966  hypothetical protein  29.04 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0881  hypothetical protein  29.04 
 
 
331 aa  89.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1778  secretion protein HlyD  29.33 
 
 
339 aa  89.4  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.32933  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1422  secretion protein HlyD  31.48 
 
 
359 aa  89.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0497268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4679  secretion protein HlyD family protein  24.85 
 
 
425 aa  89.4  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1327  major facilitator superfamily efflux pump membrane fusion protein  29.41 
 
 
393 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0719402  normal  0.0222089 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16790  Secretion protein, HlyD family  29.25 
 
 
358 aa  88.6  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.424622  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2054  periplasmic component of efflux system  29.46 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00762  hypothetical protein  29.47 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2847  secretion protein HlyD family protein  29.47 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0849  hypothetical protein  29.47 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0860  hypothetical protein  29.47 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1721  RND family efflux transporter MFP subunit  32.27 
 
 
431 aa  87.4  3e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0818  hypothetical protein  29.47 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00779  hypothetical protein  29.47 
 
 
332 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0943  hypothetical protein  29.47 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3104  secretion protein HlyD family protein  27.76 
 
 
407 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.599645  normal  0.0169498 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2848  hypothetical protein  29.47 
 
 
331 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0314529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3969  secretion protein HlyD family protein  27.25 
 
 
352 aa  87  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1823  secretion protein HlyD family protein  30.03 
 
 
355 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2026  secretion protein HlyD family protein  28.25 
 
 
401 aa  86.7  5e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.705126  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 
376 aa  86.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  29.6 
 
 
421 aa  86.7  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5245  secretion protein HlyD family protein  30.34 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.52 
 
 
405 aa  86.3  7e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1503  secretion protein HlyD family protein  29.3 
 
 
357 aa  85.5  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.996003  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2020  secretion protein HlyD family protein  26.44 
 
 
366 aa  85.5  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2557  hypothetical protein  29.14 
 
 
331 aa  85.5  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0146  auxiliary membrane fusion protein family transporter  29.64 
 
 
326 aa  85.9  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000237701  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0558  secretion protein HlyD family protein  28.26 
 
 
375 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6436  secretion protein HlyD family protein  29.24 
 
 
392 aa  85.5  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.475078  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2904  secretion protein HlyD family protein  25.61 
 
 
329 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.839486  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3787  secretion protein HlyD family protein  26.96 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.11 
 
 
432 aa  85.1  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6207  secretion protein HlyD family protein  32.99 
 
 
357 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.19774 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>