172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4806 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009670  Oant_4806  ABC-2 type transporter  100 
 
 
367 aa  719  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.271694  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  39.84 
 
 
780 aa  239  5e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003315  ABC-type multidrug transport system permease component  33.15 
 
 
383 aa  195  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3811  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 
383 aa  189  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0508  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 
381 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0533  ABC-2 type transporter  33.72 
 
 
379 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0529  ABC-2 type transporter  34.01 
 
 
381 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4087  hypothetical protein  33.81 
 
 
378 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3637  hypothetical protein  33.81 
 
 
383 aa  186  8e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0490  hypothetical protein  33.81 
 
 
383 aa  185  9e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0091  transporter, putative  32.45 
 
 
405 aa  185  1e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.060558 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0585  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
382 aa  184  2e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3461  ABC-2 type transporter  33.52 
 
 
383 aa  184  2e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0620  ABC-2 type transporter  30.77 
 
 
378 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3743  ABC-2 type transporter  32.46 
 
 
384 aa  177  3e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02437  hypothetical protein  33.89 
 
 
383 aa  174  1e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0414  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 
381 aa  175  1e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0394  ABC-2 type transporter  32.27 
 
 
397 aa  169  9e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4391  ABC-2 type transporter  32.75 
 
 
384 aa  168  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.567246  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1214  hypothetical protein  33.81 
 
 
382 aa  168  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0247305  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3727  hypothetical protein  33.04 
 
 
381 aa  165  1e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1171  hypothetical protein  32.76 
 
 
375 aa  162  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0475  ABC-2 type transporter  32.6 
 
 
392 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1842  hypothetical protein  29.33 
 
 
395 aa  156  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1730  hypothetical protein  31.3 
 
 
377 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.151004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0480  hypothetical protein  29.86 
 
 
386 aa  150  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.292724 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0569  ABC-2 type transporter  30.7 
 
 
382 aa  149  1e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101548 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  32.13 
 
 
377 aa  148  2e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1037  hypothetical protein  30.38 
 
 
397 aa  146  7e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  29.65 
 
 
379 aa  143  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0596  ABC-2 type transporter  27.19 
 
 
395 aa  142  1e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0651  ABC-2 type transporter  31.25 
 
 
496 aa  138  2e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1024  hypothetical protein  29.52 
 
 
293 aa  132  1e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4569  ABC-2 type transporter  30.92 
 
 
377 aa  128  1e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0619  membrane protein  23.85 
 
 
378 aa  96.3  7e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1025  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 
391 aa  88.2  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2330  hypothetical protein  24.61 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3462  ABC-2 type transporter  25.07 
 
 
429 aa  85.9  1e-15  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3638  ABC-2 type transporter  25.47 
 
 
431 aa  84.3  3e-15  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0992  ABC-2 type transporter  21.43 
 
 
391 aa  83.6  6e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0182  ABC-type multidrug transport system permease component  24.22 
 
 
415 aa  82.8  8e-15  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000192398  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0489  ABC-2 type transporter  24.78 
 
 
429 aa  83.2  8e-15  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1172  ABC-2 type transporter  29.54 
 
 
395 aa  80.9  3e-14  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3062  ABC-2 type transporter  23.97 
 
 
376 aa  80.5  5e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.191967  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3063  ABC-2 type transporter  23.47 
 
 
397 aa  78.6  1e-13  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0378038  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3744  ABC-2 type transporter  24.51 
 
 
387 aa  78.2  2e-13  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1927  ABC-2 type transporter  26.59 
 
 
390 aa  78.6  2e-13  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.751197  normal  0.0397267 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3812  ABC-2 type transporter  25.61 
 
 
430 aa  77.8  3e-13  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.188014  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4088  hypothetical protein  25.08 
 
 
435 aa  76.6  6e-13  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0479  hypothetical protein  27.7 
 
 
375 aa  75.9  9e-13  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.168605 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0528  ABC-2 type transporter  26.03 
 
 
405 aa  75.1  2e-12  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.089523  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0507  ABC-2 type transporter  25.54 
 
 
430 aa  74.7  2e-12  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2331  hypothetical protein  22.37 
 
 
399 aa  73.9  4e-12  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0532  ABC-2 type transporter  25.15 
 
 
405 aa  72.4  1e-11  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0584  ABC-2 type transporter  26.71 
 
 
408 aa  70.5  5e-11  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  24.76 
 
 
372 aa  69.7  8e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2920  ABC-2 type transporter  22.37 
 
 
371 aa  69.3  9e-11  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.827824  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0181  ABC-type multidrug transport system permease component  22.03 
 
 
382 aa  69.3  9e-11  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0315878  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0413  ABC-2 type transporter  22.76 
 
 
390 aa  68.6  2e-10  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.425702  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0739  hypothetical protein  22.59 
 
 
378 aa  67.4  3e-10  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0568  ABC-2 type transporter  25.4 
 
 
387 aa  66.6  7e-10  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.094665 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2779  ABC-2 type transporter  25 
 
 
405 aa  65.9  1e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0720  hypothetical protein  22.31 
 
 
378 aa  65.9  1e-09  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1477  ABC-2 type transporter  22.7 
 
 
371 aa  65.5  1e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0476  hypothetical protein  25.5 
 
 
372 aa  65.1  2e-09  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.985148  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4807  putative permease component of ABC transporter  24.64 
 
 
402 aa  64.7  2e-09  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459012  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1187  hypothetical protein  25.99 
 
 
407 aa  64.3  3e-09  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.152361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3728  hypothetical protein  23.6 
 
 
390 aa  64.3  3e-09  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0597  hypothetical protein  22.64 
 
 
383 aa  64.3  3e-09  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1729  hypothetical protein  31.06 
 
 
390 aa  63.9  4e-09  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.285921  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20100  hypothetical protein  30.43 
 
 
390 aa  63.5  5e-09  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.944312 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2684  ABC-2 type transporter  25.39 
 
 
405 aa  63.9  5e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020702  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  26.21 
 
 
381 aa  63.5  6e-09  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1781  ABC-2 type transporter  23.1 
 
 
381 aa  62.8  9e-09  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.290069  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2683  hypothetical protein  27.74 
 
 
378 aa  61.2  3e-08  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.25949  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0395  hypothetical protein  26.17 
 
 
371 aa  60.8  3e-08  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4392  ABC-2 type transporter  24.2 
 
 
384 aa  60.5  4e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.140219  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1078  putative ABC transport system, membrane protein  23.03 
 
 
373 aa  60.5  5e-08  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1841  hypothetical protein  24.85 
 
 
395 aa  60.1  5e-08  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0803735  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2778  ABC-2 type transporter  26.83 
 
 
378 aa  59.7  7e-08  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0113  ABC-2 type transporter  21.81 
 
 
376 aa  59.7  7e-08  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.816984  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1766  ABC-2 type transporter  23.37 
 
 
370 aa  59.3  1e-07  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.174884  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003316  ABC-type multidrug transport system permease component  27.03 
 
 
362 aa  58.9  1e-07  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1213  hypothetical protein  25.5 
 
 
387 aa  58.2  2e-07  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0148967  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  21.52 
 
 
372 aa  58.5  2e-07  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1419  hypothetical protein  25.21 
 
 
369 aa  57.8  3e-07  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.779934  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1188  hypothetical protein  27.4 
 
 
378 aa  57  5e-07  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.243694  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4064  ABC-2 type transporter  21.99 
 
 
371 aa  57  5e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1106  ABC-2 type transporter  22.86 
 
 
379 aa  57  6e-07  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.762924 
 
 
-
 
NC_002950  PG0092  transporter, putative  22.6 
 
 
379 aa  56.2  1e-06  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0602598 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5640  ABC-2 type transporter  25 
 
 
368 aa  55.1  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  23.37 
 
 
369 aa  55.1  2e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02436  hypothetical protein  24.32 
 
 
395 aa  54.3  3e-06  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1926  ABC-2 type transporter  20.87 
 
 
389 aa  53.5  5e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0215511 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1038  hypothetical protein  23.84 
 
 
434 aa  53.1  7e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5641  ABC-2 type transporter  21.05 
 
 
372 aa  53.1  7e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.350445 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  22.25 
 
 
368 aa  53.1  8e-06  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  21.69 
 
 
370 aa  53.1  8e-06  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1721  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  23.79 
 
 
380 aa  53.1  8e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.759741  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  24.93 
 
 
380 aa  52.8  1e-05  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>