More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4775 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
189 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  50 
 
 
188 aa  171  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  52.27 
 
 
191 aa  171  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  52.27 
 
 
191 aa  171  7.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  50 
 
 
219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  49.45 
 
 
188 aa  160  7e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  46.63 
 
 
194 aa  159  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_010509  Mrad2831_6307  resolvase domain-containing protein  48.85 
 
 
209 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  50 
 
 
191 aa  158  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  47.19 
 
 
193 aa  158  5e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  45.45 
 
 
187 aa  154  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  46.02 
 
 
188 aa  153  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  46.45 
 
 
199 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  48.86 
 
 
201 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  46.2 
 
 
186 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  44.32 
 
 
185 aa  147  7e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  44.81 
 
 
192 aa  147  9e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  44.38 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  44.38 
 
 
185 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0039  resolvase  42.46 
 
 
181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0293678  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  44.38 
 
 
185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  46.02 
 
 
182 aa  146  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  46.07 
 
 
188 aa  146  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  42.7 
 
 
188 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  46.63 
 
 
197 aa  145  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  45.16 
 
 
197 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  43.09 
 
 
201 aa  144  5e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5396  resolvase domain-containing protein  42.94 
 
 
180 aa  144  6e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.859533  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  44.32 
 
 
185 aa  144  9e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  43.18 
 
 
185 aa  144  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  44.97 
 
 
196 aa  144  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  46.63 
 
 
184 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  42.13 
 
 
188 aa  142  3e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 
197 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  44.51 
 
 
197 aa  142  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  45.26 
 
 
189 aa  141  4e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 
307 aa  141  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  45.99 
 
 
307 aa  141  5e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  44.2 
 
 
195 aa  140  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  46.59 
 
 
184 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  47.16 
 
 
201 aa  140  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  43.26 
 
 
185 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  41.34 
 
 
185 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  44.57 
 
 
198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5280  resolvase domain-containing protein  55.47 
 
 
305 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  44 
 
 
193 aa  137  7.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  42.93 
 
 
228 aa  137  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  46.02 
 
 
218 aa  136  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  45.25 
 
 
197 aa  135  5e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4459  resolvase  42.7 
 
 
190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4290  resolvase  42.7 
 
 
190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4190  resolvase  42.7 
 
 
190 aa  134  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  39.44 
 
 
181 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  39.77 
 
 
190 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  41.58 
 
 
201 aa  133  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2172  recombinase  46.02 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0678128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  44.09 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0108  hypothetical protein  42.47 
 
 
309 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  41.24 
 
 
193 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  45.2 
 
 
203 aa  132  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  40.43 
 
 
224 aa  131  5e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2813  resolvase-like protein  43.09 
 
 
184 aa  130  7.999999999999999e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.493253  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  43.5 
 
 
188 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  43.5 
 
 
190 aa  130  9e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  43.65 
 
 
189 aa  130  9e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  44.51 
 
 
184 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  43.5 
 
 
187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0348  Resolvase domain protein  47.49 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009660  Krad_4707  resolvase domain-containing protein  47.8 
 
 
190 aa  129  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1397  invertase/recombinase like protein  47.17 
 
 
176 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  43.96 
 
 
184 aa  128  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4835  Resolvase domain protein  42.11 
 
 
201 aa  128  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.291279 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3914  resolvase domain-containing protein  51.09 
 
 
293 aa  127  7.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.789856  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  40.45 
 
 
189 aa  127  8.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.96 
 
 
197 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6608  resolvase domain-containing protein  51.45 
 
 
189 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.525053  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 
184 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  44.02 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  44.02 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0233  resolvase  38.67 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0202  resolvase  38.67 
 
 
183 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  38.42 
 
 
189 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  43.82 
 
 
193 aa  125  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6634  resolvase domain-containing protein  41.4 
 
 
198 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000708994  hitchhiker  0.0000367715 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9004  DNA invertase  45.86 
 
 
313 aa  125  4.0000000000000003e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  40.43 
 
 
231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  39.77 
 
 
184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1202  resolvase domain-containing protein  47.52 
 
 
194 aa  125  5e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  44.62 
 
 
196 aa  125  5e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  37.02 
 
 
184 aa  124  7e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1477  Resolvase domain  38.74 
 
 
197 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.79192  unclonable  0.0000000000000150315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  40.34 
 
 
190 aa  124  9e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4479  Resolvase domain protein  38.74 
 
 
197 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000147912 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1852  Resolvase domain  38.74 
 
 
197 aa  124  9e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.064893  hitchhiker  0.000000000000388244 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4026  resolvase domain-containing protein  45.75 
 
 
298 aa  124  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.884346  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  42.08 
 
 
193 aa  123  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3683  resolvase domain-containing protein  44.57 
 
 
215 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  38.12 
 
 
183 aa  123  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>