116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4742 on replicon NC_009670
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  36.34 
 
 
1669 aa  863    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  37.76 
 
 
1669 aa  879    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  31.56 
 
 
1726 aa  743    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4914  helicase  33.8 
 
 
1706 aa  733    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  70.17 
 
 
1703 aa  2417    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  76.02 
 
 
1700 aa  2604    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4316  methyltransferase type 11  79.31 
 
 
1516 aa  2464    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4173  helicase domain-containing protein  35.22 
 
 
1575 aa  766    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4747  helicase domain-containing protein  32.65 
 
 
1925 aa  740    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.099466  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4301  helicase, C-terminal  32.83 
 
 
1649 aa  752    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.182147 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  36.75 
 
 
1642 aa  893    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  30.53 
 
 
1932 aa  688    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  76.29 
 
 
1748 aa  2609    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  100 
 
 
1702 aa  3456    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  76.55 
 
 
1417 aa  2175    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  74.63 
 
 
1697 aa  2555    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  55.49 
 
 
1693 aa  1781    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4540  helicase domain protein  35.08 
 
 
1606 aa  765    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  33.84 
 
 
2077 aa  900    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  75.05 
 
 
470 aa  712    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8083  helicase  77.04 
 
 
1211 aa  1842    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0239915  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  81.37 
 
 
1697 aa  2855    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  82.77 
 
 
1701 aa  2857    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  30.1 
 
 
1934 aa  665    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1824  helicase domain protein  33.62 
 
 
2098 aa  773    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5280  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
1594 aa  618  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00107926  unclonable  0.0024977 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4933  helicase domain protein  30.93 
 
 
1956 aa  585  1.0000000000000001e-165  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0160  Cpp14  27.19 
 
 
2117 aa  535  1e-150  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  30.24 
 
 
1674 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  29.76 
 
 
2274 aa  502  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  28.42 
 
 
2570 aa  453  1e-125  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2730  helicase domain protein  32.31 
 
 
1722 aa  450  1.0000000000000001e-124  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.52816  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5796  helicase domain-containing protein  35.52 
 
 
976 aa  429  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00607211  hitchhiker  2.23463e-19 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0870  SNF2-related protein  32.87 
 
 
2005 aa  412  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  60.07 
 
 
284 aa  306  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_002950  PG1500  hypothetical protein  27.77 
 
 
763 aa  235  5e-60  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00538454 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4475  helicase domain-containing protein  29.08 
 
 
761 aa  221  1e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0387  putative DNA methylase  27.48 
 
 
766 aa  190  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  58.92 
 
 
246 aa  186  3e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0847  hypothetical protein  34.3 
 
 
526 aa  129  5e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000203105 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7033  hypothetical protein  59.79 
 
 
97 aa  109  4e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2349  hypothetical protein  31.67 
 
 
341 aa  94.4  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0743518  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1570  hypothetical protein  31.25 
 
 
341 aa  92.4  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.447914  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0796  hypothetical protein  29.81 
 
 
339 aa  87.8  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3075  DEAD-like helicase  24.17 
 
 
1328 aa  82  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3018  helicase domain-containing protein  28.96 
 
 
678 aa  75.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5797  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
577 aa  72.4  0.00000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.295406  hitchhiker  4.23938e-17 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1468  adenine-specific DNA methylase  27.39 
 
 
254 aa  68.6  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00771536 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1466  SNF2 family helicase  23.31 
 
 
1379 aa  67  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.942792  normal  0.0166873 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4142  N-6 DNA methylase  27 
 
 
503 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  37.93 
 
 
894 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  29.74 
 
 
1116 aa  59.3  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2648  helicase domain protein  37.35 
 
 
950 aa  56.2  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5420  helicase domain-containing protein  35.05 
 
 
1046 aa  55.1  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1415  N-6 DNA methylase  26.5 
 
 
477 aa  55.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0877265  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1544  helicase-like protein  27.35 
 
 
933 aa  53.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1957  helicase domain-containing protein  28.21 
 
 
968 aa  53.5  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3534  EcoEI R domain-containing protein  32.76 
 
 
481 aa  53.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0122101  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1345  helicase domain protein  32.58 
 
 
953 aa  53.1  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0461  helicase domain-containing protein  26.42 
 
 
986 aa  53.1  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.838477  unclonable  0.0000248811 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3226  N-6 DNA methylase  32.76 
 
 
481 aa  52.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3672  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  27.17 
 
 
533 aa  52.4  0.00007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1254  N-6 DNA methylase  30.97 
 
 
484 aa  51.6  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0713487  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0031  N-6 DNA methylase  28.12 
 
 
539 aa  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.775177  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1514  methyltransferase small  33.33 
 
 
466 aa  51.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271049  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0503  helicase domain-containing protein  31.19 
 
 
1147 aa  51.6  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  34.12 
 
 
900 aa  51.2  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1301  helicase domain-containing protein  35.06 
 
 
958 aa  50.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2539  helicase domain-containing protein  26.43 
 
 
969 aa  51.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000371025  decreased coverage  0.000313651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1422  helicase domain protein  35.06 
 
 
958 aa  51.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2725  N-6 DNA methylase  25.95 
 
 
554 aa  50.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1282  N-6 DNA methylase  25.39 
 
 
481 aa  50.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  30.25 
 
 
468 aa  49.7  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  28.89 
 
 
1049 aa  50.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3118  helicase-like  30.49 
 
 
1065 aa  49.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.482312  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4237  helicase-like  30.49 
 
 
1065 aa  49.3  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00803691  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2863  N-6 DNA methylase  26.42 
 
 
500 aa  49.3  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1599  helicase domain protein  35.71 
 
 
889 aa  49.3  0.0007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0244124  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2172  helicase-like  37.31 
 
 
922 aa  48.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.338314  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0329  type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  27.86 
 
 
557 aa  48.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2591  helicase domain protein  32.18 
 
 
957 aa  48.9  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000604323 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0545  helicase-like  31.08 
 
 
910 aa  48.5  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2016  helicase domain-containing protein  34.57 
 
 
948 aa  48.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2730  helicase domain-containing protein  31.58 
 
 
945 aa  48.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7832  helicase domain protein  33.75 
 
 
941 aa  48.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0805  N-6 DNA methylase  29.8 
 
 
484 aa  48.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.614419  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2095  N-6 DNA methylase  33.9 
 
 
506 aa  48.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.866989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0554  modification methyltransferase  30.3 
 
 
423 aa  48.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.359419  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1706  helicase domain protein  30.77 
 
 
952 aa  48.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.703418  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  25.33 
 
 
1058 aa  47.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0512  type I restriction modification system M subunit (site-specific DNA-methyltransferase subunit)  21.54 
 
 
489 aa  47  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2961  N-6 DNA methylase  27.52 
 
 
530 aa  47  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1312  helicase domain-containing protein  34.12 
 
 
1046 aa  47  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.372927  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2557  helicase domain protein  31.58 
 
 
1117 aa  47  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.231387  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0199  N-6 DNA methylase  25.69 
 
 
506 aa  47.4  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.471881  decreased coverage  0.000223426 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  30.66 
 
 
1160 aa  47  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2671  helicase domain protein  33.77 
 
 
949 aa  47  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.672635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0502  N-6 DNA methylase  23.63 
 
 
493 aa  46.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.173184 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  30.11 
 
 
541 aa  46.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0012  helicase-like protein  29.91 
 
 
924 aa  46.6  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>