More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4698 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009671  Oant_4698  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
253 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4940  histidine utilization repressor  72.8 
 
 
254 aa  383  1e-105  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.72224  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4702  GntR family transcriptional regulator  66.95 
 
 
248 aa  351  7e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0392151  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1166  GntR family transcriptional regulator  55.98 
 
 
261 aa  285  4e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.448437  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5085  histidine utilization repressor  41.26 
 
 
248 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5035  histidine utilization repressor  41.7 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5172  histidine utilization repressor  41.26 
 
 
249 aa  190  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0429  histidine utilization repressor  41.26 
 
 
248 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.245315  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4909  GntR family transcriptional regulator  41.26 
 
 
248 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.429713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0358  histidine utilization repressor  40.36 
 
 
249 aa  189  5e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.824022  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0366  histidine utilization repressor  40.81 
 
 
273 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67420  histidine utilization genes repressor protein  40.71 
 
 
250 aa  182  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5838  histidine utilization repressor  40.71 
 
 
250 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2647  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  38.57 
 
 
251 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4559  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  38.86 
 
 
253 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5049  histidine utilization repressor  38.77 
 
 
251 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00586645  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1262  GntR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
244 aa  172  6.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1261  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.96 
 
 
247 aa  170  2e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0910  histidine utilization repressor  40.89 
 
 
245 aa  169  3e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0081  histidine utilization repressor  40.81 
 
 
234 aa  169  5e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2856  histidine utilization repressor  38.22 
 
 
255 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5005  histidine utilization repressor  39.01 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.697151 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3799  histidine utilization repressor  38.57 
 
 
231 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0816062 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0704  histidine utilization repressor  34.38 
 
 
234 aa  166  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240109  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4641  histidine utilization repressor  38.57 
 
 
231 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3722  histidine utilization repressor  38.57 
 
 
231 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0942262 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1813  histidine utilization repressor  39.64 
 
 
234 aa  165  5e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.167757 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2717  GntR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
255 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2946  histidine utilization repressor  40.09 
 
 
231 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.696218 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1531  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  40.09 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3606  histidine utilization repressor  38.57 
 
 
231 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2386  histidine utilization repressor  38.12 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1033  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  34.23 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5462  histidine utilization repressor  38.57 
 
 
231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0895  GntR family transcriptional regulator  37.67 
 
 
251 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0157  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.12 
 
 
245 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6916  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  35.65 
 
 
251 aa  162  6e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2920  histidine utilization repressor  38.74 
 
 
231 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1680  histidine utilization repressor  38.74 
 
 
231 aa  161  7e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2795  histidine utilization repressor  38.29 
 
 
231 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0646  histidine utilization repressor  38.29 
 
 
231 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2581  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 
247 aa  161  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5923  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.05 
 
 
251 aa  161  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.113874 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2365  histidine utilization repressor  38.29 
 
 
231 aa  161  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.366137  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2666  histidine utilization repressor  38.29 
 
 
231 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.154672  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2722  histidine utilization repressor  38.29 
 
 
231 aa  161  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3583  GntR family transcriptional regulator  35.12 
 
 
256 aa  160  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0099  histidine utilization repressor  39.46 
 
 
235 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3758  histidine utilization repressor  40.81 
 
 
235 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0153453 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2087  histidine utilization repressor  36.32 
 
 
231 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.286639  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0093  histidine utilization repressor  39.46 
 
 
235 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2210  histidine utilization repressor  36.32 
 
 
231 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4612  histidine utilization repressor  37.61 
 
 
245 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0980762  hitchhiker  0.00350601 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4839  histidine utilization repressor  39.01 
 
 
233 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2511  histidine utilization repressor  36.61 
 
 
255 aa  159  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0551986 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0082  histidine utilization repressor  38.84 
 
 
235 aa  160  3e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0098  histidine utilization repressor  39.46 
 
 
235 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3954  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family protein  37.93 
 
 
247 aa  159  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2112  histidine utilization repressor  36.61 
 
 
255 aa  159  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.869679  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0096  histidine utilization repressor  39.46 
 
 
235 aa  159  4e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2221  histidine utilization repressor  36.61 
 
 
255 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1821  histidine utilization repressor  37.39 
 
 
231 aa  159  5e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5616  histidine utilization repressor  37.61 
 
 
245 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.321981  normal  0.0803951 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5243  histidine utilization repressor  37.61 
 
 
245 aa  159  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.846899  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5445  histidine utilization repressor  37.17 
 
 
245 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0118538  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2188  histidine utilization repressor  35.87 
 
 
231 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.163062  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5906  histidine utilization repressor  35.87 
 
 
231 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4895  histidine utilization repressor  37.17 
 
 
245 aa  157  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.108836 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2171  histidine utilization repressor  35.87 
 
 
231 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.39027  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5481  histidine utilization repressor  35.87 
 
 
231 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.571458  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0505  histidine utilization repressor  37.89 
 
 
301 aa  157  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1099  histidine utilization repressor  35.87 
 
 
231 aa  156  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0075  histidine utilization repressor  37.17 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.510846  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3229  histidine utilization repressor  37.17 
 
 
245 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.259882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0825  histidine utilization repressor  34.82 
 
 
241 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0916  histidine utilization repressor  34.82 
 
 
241 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0397561  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0939  histidine utilization repressor  34.82 
 
 
241 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.997369  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0884  histidine utilization repressor  34.82 
 
 
241 aa  155  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0853  histidine utilization repressor  34.82 
 
 
241 aa  154  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4170  histidine utilization repressor  38.12 
 
 
234 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02076  hypothetical protein  34.8 
 
 
235 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4840  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  39.56 
 
 
267 aa  153  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.180839 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0078  histidine utilization repressor  37.67 
 
 
235 aa  154  2e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2078  histidine utilization repressor  35.09 
 
 
251 aa  153  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1750  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 
254 aa  152  5e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0970545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4448  histidine utilization repressor  36.94 
 
 
233 aa  152  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0721  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  37.84 
 
 
237 aa  152  7e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.274282  normal  0.4322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0148  histidine utilization repressor  35.56 
 
 
262 aa  151  8.999999999999999e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.387267 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1044  GntR family transcriptional regulator  34.82 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.523425  normal  0.272848 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0101  histidine utilization repressor  37.67 
 
 
235 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3644  histidine utilization repressor  34.22 
 
 
256 aa  151  1e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4253  histidine utilization repressor  37.67 
 
 
235 aa  150  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1294  histidine utilization repressor  36.73 
 
 
244 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1823  histidine utilization repressor  39.11 
 
 
267 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.325999  normal  0.489419 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2966  histidine utilization repressor  35.56 
 
 
260 aa  150  3e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0665384  normal  0.740013 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2882  transcriptional regulator, histidine utilization repressor, GntR family  36.04 
 
 
237 aa  149  3e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5105  histidine utilization repressor  37.84 
 
 
251 aa  149  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0431147  hitchhiker  0.00830494 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5106  histidine utilization repressor  39.46 
 
 
252 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0814369  hitchhiker  0.00493265 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4068  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
250 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232008  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1824  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126933  normal  0.484103 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>