77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4689 on replicon NC_009671
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009671  Oant_4689  putataive fimbrial chaperone protein  100 
 
 
238 aa  475  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5510  putative fimbrial chaperone protein  51.82 
 
 
252 aa  205  6e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4396  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  40.37 
 
 
239 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809922  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1269  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  36.89 
 
 
243 aa  135  8e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0558339  normal  0.0398715 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01137  pili assembly chaperone  37.06 
 
 
235 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0327551  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2293  hypothetical protein  37.13 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2993  hypothetical protein  37.13 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.810791  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1063  P pilus assembly protein, chaperone PapD  37.13 
 
 
236 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1070  putative pilus assembly chaperone  37.13 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0722  hypothetical protein  37.13 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.278946  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1606  hypothetical protein  37.13 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1222  hypothetical protein  37.13 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0849986  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1922  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  36.32 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2474  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  35.78 
 
 
237 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.631121  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0866  hypothetical protein  36.41 
 
 
236 aa  125  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00391209  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2340  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  36.9 
 
 
237 aa  123  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.200473 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1801  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  33.33 
 
 
258 aa  122  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.109168  normal  0.218111 
 
 
-
 
NC_003296  RS03042  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  36.54 
 
 
241 aa  122  5e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.168941  normal  0.259112 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5758  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  36.9 
 
 
236 aa  118  9e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.465618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1271  pili assembly chaperone  37.31 
 
 
244 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.760334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1961  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  31.72 
 
 
258 aa  112  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.156981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0007  chaperone protein EcpD  34.39 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0410847  hitchhiker  0.00437464 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0006  pilus chaperone protein, putative  34.39 
 
 
247 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0451749  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3334  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  32.26 
 
 
258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2460  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  31.53 
 
 
253 aa  110  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2361  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  32.26 
 
 
264 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200412  normal  0.497633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3670  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  30.88 
 
 
260 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.295639  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2818  putative fimbrial chaperone  30.13 
 
 
257 aa  102  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61530  putative pili assembly chaperone  32.04 
 
 
262 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.118155  normal  0.223638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5300  putative pili assembly chaperone  31.55 
 
 
262 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1447  putative fimbrial chaperone  30.13 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01133  pili assembly chaperone  33.15 
 
 
241 aa  98.6  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0694484  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0343  putative pilus assembly protein chaperone PapD  31.4 
 
 
241 aa  96.3  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2678  fimbrial assembly chaperone, putative  32.16 
 
 
279 aa  94.4  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1664  pilus assembly chaperone  28.21 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.74351  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2670  pilus assembly chaperone  28.21 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0194825 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1775  chaperone protein  28.21 
 
 
250 aa  93.2  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.241363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1830  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  31.63 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1398  putative fimbrial assembly chaperone  29.77 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0478  putative fimbrial assembly chaperone  29.77 
 
 
280 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.621456  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0875  fimbrial assembly chaperone, putative  29.77 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1792  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  29.77 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0680  putative fimbrial assembly chaperone  29.77 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.902912  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1635  fimbrial chaperone protein  29.77 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1613  type I pilus usher pathway chaperone CsuC  29.77 
 
 
279 aa  90.5  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2109  putative chaperone protein  27.98 
 
 
254 aa  90.1  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0024073 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4601  type 1 pili usher pathway chaperone CsuC  30.45 
 
 
288 aa  89.7  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0305  chaperone protein pmfD, putative  27.33 
 
 
243 aa  83.6  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.235097  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001217  pilus assembly protein chaperone PapD  25.22 
 
 
252 aa  82  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0779  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  25.13 
 
 
250 aa  76.6  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.765293  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3666  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  33.33 
 
 
250 aa  72  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.486976  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3600  P pilus assembly protein chaperone PapD-like  33.88 
 
 
250 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.173529  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2694  putative pili assembly chaperone transmembrane protein  27.75 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.25409 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0611  chaperone protein PmfD, putative  25.74 
 
 
245 aa  68.2  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.0000224808  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2058  putative P pilus assembly protein, chaperone PapD  26.61 
 
 
263 aa  66.6  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.62462e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3741  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  32.97 
 
 
250 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0536  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  30.65 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0210  putative chaperone protein EcpD  29.55 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.304462  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1267  pili assembly chaperone  31.5 
 
 
237 aa  60.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.475835 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0145  P pilus assembly protein chaperone PapD-like protein  29.5 
 
 
262 aa  58.9  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.195396  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4960  pili assembly chaperone  27.57 
 
 
234 aa  53.5  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0268456  normal  0.337439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51460  chaperone CupC  29.41 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0145666  hitchhiker  0.000165686 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1890  pili assembly chaperone  25.32 
 
 
259 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000417223 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1666  pili assembly chaperone  24.54 
 
 
252 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.212595  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4023  pili assembly chaperone  24.69 
 
 
246 aa  49.7  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4046  pili assembly chaperone  26.47 
 
 
272 aa  45.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1695  twin-arginine translocation pathway signal  26.21 
 
 
257 aa  44.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.734718  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0499  pili assembly chaperone  26.47 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298988  decreased coverage  0.000379472 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0167  pili assembly chaperone  26.47 
 
 
244 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3043  pili assembly chaperone  25.37 
 
 
249 aa  44.3  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000936481  normal  0.260101 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5937  pili assembly chaperone  26.29 
 
 
260 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1520  pili assembly chaperone  25.95 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1104  hypothetical protein  26.39 
 
 
271 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.176891  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2164  pili assembly chaperone  25.63 
 
 
243 aa  42.4  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4251  periplasmic pilus chaperone  25.38 
 
 
250 aa  42.4  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.253121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2273  pili assembly chaperone  25 
 
 
243 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03366  hypothetical protein  21.03 
 
 
227 aa  42  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>