47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4630 on replicon NC_009669
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009669  Oant_4630  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 
109 aa  217  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2639  hypothetical protein  52.43 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.690971  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1614  excisionase domain protein  49.52 
 
 
154 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.177236  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0234  DNA binding domain protein, excisionase family  49.52 
 
 
154 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.844329  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4162  DNA binding domain-containing protein  49.51 
 
 
155 aa  104  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0766794  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3464  DNA binding domain protein, excisionase family  49.51 
 
 
157 aa  103  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3385  DNA binding domain-containing protein  44.55 
 
 
150 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4367  DNA binding domain-containing protein  47.62 
 
 
155 aa  102  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.264021  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1265  DNA binding domain-containing protein  45.71 
 
 
156 aa  101  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2344  excisionase/Xis, DNA-binding  45.71 
 
 
156 aa  101  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000412399  unclonable  0.000000144936 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3239  putative excisionase protein  45.63 
 
 
153 aa  100  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0263514 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3752  DNA binding domain protein, excisionase family  46.08 
 
 
153 aa  97.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.152724  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4151  excisionase domain-containing protein  48.6 
 
 
157 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0695  DNA binding domain-containing protein  48.54 
 
 
153 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0623453  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20770  DNA-binding protein, excisionase family  45.63 
 
 
170 aa  93.2  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3924  DNA binding domain-containing protein  45 
 
 
152 aa  90.9  5e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3279  DNA binding domain-containing protein  51.65 
 
 
149 aa  90.5  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.746198  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3978  DNA binding domain-containing protein  44.86 
 
 
150 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.382776 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1776  excisionase/Xis, DNA-binding  46.81 
 
 
97 aa  87  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.666085  normal  0.0963925 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1635  DNA binding domain protein, excisionase family  41.75 
 
 
184 aa  84  7e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7903  DNA binding domain protein, excisionase family  44.66 
 
 
151 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13782  excisionase  37.86 
 
 
130 aa  78.6  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.696326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0047  DNA binding domain, excisionase family  47.06 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.509276  normal  0.343664 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4424  excisionase/Xis, DNA-binding  46.15 
 
 
152 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.412812  normal  0.513103 
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4435  DNA binding domain-containing protein  36.89 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.901637  normal  0.560095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0338  DNA binding domain-containing protein  50 
 
 
153 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04840  DNA-binding protein, excisionase family  40 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.287147  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1504  DNA binding domain protein, excisionase family  51.04 
 
 
151 aa  74.7  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.018572  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4763  excisionase/Xis, DNA-binding  33.98 
 
 
158 aa  70.9  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.180211 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1856  excisionase/Xis, DNA-binding  37.65 
 
 
174 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03470  DNA-binding protein, excisionase family  37.5 
 
 
178 aa  69.7  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.417608 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2993  DNA binding domain protein, excisionase family  39.33 
 
 
180 aa  69.3  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1445  DNA binding domain protein, excisionase family  39.18 
 
 
203 aa  68.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1962  hypothetical protein  80 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0383954 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3978  DNA binding domain-containing protein  41.56 
 
 
158 aa  66.2  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.27938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0072  DNA binding domain protein, excisionase family  39.56 
 
 
141 aa  65.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12334  excisionase  38.16 
 
 
114 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2889  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG subfamily  36.71 
 
 
167 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8221  DNA binding domain-containing protein  38.75 
 
 
149 aa  57  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3272  DNA binding domain protein, excisionase family  41.46 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0848  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 
127 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3800  DNA binding domain protein, excisionase family  37.08 
 
 
171 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1587  DNA binding domain-containing protein  35.29 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4008  DNA binding domain-containing protein  34.67 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0804  regulatory protein MerR  33.72 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0793  DNA binding domain protein, excisionase family  45.24 
 
 
178 aa  40.4  0.008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1273  DNA binding domain protein, excisionase family  42.86 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.33756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>