122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4419 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4419  Asp/Glu racemase  100 
 
 
243 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192959  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0679  Asp/Glu racemase  55.17 
 
 
236 aa  241  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0768431  normal  0.106443 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6274  hydantoin Racemase  56.79 
 
 
258 aa  239  4e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1988  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.06 
 
 
263 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.557931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2655  Asp/Glu/hydantoin racemase  55.56 
 
 
247 aa  238  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0404  Asp/Glu racemase  55.02 
 
 
232 aa  238  6e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000866633  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1925  putative hydantoin racemase  53.5 
 
 
288 aa  237  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6113  Asp/Glu racemase  52.65 
 
 
263 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1964  Asp/Glu racemase  52.65 
 
 
263 aa  237  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1952  Asp/Glu racemase  53.09 
 
 
279 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5279  Asp/Glu racemase  52.65 
 
 
263 aa  236  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0404858 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1509  hydantoin racemase  52.46 
 
 
280 aa  235  5e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.722971  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3302  hydantoin racemase  52.46 
 
 
280 aa  235  5e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2008  hydantoin racemase  52.46 
 
 
280 aa  235  5e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2389  hydantoin racemase  52.46 
 
 
280 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2534  racemase  52.24 
 
 
327 aa  234  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0701963  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1306  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.24 
 
 
278 aa  234  9e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.612078  normal  0.031069 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2433  hydantoin racemase  52.24 
 
 
318 aa  234  1e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2330  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.24 
 
 
288 aa  232  3e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.496574 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1879  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.7 
 
 
278 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.53096  normal  0.236918 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1297  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.48 
 
 
244 aa  231  7e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0750406  normal  0.408598 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2066  racemase  51.64 
 
 
287 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2916  Asp/Glu/hydantoin racemase  53.91 
 
 
247 aa  230  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.492378  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1301  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.07 
 
 
285 aa  229  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3529  Asp/Glu racemase  54.96 
 
 
243 aa  228  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.323338 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3936  Asp/Glu/hydantoin racemase  50.41 
 
 
245 aa  225  5e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.104662  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1874  hydantoin racemase  54.55 
 
 
243 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.139433  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1813  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.59 
 
 
245 aa  223  2e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0077  Asp/Glu racemase  50.41 
 
 
243 aa  222  4e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.45629  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0658  Asp/Glu/hydantoin racemase  52.12 
 
 
245 aa  220  1e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.184482  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3130  Asp/Glu racemase  52.26 
 
 
243 aa  221  1e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000715439 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0332  Asp/Glu racemase  53.81 
 
 
238 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1097  Asp/Glu racemase  49.79 
 
 
261 aa  217  2e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0470  Asp/Glu racemase  52.07 
 
 
243 aa  215  4e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3376  hydantoin racemase  50.62 
 
 
243 aa  211  9e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.732372 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5785  Asp/Glu racemase  52.16 
 
 
241 aa  207  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.415529  hitchhiker  0.00131329 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0868  Asp/Glu/hydantoin racemase  50 
 
 
245 aa  207  1e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.642238  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3768  putative hydantoin-racemase  51.75 
 
 
247 aa  204  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0210  Asp/Glu/hydantoin racemase  47.35 
 
 
247 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0948145 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0915  Asp/Glu racemase  50.42 
 
 
247 aa  201  1e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0900  Asp/Glu/hydantoin racemase  49.58 
 
 
244 aa  199  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.022197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0933  Asp/Glu racemase  43.59 
 
 
234 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3770  Asp/Glu/hydantoin racemase  40.82 
 
 
253 aa  170  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3171  Asp/Glu racemase  42.92 
 
 
240 aa  168  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.560944  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3637  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.55 
 
 
242 aa  166  4e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3412  Asp/Glu racemase  44.26 
 
 
247 aa  166  4e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2028  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.83 
 
 
240 aa  165  6e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4310  hydantoin racemase, putative  42.13 
 
 
242 aa  165  7e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1557  Asp/Glu racemase  42.13 
 
 
242 aa  165  7e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.365938  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3876  Asp/Glu/hydantoin racemase  42.13 
 
 
242 aa  163  2e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1755  Asp/Glu racemase  42.98 
 
 
242 aa  163  2e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2040  Asp/Glu racemase  44.26 
 
 
242 aa  160  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00180989  normal  0.15081 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4029  Asp/Glu racemase  43.15 
 
 
240 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.016763  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4337  Asp/Glu racemase  43.15 
 
 
240 aa  158  6e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.573919  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3495  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.15 
 
 
240 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.714298  hitchhiker  0.00106487 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4060  Asp/Glu racemase  50 
 
 
218 aa  157  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3193  Asp/Glu/hydantoin racemase  43.4 
 
 
252 aa  155  7e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3633  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  154  1e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.127614  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3334  HyuE hydantoin racemase  49.43 
 
 
205 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4855  Asp/Glu racemase  41.7 
 
 
258 aa  141  1e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.456805 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1023  Asp/Glu racemase  44.84 
 
 
220 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.493832  normal  0.560856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1033  Asp/Glu racemase  44.84 
 
 
220 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.026155  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1006  Asp/Glu racemase  44.84 
 
 
220 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.832843  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1759  hydantoin racemase  42.39 
 
 
205 aa  130  2e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3797  Asp/Glu racemase  35.98 
 
 
227 aa  111  1e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.175328  normal  0.366976 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7936  Asp/Glu/hydantoin racemase  32.08 
 
 
256 aa  110  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261217  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1486  Asp/Glu racemase  34.82 
 
 
229 aa  108  7e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.293318  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4136  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.09 
 
 
245 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.29444  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4023  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.09 
 
 
245 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7191  putative Hydantoin racemase  30.04 
 
 
249 aa  103  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425956  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0300  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.38 
 
 
248 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0552  Asp/Glu racemase  32.49 
 
 
248 aa  101  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.886079  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4993  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.25 
 
 
250 aa  97.8  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.561877  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0044  Asp/Glu racemase  30.08 
 
 
245 aa  94.7  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.399037  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3885  putative Asp/Glu racemase  29.24 
 
 
245 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4065  Asp/Glu racemase  28.96 
 
 
279 aa  93.6  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1336  hydantoin racemase  35.09 
 
 
250 aa  93.2  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000284571 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0094  Asp/Glu racemase  29.83 
 
 
239 aa  90.5  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4276  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.66 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0738  putative hydantoin racemase  27.97 
 
 
254 aa  89.7  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.304234  normal  0.968812 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08417  conserved hypothetical protein  31.62 
 
 
627 aa  88.6  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0467  Asp/Glu/hydantoin racemase  31.28 
 
 
250 aa  84.3  1e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4026  hydantoin racemase  28.64 
 
 
266 aa  83.2  3e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.997842 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2107  putative Hydantoin racemase HyuA  33.82 
 
 
212 aa  81.6  1e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4294  Asp/Glu racemase  32.9 
 
 
252 aa  80.1  3e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2139  Asp/Glu/hydantoin racemase  30 
 
 
239 aa  77  2e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0396546 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2031  putative hydantoin racemase  34.71 
 
 
252 aa  75.9  5e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3108  Asp/Glu racemase  32.34 
 
 
213 aa  73.6  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539324  normal  0.209365 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3463  putative hydantoin racemase  32.34 
 
 
213 aa  73.9  2e-12  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2068  Asp/Glu racemase  32.34 
 
 
213 aa  73.6  3e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.2159 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0955  hydantoin racemase  31.48 
 
 
231 aa  73.6  3e-12  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5610  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.88 
 
 
247 aa  70.5  2e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4863  Hydantoin racemase-like protein  25.6 
 
 
259 aa  69.3  6e-11  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.278835  normal  0.546582 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2076  Asp/Glu/hydantoin racemase  28.02 
 
 
245 aa  67  2e-10  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.491688 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0677  putative hydantoin racemase protein  28.5 
 
 
253 aa  65.5  7e-10  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0966453  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3382  hydantoin racemase  24.67 
 
 
229 aa  63.9  2e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1251  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.33 
 
 
250 aa  63.9  2e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0971  Asp/Glu racemase  30.13 
 
 
246 aa  62.8  5e-09  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0912948  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5804  Asp/Glu/hydantoin racemase  30.5 
 
 
226 aa  62  7e-09  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.372709  normal  0.802095 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5846  Asp/Glu/hydantoin racemase  29.05 
 
 
249 aa  60.8  2e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.963057  hitchhiker  0.000744144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>