More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4341 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 336 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  65.24 
 
 		 330 aa  444  1.0000000000000001e-124  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  47.86 
 
 		 333 aa  278  9e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  46.85 
 
 		 332 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  44.3 
 
 		 344 aa  259  4e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  45.71 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  42.37 
 
 		 330 aa  236  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  44.2 
 
 		 304 aa  186  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  40.99 
 
 		 300 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  35.77 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  31.58 
 
 		 344 aa  146  4.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  36.6 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3199  putative nitrous-oxide reductase protein NosX  39.66 
 
 		 302 aa  133  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  37.05 
 
 		 327 aa  132  6e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  36.3 
 
 		 320 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  38.74 
 
 		 264 aa  132  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  34.1 
 
 		 325 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  33.92 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  32.29 
 
 		 337 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2485  ApbE family lipoprotein  34.59 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.664042 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0685  ApbE family lipoprotein  32.35 
 
 		 298 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0743531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  31.84 
 
 		 344 aa  122  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  32.49 
 
 		 325 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  30.33 
 
 		 336 aa  119  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  29.23 
 
 		 352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.02 
 
 		 357 aa  116  6.9999999999999995e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 		 381 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  31.02 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3097  ApbE family lipoprotein  31.54 
 
 		 338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  29.62 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  28.18 
 
 		 323 aa  109  6e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  28.47 
 
 		 348 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  27.11 
 
 		 350 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  28.71 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  29.19 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  29.06 
 
 		 329 aa  106  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.47 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  28.1 
 
 		 315 aa  105  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  29.55 
 
 		 336 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  27.61 
 
 		 308 aa  103  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  35.54 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  28.77 
 
 		 306 aa  103  5e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  31.25 
 
 		 349 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  32.77 
 
 		 347 aa  103  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  29.15 
 
 		 336 aa  101  2e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  32.61 
 
 		 355 aa  99.8  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  31.03 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  28.92 
 
 		 339 aa  99.8  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  26.74 
 
 		 328 aa  99.8  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30.28 
 
 		 337 aa  99  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 		 351 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  27.73 
 
 		 345 aa  99  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  26.47 
 
 		 316 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5069  ApbE family lipoprotein  28.31 
 
 		 336 aa  98.6  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  28.41 
 
 		 310 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  29.74 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0458  ApbE-like lipoprotein  28.87 
 
 		 341 aa  98.2  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  26.76 
 
 		 363 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00751  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.79 
 
 		 350 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.182367  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 360 aa  96.7  5e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  28.32 
 
 		 344 aa  96.3  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  28.38 
 
 		 417 aa  95.9  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3816  ApbE family lipoprotein  29.29 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00039468 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  27.24 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0942  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 374 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.324541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1884  ApbE family lipoprotein  29.84 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.717042  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2187  ApbE family lipoprotein  30.83 
 
 		 336 aa  94.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  24.83 
 
 		 335 aa  94  3e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1127  ApbE family lipoprotein  31.03 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.390448  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0944  ApbE family lipoprotein  25.82 
 
 		 374 aa  94  3e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  28.57 
 
 		 353 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  0.000000000324218 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.18 
 
 		 349 aa  93.6  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0955  ApbE family lipoprotein  27.8 
 
 		 337 aa  93.6  4e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0462769  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2533  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  26.4 
 
 		 341 aa  94  4e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.903036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  32.1 
 
 		 386 aa  93.6  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  24.83 
 
 		 323 aa  93.2  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0980  ApbE family lipoprotein  25.45 
 
 		 374 aa  93.2  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.84365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0946  ApbE family lipoprotein  28 
 
 		 347 aa  92.8  7e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3425  ApbE family lipoprotein  28.99 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  28.05 
 
 		 361 aa  91.7  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  26.6 
 
 		 317 aa  92  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12123  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  28.47 
 
 		 334 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.000732987  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  27.94 
 
 		 342 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3557  ApbE family lipoprotein  27.9 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0055272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3360  ApbE family lipoprotein  27.9 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00766501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3432  ApbE family lipoprotein  27.9 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0771789  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  26.56 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1826  ApbE family lipoprotein  29.86 
 
 		 300 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000850306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0930  ApbE family lipoprotein  27.9 
 
 		 348 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.67844  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  31.09 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  26.3 
 
 		 366 aa  89.7  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2151  ApbE family lipoprotein  29.5 
 
 		 300 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0607428  normal  0.340699 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1109  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.82 
 
 		 347 aa  88.2  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  32.17 
 
 		 345 aa  88.2  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1135  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.930021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3407  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 297 aa  87  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.935025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  29.01 
 
 		 350 aa  86.3  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>