More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4322 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4322  phage integrase family protein  100 
 
 
193 aa  394  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205034  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1228  hypothetical protein  57.25 
 
 
137 aa  159  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.505674  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  38.02 
 
 
189 aa  122  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  37.11 
 
 
189 aa  121  7e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  36.65 
 
 
188 aa  120  8e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  37.5 
 
 
189 aa  119  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  36.65 
 
 
188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  34.87 
 
 
193 aa  110  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0140  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  101  8e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2063  phage integrase family protein  31.58 
 
 
188 aa  99.4  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.668188  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  32.47 
 
 
190 aa  97.8  9e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2946  phage integrase family protein  31.09 
 
 
190 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.329988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1075  integrase family protein  32.02 
 
 
190 aa  85.9  4e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5700  integrase family protein  30.32 
 
 
226 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6742  integrase family protein  32.65 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3476  integrase family protein  29.12 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5382  phage integrase  29.22 
 
 
228 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.31221  hitchhiker  0.00239771 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  29.17 
 
 
301 aa  67  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.64 
 
 
324 aa  63.5  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.12 
 
 
324 aa  63.2  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0563  phage integrase family protein  31.65 
 
 
191 aa  61.2  0.000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  hitchhiker  0.00000738062  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0945  phage integrase family protein  31.65 
 
 
211 aa  61.2  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.237394  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  29.41 
 
 
322 aa  60.1  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  29.53 
 
 
299 aa  58.9  0.00000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  33.54 
 
 
301 aa  57.8  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4451  phage integrase  26.85 
 
 
229 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.07 
 
 
294 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4571  integrase family protein  26.92 
 
 
221 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.624666  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  30.41 
 
 
294 aa  56.2  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  28.34 
 
 
414 aa  55.8  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  31.87 
 
 
305 aa  55.5  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  27.01 
 
 
292 aa  55.5  0.0000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0063  tyrosine recombinase XerC  32.28 
 
 
304 aa  55.5  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  27.91 
 
 
310 aa  55.1  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  30.06 
 
 
320 aa  55.1  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  30.26 
 
 
294 aa  53.9  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  28.29 
 
 
317 aa  54.3  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  31.58 
 
 
332 aa  53.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  31.68 
 
 
304 aa  53.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0123  hypothetical protein  41.67 
 
 
71 aa  53.9  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.262124  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  28.66 
 
 
307 aa  53.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  28.21 
 
 
302 aa  53.1  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  26.79 
 
 
270 aa  53.5  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  30.67 
 
 
412 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3145  integrase family protein  25.6 
 
 
438 aa  52.8  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00138908  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 
303 aa  52.4  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  28.31 
 
 
301 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  31.85 
 
 
323 aa  52.4  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.43 
 
 
307 aa  52.4  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  30 
 
 
313 aa  52.4  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  31.79 
 
 
303 aa  52.4  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  29.95 
 
 
306 aa  52  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  28.21 
 
 
313 aa  52  0.000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.75 
 
 
404 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  31.45 
 
 
311 aa  52  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  27.53 
 
 
273 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  30.19 
 
 
302 aa  51.6  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  29.76 
 
 
316 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4358  phage integrase family protein  25.48 
 
 
221 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.436387  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  29.22 
 
 
306 aa  51.6  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1196  tyrosine recombinase XerD  31.55 
 
 
309 aa  51.6  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0670859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 
304 aa  51.2  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  28.88 
 
 
392 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  27.56 
 
 
297 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  27.57 
 
 
310 aa  50.8  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  24.29 
 
 
306 aa  50.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0083  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.3 
 
 
322 aa  51.2  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  28.57 
 
 
308 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  28.24 
 
 
299 aa  50.4  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  28.66 
 
 
314 aa  50.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 
302 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  25 
 
 
176 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2649  phage integrase family protein  32.5 
 
 
381 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.833719 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 
302 aa  50.1  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  28.65 
 
 
310 aa  50.1  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 
304 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  27.17 
 
 
298 aa  50.4  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  28.07 
 
 
308 aa  49.3  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  30.99 
 
 
298 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.21 
 
 
298 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  25.79 
 
 
303 aa  49.7  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 
298 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  28.48 
 
 
326 aa  48.9  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  32.48 
 
 
304 aa  48.9  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  28.74 
 
 
305 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.94 
 
 
302 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0602  phage integrase family protein  29.88 
 
 
412 aa  49.3  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 
300 aa  49.3  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.41 
 
 
330 aa  48.9  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 
298 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2439  integrase family protein  31.53 
 
 
283 aa  48.9  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000285613  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.05 
 
 
298 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3258  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 
310 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.706598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0392  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 
310 aa  48.5  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  30.81 
 
 
317 aa  48.9  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  27.49 
 
 
295 aa  48.9  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0801  phage integrase family protein  28.4 
 
 
326 aa  48.5  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2920  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 
310 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.510567  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2169  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 
310 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.126979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0195  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.25 
 
 
310 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>