97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4268 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  298  3e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  84.21 
 
 
155 aa  243  8e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  83.55 
 
 
155 aa  240  3.9999999999999997e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  51.66 
 
 
153 aa  156  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  49.66 
 
 
150 aa  145  3e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  48 
 
 
153 aa  144  6e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  48 
 
 
151 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  52.67 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  44.22 
 
 
147 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  43.48 
 
 
150 aa  127  6e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  42.95 
 
 
149 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  45.07 
 
 
152 aa  120  6e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  46.04 
 
 
147 aa  120  7e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  47.59 
 
 
148 aa  118  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  44.67 
 
 
153 aa  114  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  47.3 
 
 
148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  42.67 
 
 
144 aa  112  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  39.87 
 
 
149 aa  110  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  41.84 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  47.95 
 
 
149 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  35.66 
 
 
148 aa  103  8e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  42.14 
 
 
151 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  40 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  37.66 
 
 
151 aa  99  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  44.68 
 
 
151 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  38.89 
 
 
138 aa  97.8  5e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  38.1 
 
 
143 aa  95.5  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  38.19 
 
 
150 aa  95.1  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  35.71 
 
 
151 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  41.27 
 
 
144 aa  91.3  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  37.75 
 
 
153 aa  90.9  5e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  35.81 
 
 
153 aa  88.2  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  37.1 
 
 
150 aa  85.5  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  34.01 
 
 
153 aa  84.3  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  34.71 
 
 
151 aa  84  8e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  34.71 
 
 
151 aa  84  8e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  36.29 
 
 
147 aa  83.2  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  33.88 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  33.88 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  33.88 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  33.88 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  33.88 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  34.71 
 
 
152 aa  81.3  0.000000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  33.88 
 
 
152 aa  80.9  0.000000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  35.25 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  35.25 
 
 
149 aa  80.1  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  34.11 
 
 
150 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  28.86 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  35.25 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  35.25 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  35.25 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  35.25 
 
 
150 aa  73.9  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  36.36 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  32 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  31.58 
 
 
152 aa  66.2  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  28.67 
 
 
154 aa  63.5  0.0000000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  26.97 
 
 
153 aa  63.2  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  31.79 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  30 
 
 
165 aa  59.7  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  34.23 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  28.68 
 
 
140 aa  57  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  29.41 
 
 
140 aa  57.4  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  29.25 
 
 
157 aa  56.6  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2452  hypothetical protein  31.87 
 
 
165 aa  51.2  0.000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  36.96 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  27.21 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  25.18 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1630  protein of unknown function DUF107  24.79 
 
 
143 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.159398  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4507  hypothetical protein  29.58 
 
 
153 aa  48.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0857402  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  23.02 
 
 
145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1615  hypothetical protein  27.21 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3388  hypothetical protein  27.59 
 
 
153 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000297052  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  32.09 
 
 
144 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  23.74 
 
 
143 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  25.64 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0648  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity, NfeD-like  26.43 
 
 
150 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.24585  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  23.02 
 
 
145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0414  hypothetical protein  29.37 
 
 
155 aa  45.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0427482  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3401  hypothetical protein  30.99 
 
 
153 aa  45.1  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  24.46 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  25.17 
 
 
151 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0469  hypothetical protein  29.45 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000206621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0490  hypothetical protein  29.45 
 
 
156 aa  43.9  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0052  protein of unknown function DUF107  23.78 
 
 
158 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3149  hypothetical protein  31.58 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.722841  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  24.67 
 
 
149 aa  43.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3850  hypothetical protein  29.45 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0149984  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2129  hypothetical protein  26.39 
 
 
496 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  29.55 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  28.78 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0463  hypothetical protein  28.17 
 
 
157 aa  42.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000652394  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0493  protein of unknown function DUF107  27.78 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000358021  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1621  hypothetical protein  24.65 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0545  hypothetical protein  27.4 
 
 
156 aa  40.8  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000254909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1412  hypothetical protein  34.15 
 
 
200 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>