More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4176 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4176  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
346 aa  699  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1122  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  83.82 
 
 
334 aa  556  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.124728  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1027  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  83.82 
 
 
334 aa  556  1e-157  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1697  periplasmic solute binding protein  56.66 
 
 
347 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.668207  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2384  periplasmic solute binding protein  57.53 
 
 
351 aa  368  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.691591  normal  0.896834 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2718  periplasmic solute binding protein  55.26 
 
 
344 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11219  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2184  ABC transporter substrate binding protein (zinc)  54.46 
 
 
308 aa  349  3e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.2291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4006  periplasmic solute binding protein  52.35 
 
 
303 aa  335  1e-90  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0312  periplasmic solute binding protein  44.26 
 
 
362 aa  276  5e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1704  putative high-affinity zinc uptake system protein  43.85 
 
 
356 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0200273  normal  0.0153509 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3183  periplasmic solute binding protein  38.42 
 
 
371 aa  266  4e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0392805  normal  0.124808 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1730  periplasmic solute binding protein  41.19 
 
 
313 aa  262  6e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2751  periplasmic solute binding protein  43.36 
 
 
332 aa  260  2e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1194  periplasmic solute binding protein  39.09 
 
 
329 aa  241  1e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.170646 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1712  periplasmic solute binding protein  39.12 
 
 
369 aa  216  4e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.333525  normal  0.532025 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2050  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.59 
 
 
314 aa  212  6e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.153419  normal  0.0811015 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2593  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.59 
 
 
310 aa  212  6e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00016843  normal  0.856449 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2045  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.59 
 
 
314 aa  212  8e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2105  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.59 
 
 
314 aa  212  8e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.060713  normal  0.639588 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1357  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.59 
 
 
314 aa  212  8e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00461561 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1233  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.59 
 
 
314 aa  212  8e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00176582  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1775  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.28 
 
 
310 aa  210  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  6.50264e-07  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01828  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.28 
 
 
310 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0190601  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01816  hypothetical protein  36.28 
 
 
310 aa  210  3e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0117492  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1951  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.28 
 
 
310 aa  210  3e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00866903  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1783  periplasmic solute binding protein  36.28 
 
 
328 aa  209  4e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  9.35054e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2142  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.1 
 
 
340 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000717331  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1329  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.96 
 
 
352 aa  209  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00390701  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0953  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.28 
 
 
310 aa  209  8e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0035869  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2087  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.96 
 
 
310 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  1.65105e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  39.49 
 
 
334 aa  208  1e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1827  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.07 
 
 
339 aa  205  7e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0735941  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2251  high-affinity zinc transporter periplasmic component  33.04 
 
 
340 aa  206  7e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000558415  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2426  high-affinity zinc transporter periplasmic component  36.91 
 
 
314 aa  205  9e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000208109  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2111  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.48 
 
 
339 aa  201  1e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0209857  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2027  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.02 
 
 
318 aa  199  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  1.30529e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2773  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.69 
 
 
321 aa  199  8e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  6.94266e-06  hitchhiker  0.00715956 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2140  high-affinity zinc transporter periplasmic component  34.7 
 
 
318 aa  198  1e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  2.51275e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0275  periplasmic solute binding protein  34.11 
 
 
313 aa  197  2e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00830  ABC transporter, periplasmic binding protein  33.43 
 
 
297 aa  196  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0059  periplasmic solute binding protein  33.13 
 
 
309 aa  195  8e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6299  putative adhesin  33.24 
 
 
307 aa  192  6e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3616  periplasmic solute binding protein  34.99 
 
 
378 aa  190  3e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0144381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72550  putative adhesin  32.65 
 
 
307 aa  190  3e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3253  periplasmic solute binding protein  36.34 
 
 
347 aa  189  7e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0556768 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004106  zinc ABC transporter-binding protein ZnuA  31.44 
 
 
295 aa  185  8e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0852  high-affinity zinc uptake system protein ZnuA precursor  33.64 
 
 
297 aa  183  5e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0338292  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5108  periplasmic solute binding protein  32.94 
 
 
302 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.166633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0137  periplasmic solute binding protein  33.04 
 
 
302 aa  174  2e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0120  periplasmic solute binding protein  32.74 
 
 
302 aa  173  3e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.463624  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5268  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30.03 
 
 
311 aa  173  5e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0135  periplasmic solute binding protein  32.07 
 
 
318 aa  172  6e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.972392 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3571  ABC zinc transporter, periplasmic binding protein ZnuA  34.62 
 
 
345 aa  171  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4140  periplasmic solute binding protein  32.92 
 
 
326 aa  172  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.101102 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3151  hypothetical protein  34.36 
 
 
336 aa  158  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.506548 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0248  periplasmic solute binding protein  27.46 
 
 
287 aa  152  6e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01361  hypothetical protein  40.72 
 
 
293 aa  149  6e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1122  periplasmic solute binding protein  42.51 
 
 
328 aa  147  2e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1667  zinc ABC transporter, periplasmic zinc-binding protein  30 
 
 
297 aa  145  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0937  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  30.19 
 
 
293 aa  145  1e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.388709  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0842  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.81 
 
 
282 aa  141  1e-32  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.290902  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1892  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 
321 aa  137  2e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00897518  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0577  periplasmic solute binding protein  27.51 
 
 
301 aa  134  2e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.289421  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1256  high-affinity zinc transporter periplasmic component  35.8 
 
 
372 aa  132  8e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000280798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4495  periplasmic solute binding protein  39.33 
 
 
350 aa  126  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0139  adhesion protein, putative  26.67 
 
 
294 aa  123  4e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0377699  normal  0.42131 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  31.55 
 
 
310 aa  120  4e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  34.52 
 
 
311 aa  110  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3437  periplasmic solute binding protein  30.18 
 
 
358 aa  107  3e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18946 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  29.19 
 
 
333 aa  107  3e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3227  periplasmic solute binding protein  30.69 
 
 
312 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0202963  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0989  periplasmic solute binding protein  25.59 
 
 
295 aa  103  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30.68 
 
 
311 aa  103  6e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 
345 aa  102  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 
368 aa  100  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2476  periplasmic solute binding protein  25.78 
 
 
313 aa  99.4  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00202006  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  31.03 
 
 
307 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3814  periplasmic solute binding protein  33.94 
 
 
331 aa  99  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.906416  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  26.02 
 
 
307 aa  98.2  2e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.52 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  29.83 
 
 
312 aa  96.7  6e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  31.87 
 
 
303 aa  96.3  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  27.76 
 
 
346 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.52 
 
 
323 aa  95.9  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  27.78 
 
 
318 aa  95.5  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  24.74 
 
 
339 aa  94  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  27.64 
 
 
304 aa  94.4  3e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0930  periplasmic solute binding protein  33.13 
 
 
292 aa  93.6  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.933909  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  26.76 
 
 
353 aa  93.2  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.0108e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.95 
 
 
315 aa  93.2  6e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1674  adhesion protein, putative  31.1 
 
 
311 aa  92.8  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0484174  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  28.68 
 
 
292 aa  92.8  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  29.38 
 
 
292 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  25.78 
 
 
322 aa  92.4  1e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1234  laminin-binding surface protein  35.42 
 
 
306 aa  92.4  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  4.44188e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.73282e-06  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4768  periplasmic solute binding protein  27.93 
 
 
509 aa  90.5  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.474869  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.73 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  33.89 
 
 
311 aa  90.1  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  23.73 
 
 
323 aa  90.1  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>