More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4145 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 
247 aa  488  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  77.54 
 
 
247 aa  372  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  69.67 
 
 
244 aa  345  4e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  39.83 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0204  GntR family transcriptional regulator  39.5 
 
 
249 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.168827  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
248 aa  161  7e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  37.82 
 
 
243 aa  161  8.000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
243 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
258 aa  159  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5014  GntR family transcriptional regulator  38.66 
 
 
249 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153895  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0551  GntR family transcriptional regulator  43.78 
 
 
268 aa  158  1e-37  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 
225 aa  156  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  38.89 
 
 
249 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1959  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
256 aa  156  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.622516  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1995  GntR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
256 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.795702  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34690  transcriptional regulator, GntR family  38.2 
 
 
244 aa  154  9e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0368161  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
261 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  38.46 
 
 
261 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5286  GntR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
256 aa  154  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0794477 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1886  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
256 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.255199  normal  0.682445 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3164  GntR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
248 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.61715  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  40.6 
 
 
240 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  37.34 
 
 
247 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8309  putative transcriptional regulator, GntR family  39.83 
 
 
239 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0848138  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2911  GntR family transcriptional regulator  39.17 
 
 
242 aa  141  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.786212  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3697  transcriptional regulator, GntR family  38.56 
 
 
246 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  36.48 
 
 
243 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7722  transcriptional regulator, GntR family  36.97 
 
 
269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0913  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0856  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0404  transcriptional regulator, GntR family  37.61 
 
 
249 aa  138  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2586  transcriptional regulator, GntR family  38.98 
 
 
241 aa  138  8.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
255 aa  137  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
241 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1454  GntR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
255 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0554  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.799552  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  33.76 
 
 
241 aa  136  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4162  transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 
195 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000200129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 
270 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1076  transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 
195 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111341  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4073  transcriptional regulator, GntR family  39.59 
 
 
195 aa  135  8e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0292067 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0783  GntR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
248 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3182  transcriptional regulator, GntR family  35.32 
 
 
248 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.659988  hitchhiker  0.001615 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0552  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
248 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0339408 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0560  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 
244 aa  131  7.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.645686  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
260 aa  131  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  37.29 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2556  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000796144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4156  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
244 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1920  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2532  GntR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00685301  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  33.92 
 
 
252 aa  129  3e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  38.91 
 
 
256 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2450  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000263261 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2580  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.496201  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1196  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
248 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2257  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0946  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.406281  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1100  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.100378  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5864  GntR family transcriptional regulator  34.89 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.564885  normal  0.734875 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 
245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0754  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.304598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2130  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0949  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0552  GntR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
248 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689242  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2743  GntR family transcriptional regulator  35.59 
 
 
244 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.927097  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  37.32 
 
 
246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  38.39 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1312  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
243 aa  126  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.483973 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0534  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
244 aa  126  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.237769  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0292  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
244 aa  126  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2878  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
244 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3168  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
244 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0138  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
244 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.417671  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0720  GntR family regulatory protein  36.4 
 
 
244 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.035737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0551  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
244 aa  125  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1450  GntR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
244 aa  125  6e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2212  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
244 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.189171  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2885  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
244 aa  125  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.790974  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2825  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
244 aa  125  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.214074  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0763  GntR family transcriptional regulator  34.47 
 
 
248 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237996 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6155  GntR family transcriptional regulator  36.17 
 
 
244 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272713  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2836  GntR family transcriptional regulator  35.17 
 
 
244 aa  125  9e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0446  GntR family transcriptional regulator  35.98 
 
 
244 aa  124  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4132  transcriptional regulator, GntR family  36.17 
 
 
257 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.253888 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0114  transcriptional regulator  34.63 
 
 
239 aa  123  2e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  1.19312e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0267  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
248 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3203  transcriptional regulator, GntR family  29.54 
 
 
249 aa  123  3e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1074  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 
242 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000120399  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3408  GntR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
254 aa  123  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
239 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1473  transcriptional regulator, GntR family  39.5 
 
 
285 aa  122  6e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
239 aa  122  6e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  37.33 
 
 
244 aa  122  7e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3803  transcriptional regulator, GntR family  35.74 
 
 
257 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.596979 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>