56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_4119 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_4119  PTS system galactitol-specific IIC component  100 
 
 
469 aa  904    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00198911  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2223  PTS system galactitol-specific IIC component  84.19 
 
 
469 aa  744    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.756682 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0036  PTS system Galactitol-specific IIC component  48.06 
 
 
453 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0235  galacitol PTS, EIIC  46.15 
 
 
445 aa  379  1e-104  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0238  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  44.76 
 
 
419 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0232  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  44.76 
 
 
419 aa  376  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3157  PTS system Galactitol-specific IIC component  45.82 
 
 
448 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3720  PTS system Galactitol-specific IIC component  44.73 
 
 
415 aa  352  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.260527  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3615  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  37.47 
 
 
457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.772252  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3447  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  37.47 
 
 
457 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3518  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  37.47 
 
 
457 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3555  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  37.47 
 
 
457 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3449  PTS family galactitol-specific enzyme IIC  37.47 
 
 
457 aa  329  7e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4825  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  39.82 
 
 
452 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3769  PEP-dependent sugar transporting PTS family, IIC component  39.82 
 
 
452 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0034  PTS system Galactitol-specific IIC component  41.77 
 
 
454 aa  323  3e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0152  PTS system Galactitol-specific IIC component  42.42 
 
 
474 aa  324  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0975812  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1146  PTS system, galactitol-specific IIC component  39.31 
 
 
451 aa  323  5e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02018  galactitol-specific enzyme IIC component of PTS  39.31 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1566  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  39.31 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00428994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2228  PTS system, galactitol-specific IIC component  39.31 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.921668  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3071  PTS system, galactitol-specific IIC component  39.31 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000414376 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01984  hypothetical protein  39.31 
 
 
451 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0972  PTS system, galactitol-specific IIC component  39.31 
 
 
451 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.487394 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1555  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  39.08 
 
 
451 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2380  PTS system, galactitol-specific IIC component  39.08 
 
 
451 aa  319  7.999999999999999e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1142  PTS system, galactitol-specific IIC component  37.19 
 
 
452 aa  308  1.0000000000000001e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3992  PTS system, galactitol-specific IIC component  38.68 
 
 
452 aa  300  2e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6918  normal  0.82636 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4008  PTS system, galactitol-specific IIC component  38.68 
 
 
452 aa  299  7e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4063  PTS system galactitol-specific transporter subunit IIC  38.44 
 
 
452 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  0.771643 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4113  PTS system galactitol-specific IIC component  38.44 
 
 
452 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3385  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  37.08 
 
 
463 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0012361  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3260  galacitol pts, eiic  37.77 
 
 
456 aa  276  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0579049  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1642  PTS system galactitol-specific IIC component  38.03 
 
 
456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000536368 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04131  hypothetical protein  35.4 
 
 
437 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3696  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  35.4 
 
 
437 aa  271  2e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04169  predicted phosphotransferase enzyme IIC component  35.4 
 
 
437 aa  271  2e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3750  PTS system, galactitol-specific IIC subunit  34.38 
 
 
440 aa  268  1e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0123  PTS system galactitol-specific IIC component  37.34 
 
 
459 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0161618  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1731  PTS system, IIc component  35.89 
 
 
437 aa  263  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1728  PTS system transporter subunit IIC  35.89 
 
 
437 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.118537  normal  0.433855 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1728  PTS system transporter subunit IIC  35.89 
 
 
437 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.259528  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1547  PTS system, IIc component  35.89 
 
 
437 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1792  PTS system IIc component  35.64 
 
 
437 aa  262  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0216  PTS system Galactitol-specific IIC component  33.33 
 
 
421 aa  257  4e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1734  PTS system Galactitol-specific IIC component  33.98 
 
 
453 aa  237  3e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3255  PTS system galactitol-specific IIC component  34.38 
 
 
417 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0413472  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1647  PTS system galactitol-specific IIC component  33.5 
 
 
417 aa  229  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444163 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3552  PTS system Galactitol-specific IIC component  28.85 
 
 
469 aa  210  4e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1805  PTS system, IIC component, putative  27.48 
 
 
483 aa  181  2.9999999999999997e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1836  galacitol PTS, EIIC  27.51 
 
 
484 aa  165  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000025524  normal  0.329345 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1400  PTS system Galactitol-specific IIC component  29.73 
 
 
440 aa  163  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1671  PTS system galactitol-specific IIC component  27.47 
 
 
470 aa  162  2e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000013892  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1933  PTS system, IIC component, putative  27.27 
 
 
482 aa  136  9e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.527241  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1835  galacitol PTS, EIIC  26.61 
 
 
438 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.372507 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0497  galactitol PTS, EIIC  25.85 
 
 
472 aa  122  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000187938  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>