More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3915 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  100 
 
 		 332 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0755  iron compound ABC transporter, permease protein  90.45 
 
 		 347 aa  533  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.239373  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0704  iron compound ABC transporter, permease protein  89.81 
 
 		 328 aa  529  1e-149  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4080  transport system permease protein  84.39 
 
 		 347 aa  525  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  70.85 
 
 		 336 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  70.09 
 
 		 340 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1137  transport system permease protein  73.79 
 
 		 342 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2981  transport system permease protein  64.69 
 
 		 353 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.861253  normal  0.24381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1928  transport system permease protein  65.59 
 
 		 335 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755913 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2274  transport system permease protein  64.24 
 
 		 346 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.687817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1361  transport system permease protein  63.3 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  64.42 
 
 		 346 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2417  transport system permease protein  65.61 
 
 		 339 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.972091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3278  transport system permease protein  65.29 
 
 		 338 aa  363  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3391  ABC Fe3+-siderophores transporter, inner membrane subunit  69.58 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.581639  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3037  transport system permease protein  69.58 
 
 		 344 aa  360  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2057  transport system permease protein  66.56 
 
 		 338 aa  360  3e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.441726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4223  transport system permease protein  60.84 
 
 		 346 aa  359  4e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  57.36 
 
 		 346 aa  329  3e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  57.36 
 
 		 346 aa  328  6e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3206  transport system permease protein  54.18 
 
 		 345 aa  320  3e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1652  transport system permease protein  59.09 
 
 		 340 aa  318  1e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0442  transport system permease protein  56.17 
 
 		 356 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.168478 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1609  transport system permease protein  50.31 
 
 		 338 aa  272  6e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0190407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2707  transport system permease protein  50.17 
 
 		 340 aa  269  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  46.01 
 
 		 351 aa  237  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.12 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  41.77 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3774  transport system permease protein  41 
 
 		 348 aa  206  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0402  transport system permease protein  41.61 
 
 		 352 aa  202  8e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2321  transport system permease protein  39.75 
 
 		 346 aa  200  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3915  transport system permease protein  41.01 
 
 		 360 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.045675  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  42.95 
 
 		 369 aa  199  3.9999999999999996e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17620  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  43.65 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0605  transport system permease protein  42.01 
 
 		 340 aa  196  3e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21270  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  39.51 
 
 		 367 aa  196  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.709289  normal  0.431946 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2654  transport system permease protein  45.52 
 
 		 382 aa  194  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00408489  normal  0.22547 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2099  transport system permease protein  41.2 
 
 		 350 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  43.51 
 
 		 356 aa  190  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  39.87 
 
 		 358 aa  191  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4564  transport system permease protein  39.42 
 
 		 340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.12 
 
 		 337 aa  189  5.999999999999999e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4784  transport system permease protein  41.43 
 
 		 353 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1290  hypothetical protein  34.97 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.385136 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4830  transport system permease protein  40.54 
 
 		 341 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2583  transport system permease protein  42.11 
 
 		 373 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.1 
 
 		 370 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1332  transport system permease protein  41.34 
 
 		 346 aa  185  8e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3575  transport system permease protein  38.26 
 
 		 332 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202731  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  40.78 
 
 		 363 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5563  hemin ABC transporter, permease protein, putative  39.52 
 
 		 346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1318  transport system permease protein  34.38 
 
 		 360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.398807  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.78 
 
 		 363 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  41.92 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  39.62 
 
 		 354 aa  184  3e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0591  transport system permease protein  38.98 
 
 		 336 aa  182  6e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.26629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.8 
 
 		 338 aa  182  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  36.87 
 
 		 346 aa  182  7e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1121  transport system permease protein  40.14 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0471477  hitchhiker  0.00000000101745 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2730  transport system permease protein  41.88 
 
 		 350 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1300  transport system permease protein  49.82 
 
 		 348 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0186  transport system permease protein  36.04 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129161  normal  0.828954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3791  transport system permease protein  40.19 
 
 		 361 aa  179  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0929474  normal  0.935471 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2211  transport system permease protein  43.97 
 
 		 350 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2240  ABC transporter permease  41.44 
 
 		 343 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.513081  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.07 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.07 
 
 		 334 aa  176  3e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04380  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  47.14 
 
 		 389 aa  176  4e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.65 
 
 		 330 aa  176  4e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1116  ABC transporter permease  33.33 
 
 		 343 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1297  iron chelate ABC transporter permease protein  33.03 
 
 		 343 aa  176  7e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0147613  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0869  transport system permease protein  40.43 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.911028  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1350  transport system permease protein  40.43 
 
 		 346 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3726  transport system permease protein  39.87 
 
 		 352 aa  175  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3883  transport system permease protein  41.74 
 
 		 353 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.807545  normal  0.268982 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  38.39 
 
 		 380 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  38.89 
 
 		 355 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.65 
 
 		 330 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  38.65 
 
 		 315 aa  172  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  33.23 
 
 		 350 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4276  transport system permease protein  40.91 
 
 		 368 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2248  transport system permease protein  39.86 
 
 		 335 aa  172  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23970  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  42.91 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.597722  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  35.03 
 
 		 361 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2134  transport system permease protein  38.21 
 
 		 357 aa  172  1e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0133047 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1353  transport system permease protein  40.13 
 
 		 363 aa  171  2e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1695  transport system permease protein  40.96 
 
 		 354 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.347986  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3020  transport system permease protein  39.8 
 
 		 370 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.277606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5104  transport system permease protein  38.98 
 
 		 347 aa  170  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1968  transport system permease protein  35.65 
 
 		 365 aa  170  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0562  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system protein  39 
 
 		 348 aa  170  3e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26360  putative permease of ABC transporter  41.44 
 
 		 343 aa  170  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  38.36 
 
 		 345 aa  170  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  34.82 
 
 		 347 aa  170  4e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  38.97 
 
 		 366 aa  170  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  33.92 
 
 		 356 aa  169  5e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  39.43 
 
 		 325 aa  169  6e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.02 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2398  hypothetical protein  37.63 
 
 		 361 aa  169  9e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.384157 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  37.16 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>