More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3479 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  58.33 
 
 
623 aa  675    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
621 aa  1252    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  55.72 
 
 
620 aa  655    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  58.5 
 
 
622 aa  677    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6227  two component sensor kinase for C4-dicarboxylate transport  53.42 
 
 
600 aa  619  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.970393  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1436  histidine kinase  45.49 
 
 
617 aa  452  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1775  histidine kinase  45 
 
 
615 aa  446  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.520686  normal  0.0542298 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0184  histidine kinase  42.55 
 
 
604 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.981711  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.01 
 
 
622 aa  403  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  39.55 
 
 
625 aa  395  1e-108  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  39.55 
 
 
625 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1457  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 
618 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.798107  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0131  histidine kinase  41.44 
 
 
630 aa  385  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0399979  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0368  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.88 
 
 
620 aa  376  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0431  histidine kinase  36.11 
 
 
668 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4771  histidine kinase  42.2 
 
 
624 aa  342  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.415438 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4764  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.91 
 
 
560 aa  340  5e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
683 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4196  histidine kinase  33.44 
 
 
666 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.531315 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0519  histidine kinase  33.28 
 
 
666 aa  330  4e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0541835  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2883  histidine kinase  33.76 
 
 
669 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296171  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6214  histidine kinase  35.11 
 
 
669 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 
672 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2258  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
669 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2872  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
669 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.13678  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0477  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  33.45 
 
 
677 aa  317  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.277779  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0457  C4-dicarboxylate transport sensor histidine kinase DctB  33.45 
 
 
677 aa  317  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7577  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.32 
 
 
677 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  32.6 
 
 
659 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0400  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.33 
 
 
677 aa  313  7.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0641  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.45 
 
 
677 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0478  histidine kinase  34.43 
 
 
616 aa  300  4e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3454  histidine kinase  32.04 
 
 
623 aa  295  1e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 
592 aa  294  3e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909891  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0307  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.31 
 
 
627 aa  286  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.876198  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.6 
 
 
672 aa  286  7e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.622547  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5668  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
623 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4691  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
638 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.203801 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0193  histidine kinase  32.23 
 
 
670 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0541233 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5220  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
631 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.747879 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1413  ATPase domain-containing protein  32.13 
 
 
603 aa  280  8e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4927  histidine kinase  30.79 
 
 
627 aa  278  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1360  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 
603 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1425  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
603 aa  278  2e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.524026  normal  0.827969 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4049  putative two-component sensor  31.53 
 
 
618 aa  278  3e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3170  histidine kinase  31.82 
 
 
597 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.111612  normal  0.304086 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1515  C4-dicarboxylate transport sensor protein  33.03 
 
 
597 aa  276  8e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0225348  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46980  putative two-component sensor  30.64 
 
 
633 aa  276  8e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0066179  normal  0.0520947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3025  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
634 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5341  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 
634 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.556905 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  31.85 
 
 
598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1248  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.95 
 
 
628 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
598 aa  274  3e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.47 
 
 
627 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.420715  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3461  histidine kinase  31.76 
 
 
600 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.350821  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1731  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
621 aa  273  8.000000000000001e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.144225  normal  0.746753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0229  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 
668 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.930854  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4539  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  31.55 
 
 
637 aa  272  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0810573  normal  0.164353 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0714  C4-dicarboxylate transport sensor protein ATPase subunit  31.91 
 
 
594 aa  271  2.9999999999999997e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4294  histidine kinase  32.57 
 
 
626 aa  271  2.9999999999999997e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0465122  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 
603 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  32.99 
 
 
665 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2718  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.61 
 
 
598 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6314  putative two-component sensor  33.16 
 
 
586 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1096  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
634 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2406  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
652 aa  260  4e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  31.11 
 
 
630 aa  260  5.0000000000000005e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1108  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.01 
 
 
634 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.287066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4457  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 
586 aa  259  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2911  ATPase domain-containing protein  30.89 
 
 
613 aa  258  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4345  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
634 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.970987  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72740  putative two-component sensor  32.82 
 
 
588 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.658354  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 
635 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.457116  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 
606 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.381822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03690  C4-dicarboxylate sensory histidine protein kinase, two component; DctB2  32.45 
 
 
603 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.571137  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1197  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 
622 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.534155 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1420  histidine kinase  31.24 
 
 
621 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.990056  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1443  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.08 
 
 
607 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  31.03 
 
 
667 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4562  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
591 aa  253  6e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0229  histidine kinase  31.98 
 
 
645 aa  253  9.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68230  two-component sensor  32.8 
 
 
612 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0604681 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3901  histidine kinase  29.97 
 
 
615 aa  251  2e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.896437  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004046  signal transduction histidine kinase regulating C4-dicarboxylate transport system  30.43 
 
 
601 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0733416  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4406  histidine kinase  33.01 
 
 
622 aa  251  3e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.226466 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1259  ATPase domain-containing protein  30.86 
 
 
626 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27586 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
635 aa  251  3e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.119976 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0008  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  29.95 
 
 
634 aa  250  5e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.368078  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  32.19 
 
 
585 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5904  two-component sensor  32.45 
 
 
599 aa  249  8e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2668  histidine kinase  31.4 
 
 
638 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0289  histidine kinase  30.09 
 
 
604 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2212  putative two-component sensor histidine kinase protein  31.2 
 
 
600 aa  244  3.9999999999999997e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1209  histidine kinase  31.22 
 
 
621 aa  243  5e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.561816 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3136.1  two-component sensor histidine kinase  31.31 
 
 
555 aa  243  5e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0101  sensor histidine kinase  29.15 
 
 
643 aa  243  6e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000798435  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4946  histidine kinase  30.68 
 
 
604 aa  243  7e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000919995 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1572  C4-dicarboxylate transport sensor protein  29.15 
 
 
643 aa  242  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000397989  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>