132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3378 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3378  hypothetical protein  100 
 
 
206 aa  421  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.620452  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0426  Bme2 protein  70.31 
 
 
205 aa  281  4.0000000000000003e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0911545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0369  Bme2 protein  69.43 
 
 
205 aa  281  6.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.16316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2339  protein of unknown function DUF218  35.56 
 
 
190 aa  98.6  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.196018 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2729  protein of unknown function DUF218  38.93 
 
 
192 aa  97.4  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00326918  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2460  putative transmembrane protein  39.19 
 
 
185 aa  94.4  1e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.919961  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2730  protein of unknown function DUF218  32.81 
 
 
279 aa  75.1  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.111496 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3306  hypothetical protein  28.3 
 
 
189 aa  68.9  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0485  hypothetical protein  32.76 
 
 
225 aa  64.7  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4260  hypothetical protein  31.91 
 
 
193 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0643  hypothetical protein  28.77 
 
 
192 aa  62  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3653  hypothetical protein  33.33 
 
 
191 aa  60.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1343  hypothetical protein  29.2 
 
 
213 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.747417 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0098  hypothetical protein  26.44 
 
 
202 aa  58.5  0.00000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2200  hypothetical protein  36.36 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1684  protein of unknown function DUF218  33.93 
 
 
195 aa  56.2  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3867  protein of unknown function DUF218  30.29 
 
 
238 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.420451  normal  0.0728404 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2545  hypothetical protein  29.14 
 
 
232 aa  55.8  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0467  hypothetical protein  27.22 
 
 
264 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2461  hypothetical protein  27.92 
 
 
224 aa  55.1  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.921411  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1055  protein of unknown function DUF218  22.09 
 
 
195 aa  55.1  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000273108 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2233  hypothetical protein  26.95 
 
 
199 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0295734  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1003  hypothetical protein  32.81 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.117242 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3208  protein of unknown function DUF218  22.67 
 
 
196 aa  53.9  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000349402  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1489  hypothetical protein  29.74 
 
 
235 aa  52.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000603911  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1089  hypothetical protein  24.48 
 
 
199 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00875904  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3574  protein of unknown function DUF218  28 
 
 
238 aa  52.4  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0583825 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1976  protein of unknown function DUF218  26.13 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.05946  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1366  hypothetical protein  34.52 
 
 
266 aa  51.6  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.90388  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003221  hypothetical protein  27.87 
 
 
209 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0045  protein of unknown function DUF218  26.74 
 
 
266 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1378  protein of unknown function DUF218  30.25 
 
 
196 aa  51.6  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.2531  hitchhiker  0.00903728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003183  hypothetical protein  27.87 
 
 
205 aa  51.6  0.000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2396  hypothetical protein  26.45 
 
 
198 aa  51.2  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000041288  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3157  hypothetical protein  24.48 
 
 
199 aa  51.6  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000253328  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0020  hypothetical protein  30.14 
 
 
300 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.275341  normal  0.580582 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1009  hypothetical protein  30.36 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0732  hypothetical protein  26.87 
 
 
211 aa  50.1  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1490  hypothetical protein  30.36 
 
 
224 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0952  hypothetical protein  23.78 
 
 
199 aa  49.7  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0206967  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1765  hypothetical protein  29.46 
 
 
281 aa  49.7  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.0749745 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0039  protein of unknown function DUF218  26.17 
 
 
251 aa  50.1  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1020  protein of unknown function DUF218  27.97 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1302  hypothetical protein  28.35 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0955164  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1466  hypothetical protein  29.46 
 
 
260 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0953  protein of unknown function DUF218  32.41 
 
 
197 aa  48.5  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.954298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1349  protein of unknown function DUF218  25.78 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1763  hypothetical protein  38.89 
 
 
252 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2281  protein of unknown function DUF218  26.76 
 
 
198 aa  48.5  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00040439  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0844  hypothetical protein  31.58 
 
 
219 aa  48.5  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.527132  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2573  hypothetical protein  24.4 
 
 
301 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1593  hypothetical protein  33.96 
 
 
208 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12270  hypothetical protein  32.5 
 
 
253 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4276  protein of unknown function DUF218  29.63 
 
 
272 aa  47.8  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4631  hypothetical protein  28.57 
 
 
224 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.189106  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2482  hypothetical protein  27.41 
 
 
218 aa  46.6  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.341723 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1541  hypothetical protein  27.34 
 
 
214 aa  47  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00754119  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4635  hypothetical protein  28.1 
 
 
189 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.940029  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3912  protein of unknown function DUF218  26.03 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265733  normal  0.345064 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0452  transmembrane protein  26.24 
 
 
251 aa  45.8  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0249922  normal  0.582839 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1256  hypothetical protein  30.39 
 
 
195 aa  45.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.202454  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0925  hypothetical protein  25.35 
 
 
215 aa  45.8  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.816716  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1530  hypothetical protein  25.38 
 
 
194 aa  45.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1216  protein of unknown function DUF218  30.21 
 
 
196 aa  45.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000413314  decreased coverage  0.000114911 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2069  protein of unknown function DUF218  29.55 
 
 
253 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.325026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0755  protein of unknown function DUF218  26.67 
 
 
264 aa  45.1  0.0007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000325401 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4792  hypothetical protein  31.68 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.261557 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1908  hypothetical protein  25.23 
 
 
240 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0806  hypothetical protein  41.07 
 
 
206 aa  45.1  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1731  hypothetical protein  25.23 
 
 
240 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.138234  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02150  hypothetical protein  30 
 
 
225 aa  45.1  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1123  hypothetical protein  31.87 
 
 
253 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.569543  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3103  protein of unknown function DUF218  29.52 
 
 
256 aa  44.7  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.0000000000000591337  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1753  hypothetical protein  26.13 
 
 
240 aa  44.7  0.0009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245002  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0146  lipoprotein transmembrane  25 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.207162  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1734  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0564328  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4535  protein of unknown function DUF218  27.98 
 
 
334 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1073  hypothetical protein  26.13 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2322  hypothetical protein  26.55 
 
 
200 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000278714  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3072  hypothetical protein  30.53 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.195617  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1516  hypothetical protein  26.13 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.746081  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0183  hypothetical protein  26.13 
 
 
240 aa  44.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00678491  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2653  protein of unknown function DUF218  31.3 
 
 
199 aa  44.3  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.344395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0986  hypothetical protein  28.18 
 
 
302 aa  44.3  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1588  hypothetical protein  45.1 
 
 
213 aa  44.3  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.103314 
 
 
-
 
NC_004310  BR2112  hypothetical protein  27.52 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.418722  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3403  hypothetical protein  29.31 
 
 
280 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2382  hypothetical protein  27.52 
 
 
264 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.371494  normal  0.708351 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0452  protein of unknown function DUF218  26.4 
 
 
260 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0793  hypothetical protein  32.67 
 
 
206 aa  43.5  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.112822  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1372  hypothetical protein  31.34 
 
 
224 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.564686  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1032  protein of unknown function DUF218  37.93 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4029  hypothetical protein  27.4 
 
 
246 aa  43.9  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0376  protein of unknown function DUF218  24.35 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2122  hypothetical protein  27.86 
 
 
228 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0673185  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1412  hypothetical protein  31.34 
 
 
224 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4689  protein of unknown function DUF218  27.71 
 
 
262 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.584502  normal  0.95613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3239  protein of unknown function DUF218  32.28 
 
 
336 aa  43.1  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0878  hypothetical protein  31.65 
 
 
193 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2028  hypothetical protein  27.89 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.573264  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>