More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3346 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3346  monosaccharide-transporting ATPase  100 
 
 
345 aa  668    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0869656  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5134  ABC transporter membrane spanning protein (ribose)  85.1 
 
 
349 aa  538  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.180892  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6344  monosaccharide-transporting ATPase  70.72 
 
 
343 aa  462  1e-129  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0383311  normal  0.17282 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0872  Monosaccharide-transporting ATPase  72.87 
 
 
327 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6473  inner-membrane translocator  70.14 
 
 
343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.760723  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6708  inner-membrane translocator  70.14 
 
 
343 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.46964  normal  0.292611 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6314  monosaccharide-transporting ATPase  69.86 
 
 
343 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.359966 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5472  Monosaccharide-transporting ATPase  70.72 
 
 
343 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.614199  normal  0.795246 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1253  monosaccharide-transporting ATPase  69.57 
 
 
349 aa  431  1e-120  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1227  inner-membrane translocator  69.28 
 
 
349 aa  430  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09560  Monosaccharide-transporting ATPase  50.33 
 
 
322 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.785729  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3002  inner-membrane translocator  45.51 
 
 
336 aa  250  3e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2121  Monosaccharide-transporting ATPase  40.83 
 
 
350 aa  246  4e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.83989 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1400  D-ribose transport system permease protein  46.69 
 
 
327 aa  246  4.9999999999999997e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151364 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1337  amino acid or sugar ABC transport system, permease protein  40.86 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.485159 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0769  ribose transport system permease  42.48 
 
 
342 aa  243  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00219185  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2686  Monosaccharide-transporting ATPase  43.28 
 
 
325 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1087  inner-membrane translocator  43.87 
 
 
339 aa  241  9e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.10708 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3329  inner-membrane translocator  40.75 
 
 
345 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5038  inner-membrane translocator  40.75 
 
 
345 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5246  monosaccharide-transporting ATPase  40.75 
 
 
345 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.971428 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3217  ribose transport system permease protein RbsC  42.51 
 
 
334 aa  239  5e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.961558  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2804  inner-membrane translocator  42.77 
 
 
324 aa  238  1e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.500539  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3130  inner-membrane translocator  43.27 
 
 
333 aa  238  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0780017  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02651  Ribose transport system permease protein rbsC  44.75 
 
 
327 aa  238  2e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0700  ribose ABC transporter, permease protein  43.38 
 
 
311 aa  237  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0973921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4638  ribose ABC transporter, permease protein  43.38 
 
 
311 aa  237  2e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0801722  unclonable  4.6789e-26 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0947  inner-membrane translocator  47.08 
 
 
319 aa  236  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4446  inner-membrane translocator  42.24 
 
 
345 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000908606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0582  monosaccharide-transporting ATPase  43.38 
 
 
311 aa  236  4e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0625  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  41.61 
 
 
345 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.983884  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0911  ribose ABC transporter, permease protein  41.3 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0965  monosaccharide-transporting ATPase  41.3 
 
 
342 aa  236  5.0000000000000005e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0579  ribose ABC transporter, permease  43.38 
 
 
311 aa  236  6e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0797  ribose ABC transporter, permease protein  43.38 
 
 
311 aa  236  6e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000530424  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0736  ribose ABC transporter, permease protein  43.38 
 
 
311 aa  235  7e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0578  ribose ABC transporter, permease  43.38 
 
 
311 aa  235  7e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0535816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3880  sugar transport system permease  41.3 
 
 
334 aa  235  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0490565 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1509  ribose ABC transporter, permease protein  40.46 
 
 
330 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.424015  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1613  monosaccharide-transporting ATPase  40.46 
 
 
330 aa  235  8e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1759  ribose ABC transporter permease  40.46 
 
 
330 aa  235  8e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.32812  hitchhiker  0.000062023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1398  inner-membrane translocator  40.84 
 
 
334 aa  235  9e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00127371  normal  0.617276 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0563  monosaccharide-transporting ATPase  43.25 
 
 
311 aa  234  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000352632  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1631  ribose ABC transporter, permease protein  40.12 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1575  ribose ABC transporter, permease protein  40.12 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136542  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4066  monosaccharide-transporting ATPase  40.6 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0158179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0725  ribose ABC transporter, permease protein  43.08 
 
 
311 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.35469e-35 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0635  ribose ABC transporter permease  42.77 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0668  ribose ABC transporter permease  42.77 
 
 
311 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4171  Monosaccharide-transporting ATPase  42.28 
 
 
341 aa  233  5e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1987  monosaccharide-transporting ATPase  42.81 
 
 
312 aa  232  6e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.589517  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3600  monosaccharide-transporting ATPase  42.37 
 
 
345 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147335  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4966  monosaccharide-transporting ATPase  42.09 
 
 
347 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01060  monosaccharide ABC transporter membrane protein  42.72 
 
 
336 aa  229  6e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0248  inner-membrane translocator  38.4 
 
 
338 aa  229  8e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3539  inner-membrane translocator  44.69 
 
 
315 aa  226  3e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149019  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02612  hypothetical protein  45.86 
 
 
276 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0342  ribose ABC transporter permease protein  40.94 
 
 
324 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0614  inner-membrane translocator  40.61 
 
 
331 aa  226  6e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1642  Monosaccharide-transporting ATPase  43.59 
 
 
317 aa  226  6e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000622557  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3329  inner-membrane translocator  41.64 
 
 
314 aa  222  8e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4607  Monosaccharide-transporting ATPase  44.95 
 
 
348 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1048  inner-membrane translocator  42.45 
 
 
328 aa  220  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1874  monosaccharide-transporting ATPase  40.73 
 
 
354 aa  219  3.9999999999999997e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.273612  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0712  inner-membrane translocator  42.54 
 
 
310 aa  218  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0709957  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3165  Monosaccharide-transporting ATPase  42.53 
 
 
310 aa  217  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0361  carbohydrate ABC transporter permease  43.91 
 
 
310 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2278  inner-membrane translocator  43.48 
 
 
309 aa  217  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.568654  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0412  Monosaccharide-transporting ATPase  41.83 
 
 
328 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00266655  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1792  sugar ABC transporter, permease protein  44.19 
 
 
835 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0456  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  43.27 
 
 
310 aa  216  5.9999999999999996e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2513  inner-membrane translocator  39.71 
 
 
328 aa  215  8e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587124  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1063  monosaccharide-transporting ATPase  44.21 
 
 
365 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3488  sugar ABC transporter, permease protein  44.44 
 
 
341 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.294731  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3089  inner-membrane translocator  40.28 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0871348  normal  0.381344 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0115  ribose ABC transporter, permease protein  42.76 
 
 
310 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1881  ribose ABC transporter, permease protein  42.72 
 
 
311 aa  213  3.9999999999999995e-54  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0277317  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1793  monosaccharide-transporting ATPase  40.75 
 
 
306 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.115366  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1349  ABC sugar transporter, inner membrane subunit  40.81 
 
 
341 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2283  monosaccharide-transporting ATPase  39.07 
 
 
345 aa  212  7e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.303171  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06144  ribose ABC transporter permease protein  40.8 
 
 
327 aa  212  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0288  inner-membrane translocator  39.24 
 
 
331 aa  212  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.247958 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2914  monosaccharide-transporting ATPase  39.77 
 
 
346 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.366692  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2904  Monosaccharide-transporting ATPase  46.06 
 
 
322 aa  211  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0339421 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0859  ribose ABC transporter, permease protein  41.74 
 
 
346 aa  210  2e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.479908  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5319  inner-membrane translocator  42.5 
 
 
342 aa  210  2e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.300421  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22690  Monosaccharide-transporting ATPase  43.89 
 
 
322 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00548912  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0184  inner-membrane translocator  40.12 
 
 
326 aa  210  3e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1643  inner-membrane translocator  37.58 
 
 
320 aa  210  4e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000340  ribose ABC transport system permease protein RbsC  40.52 
 
 
327 aa  209  5e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5320  inner-membrane translocator  38.87 
 
 
350 aa  209  5e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306475  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2809  monosaccharide-transporting ATPase  41.5 
 
 
337 aa  209  5e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1579  sugar ABC transporter permease  40 
 
 
318 aa  209  6e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.827046  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4009  inner-membrane translocator  40.23 
 
 
336 aa  209  6e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3108  monosaccharide-transporting ATPase  39.47 
 
 
313 aa  208  1e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0985733  hitchhiker  0.000124889 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2523  inner-membrane translocator  43.21 
 
 
313 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4767  monosaccharide-transporting ATPase  43 
 
 
320 aa  208  1e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3336  inner-membrane translocator  39.88 
 
 
346 aa  207  2e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2222  monosaccharide-transporting ATPase  39.69 
 
 
319 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2807  inner-membrane translocator  42.95 
 
 
338 aa  207  3e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>