More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3336 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3336  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 
303 aa  617  1e-176  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163096  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5174  dihydrodipicolinate synthetase  54.49 
 
 
317 aa  330  2e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0202491  normal  0.065211 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5443  dihydrodipicolinate synthetase  53.47 
 
 
317 aa  324  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.344282  hitchhiker  0.00661581 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4464  dihydrodipicolinate synthetase  42.16 
 
 
299 aa  218  1e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.130904  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0196  dihydrodipicolinate synthetase  43.62 
 
 
307 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5532  dihydrodipicolinate synthetase  39.86 
 
 
301 aa  208  8e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4216  dihydrodipicolinate synthetase  34.98 
 
 
320 aa  166  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0462427  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0033  dihydrodipicolinate synthetase  32.33 
 
 
305 aa  147  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4436  dihydrodipicolinate synthetase  29.9 
 
 
311 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0722382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2744  dihydrodipicolinate synthase  28.47 
 
 
309 aa  113  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0667  dihydrodipicolinate synthase  29.39 
 
 
332 aa  113  4.0000000000000004e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.448308  decreased coverage  0.00548285 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4210  dihydrodipicolinate synthetase  26.43 
 
 
319 aa  112  6e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4457  dihydrodipicolinate synthetase  25.99 
 
 
312 aa  109  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.0032522  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  31.2 
 
 
291 aa  108  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0794  dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 
314 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  30.71 
 
 
291 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4000  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 
302 aa  104  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.104008 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.14 
 
 
290 aa  102  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  27.72 
 
 
305 aa  100  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1150  dihydrodipicolinate synthase  31.16 
 
 
291 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  28.97 
 
 
291 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2190  dihydrodipicolinate synthase  29.85 
 
 
314 aa  99.8  5e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  25.8 
 
 
301 aa  99  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
292 aa  98.6  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.62 
 
 
294 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  29.27 
 
 
292 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  30.04 
 
 
292 aa  97.4  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0016  dihydrodipicolinate synthetase  29.02 
 
 
294 aa  96.7  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1396  dihydrodipicolinate synthase  28.94 
 
 
313 aa  95.9  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.158147  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4201  dihydrodipicolinate synthetase  28.72 
 
 
308 aa  95.9  8e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.08 
 
 
308 aa  95.5  9e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2387  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 
303 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0117065 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 
292 aa  95.5  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  26.53 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3958  dihydrodipicolinate synthetase  27.09 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3538  dihydrodipicolinate synthetase  28.52 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.423247  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  29.75 
 
 
291 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0646  dihydrodipicolinate synthetase  27.52 
 
 
294 aa  94.7  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3709  dihydrodipicolinate synthetase  28.19 
 
 
294 aa  94.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.646628  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1487  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.88 
 
 
330 aa  94.7  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12766  dihydrodipicolinate synthase  29.37 
 
 
300 aa  94  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1441  dihydrodipicolinate synthetase  30.22 
 
 
294 aa  93.2  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.681531  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  27.85 
 
 
303 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  27.95 
 
 
302 aa  93.2  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2241  dihydrodipicolinate synthase  26.15 
 
 
307 aa  93.2  5e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.289873  normal  0.369345 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0689  dihydrodipicolinate synthetase  26.85 
 
 
294 aa  92.8  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0148381  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0979  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0699558  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  26.71 
 
 
301 aa  92.4  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3387  dihydrodipicolinate synthase  31.93 
 
 
296 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 
298 aa  92  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4452  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.8 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0211  dihydrodipicolinate synthase  29.82 
 
 
290 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.397143  hitchhiker  0.00000000242674 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4586  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  30.8 
 
 
312 aa  90.9  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.546959  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5701  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.69 
 
 
301 aa  91.3  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  28.04 
 
 
303 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0185  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.88 
 
 
336 aa  90.5  3e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3716  dihydrodipicolinate synthetase  26.42 
 
 
291 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.131295 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  26.85 
 
 
298 aa  90.5  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  26.74 
 
 
296 aa  90.5  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  26.6 
 
 
303 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2438  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 
291 aa  90.1  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220136  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  26.37 
 
 
301 aa  89.7  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  27.86 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  28.99 
 
 
296 aa  89.7  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3171  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 
308 aa  89.7  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.288667 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  27.18 
 
 
298 aa  89.7  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3111  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  28.25 
 
 
313 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1217  dihydrodipicolinate synthetase  28.07 
 
 
293 aa  89.7  5e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.881213  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3515  dihydrodipicolinate synthase  31.23 
 
 
296 aa  89  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.142026 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  26.1 
 
 
295 aa  89  9e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  26.83 
 
 
305 aa  89  9e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05369  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  28.31 
 
 
311 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.288036  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3191  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393919  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2103  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.693984  normal  0.145144 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2116  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  30.83 
 
 
292 aa  88.6  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5758  dihydrodipicolinate synthetase  25.57 
 
 
295 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2162  dihydrodipicolinate synthase  27.21 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.3452  normal  0.49306 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2587  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.58 
 
 
303 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0233222  hitchhiker  0.00609542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2862  dihydrodipicolinate synthase  30.88 
 
 
291 aa  87.8  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338154  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  24.73 
 
 
298 aa  87.4  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3482  dihydrodipicolinate synthase  25.81 
 
 
294 aa  87.4  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000010244  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3229  dihydrodipicolinate synthetase  26.71 
 
 
292 aa  86.7  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.837528  normal  0.60064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6171  dihydrodipicolinate synthetase  30.88 
 
 
294 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6698  putative dihydrodipicolinate synthase  26.53 
 
 
303 aa  86.3  6e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.176073 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3393  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.73 
 
 
301 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  26.21 
 
 
298 aa  86.3  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3655  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  26.73 
 
 
301 aa  85.9  7e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1875  5-dehydro-4-deoxyglucarate dehydratase  25.74 
 
 
307 aa  85.9  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207996  normal  0.131652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1759  dihydrodipicolinate synthetase  25.93 
 
 
291 aa  85.9  7e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0300118  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>