More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3289 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3289  major facilitator transporter  100 
 
 
625 aa  1254    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3180  major facilitator transporter  72.36 
 
 
629 aa  939    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0888  major facilitator family transporter  77.74 
 
 
632 aa  957    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3902  General substrate transporter  71.2 
 
 
628 aa  895    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.207036 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0832  major facilitator family transporter  77.58 
 
 
632 aa  957    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0523  major facilitator transporter  57.61 
 
 
565 aa  650    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0233357  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0437  major facilitator transporter  59.49 
 
 
552 aa  702    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0763251  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3033  major facilitator superfamily MFS_1  57.91 
 
 
564 aa  669    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5982  major facilitator transporter  56.83 
 
 
552 aa  650    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.091803  normal  0.0695037 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6348  major facilitator superfamily MFS_1  56.85 
 
 
577 aa  656    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4226  General substrate transporter  70.72 
 
 
628 aa  887    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.162126 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4361  MFS permease  72.36 
 
 
627 aa  894    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.84184  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4706  General substrate transporter  57.65 
 
 
564 aa  678    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1334  major facilitator transporter  57.01 
 
 
568 aa  656    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3752  major facilitator superfamily transporter  57.48 
 
 
564 aa  666    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.875294  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0447  major facilitator superfamily MFS_1  56.47 
 
 
567 aa  645    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.423925  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0462  major facilitator transporter  57.05 
 
 
565 aa  647    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.920315  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0463  major facilitator superfamily MFS_1  56.47 
 
 
567 aa  651    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2044  major facilitator transporter  57.47 
 
 
552 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00306223  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1561  major facilitator transporter  54.59 
 
 
556 aa  636    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.86082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1832  general substrate transporter  56.66 
 
 
574 aa  661    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.357144 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0062  major facilitator transporter  74.44 
 
 
630 aa  882    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2684  general substrate transporter  56.96 
 
 
552 aa  643    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0683854  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2655  major facilitator transporter  57.47 
 
 
552 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.336699  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2565  major facilitator transporter  56.85 
 
 
578 aa  628  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2788  major facilitator superfamily MFS_1  56.85 
 
 
578 aa  629  1e-179  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2497  major facilitator superfamily MFS_1  56.67 
 
 
562 aa  621  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.635696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1092  major facilitator transporter  55.16 
 
 
558 aa  616  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3352  major facilitator transporter  55.08 
 
 
565 aa  614  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1849  major facilitator transporter  54.82 
 
 
556 aa  611  1e-173  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3972  major facilitator superfamily MFS_1  53.13 
 
 
553 aa  601  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.727747 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3298  General substrate transporter  66.59 
 
 
552 aa  592  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.447243 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0668  major facilitator transporter  66.59 
 
 
552 aa  594  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.361815  normal  0.357479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3350  putative sugar transport protein  64.37 
 
 
558 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2576  general substrate transporter  64.99 
 
 
552 aa  578  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.598337  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5595  general substrate transporter  65.92 
 
 
560 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.21906  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5955  general substrate transporter  63.68 
 
 
560 aa  578  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2702  major facilitator transporter  64.99 
 
 
552 aa  579  1e-164  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00241693  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0485  major facilitator superfamily transporter  63.47 
 
 
552 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0233  general substrate transporter  63.08 
 
 
557 aa  575  1.0000000000000001e-163  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00123481 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0647  general substrate transporter  66.36 
 
 
552 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.170091  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2669  major facilitator family transporter  64.22 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.381199  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0269  major facilitator family transporter  64.22 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.23534  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0807  major facilitator family transporter  64.22 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0969  major facilitator family transporter  64.22 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725639  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2407  major facilitator family transporter  64.22 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.492598  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0020  major facilitator family transporter  64.22 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.13968  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0811  major facilitator family transporter  64.22 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.303665  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0640  major facilitator family transporter  64.67 
 
 
552 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0518  major facilitator superfamily transporter  62.03 
 
 
553 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.330299  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4142  general substrate transporter  61.52 
 
 
552 aa  570  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142983  normal  0.144482 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4345  major facilitator superfamily transporter  68.8 
 
 
552 aa  571  1e-161  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4566  general substrate transporter  63.12 
 
 
554 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1948  general substrate transporter  51.63 
 
 
556 aa  559  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.83327  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1946  major facilitator transporter  55 
 
 
541 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0851  MFS family sugar transporter  59.96 
 
 
556 aa  559  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734503  normal  0.560347 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3839  General substrate transporter  52.77 
 
 
563 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.241641  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0547  putative sugar transporter transmembrane protein  61.88 
 
 
567 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.212245  normal  0.692505 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0919  General substrate transporter  61.3 
 
 
554 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3756  General substrate transporter  52.14 
 
 
563 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3359  general substrate transporter  49.27 
 
 
540 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.329289  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0240  major facilitator transporter  49.35 
 
 
563 aa  545  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000308236 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4821  general substrate transporter  61.99 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0835  general substrate transporter  61.99 
 
 
554 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0740201 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3353  major facilitator transporter  64.76 
 
 
563 aa  540  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.267737 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2188  general substrate transporter  47.99 
 
 
561 aa  531  1e-149  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2379  general substrate transporter  61.28 
 
 
573 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3146  general substrate transporter  61.5 
 
 
559 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2569  major facilitator transporter  61.18 
 
 
558 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.409039  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3296  major facilitator transporter  60.62 
 
 
559 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5178  major facilitator transporter  60.93 
 
 
577 aa  515  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.763618  normal  0.147804 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1411  general substrate transporter  64.72 
 
 
549 aa  513  1e-144  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.966407  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2965  general substrate transporter  60.84 
 
 
557 aa  514  1e-144  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.338503  normal  0.578343 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3698  major facilitator superfamily transporter  60.71 
 
 
563 aa  508  9.999999999999999e-143  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2623  general substrate transporter  55.97 
 
 
563 aa  504  1e-141  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0076  general substrate transporter  57.98 
 
 
539 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00192863  decreased coverage  0.0000000000146156 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0057  major facilitator family transporter  57.75 
 
 
539 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0623075  unclonable  0.000000533342 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0073  general substrate transporter  57.75 
 
 
539 aa  498  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000648863  normal  0.0860349 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0073  general substrate transporter  56.85 
 
 
539 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.229897  hitchhiker  0.00000000114232 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6422  major facilitator transporter  56.53 
 
 
554 aa  486  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.726262 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16410  putative MFS transporter  62.75 
 
 
539 aa  484  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6134  major facilitator transporter  56.08 
 
 
554 aa  481  1e-134  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3981  major facilitator superfamily MFS_1  42.46 
 
 
552 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1303  major facilitator superfamily MFS_1  51.83 
 
 
568 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1427  MFS family transporter  62.5 
 
 
539 aa  482  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6133  major facilitator superfamily MFS_1  54.04 
 
 
552 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.376404  normal  0.0270764 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6117  major facilitator superfamily MFS_1  42.81 
 
 
552 aa  478  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.154468  normal  0.620567 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8529  General substrate transporter  51.22 
 
 
542 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1339  putative sugar transport protein  55.05 
 
 
525 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.922881  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0047  general substrate transporter  48.97 
 
 
553 aa  401  9.999999999999999e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.252827  normal  0.746127 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2048  General substrate transporter  58.38 
 
 
539 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.599548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1627  major facilitator transporter  57.14 
 
 
487 aa  397  1e-109  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.518236  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0712  major facilitator transporter  58.38 
 
 
525 aa  395  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00730852  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2061  major facilitator superfamily MFS_1  55.84 
 
 
526 aa  389  1e-106  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00632422  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2432  major facilitator superfamily MFS_1  57.62 
 
 
511 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1409  major facilitator transporter  51.31 
 
 
498 aa  378  1e-103  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4227  major facilitator superfamily MFS_1  58.6 
 
 
514 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.300961  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0012  major facilitator transporter  48.35 
 
 
527 aa  375  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3784  major facilitator transporter  47.77 
 
 
533 aa  367  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1110  general substrate transporter  55.91 
 
 
468 aa  363  4e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>