More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3284 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3284  thioredoxin  100 
 
 		 320 aa  646    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  81.79 
 
 		 329 aa  518  1e-146  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  81.17 
 
 		 324 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  55.12 
 
 		 334 aa  368  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  55.25 
 
 		 324 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  58.31 
 
 		 326 aa  366  1e-100  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  54.32 
 
 		 324 aa  363  3e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  53.94 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  57.05 
 
 		 305 aa  337  9.999999999999999e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0456  thioredoxin  54.93 
 
 		 306 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.666195  normal  0.0589835 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0296  thioredoxin  56.81 
 
 		 306 aa  335  5.999999999999999e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0166723 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0268  thioredoxin  56.81 
 
 		 306 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.223768  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  56.96 
 
 		 302 aa  330  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2251  thioredoxin domain-containing protein  57.19 
 
 		 302 aa  326  3e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.285443 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  55.99 
 
 		 302 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2526  Thioredoxin domain  56.85 
 
 		 302 aa  324  1e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2208  Thioredoxin domain  55.15 
 
 		 300 aa  321  9.999999999999999e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.210633  normal  0.190287 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  55.23 
 
 		 304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  57.43 
 
 		 306 aa  317  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  55.4 
 
 		 317 aa  308  6.999999999999999e-83  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0264  thioredoxin-related  53.67 
 
 		 305 aa  305  6e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.569758 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  55.37 
 
 		 302 aa  297  1e-79  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  49.35 
 
 		 310 aa  285  8e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2792  thioredoxin  53.41 
 
 		 307 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.284427 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0073  thioredoxin-related  49.66 
 
 		 336 aa  267  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0246134 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2938  thioredoxin  47.97 
 
 		 315 aa  260  2e-68  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0422  thioredoxin-related  45.49 
 
 		 306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  49.5 
 
 		 304 aa  242  6e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2894  thioredoxin  46.05 
 
 		 304 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.225286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  43.48 
 
 		 303 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0139  thioredoxin  47.04 
 
 		 304 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.115095  normal  0.47686 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1489  thioredoxin domain-containing protein  46.71 
 
 		 304 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.481302  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3711  thioredoxin-related  42.99 
 
 		 312 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0054  thioredoxin domain-containing protein  42.57 
 
 		 311 aa  230  3e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.621806 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2254  Thioredoxin domain  44.97 
 
 		 338 aa  229  7e-59  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.526752 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2371  thioredoxin domain-containing protein  44.26 
 
 		 303 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.880736 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2127  thioredoxin domain-containing protein  43.16 
 
 		 311 aa  218  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  40.57 
 
 		 274 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  35.31 
 
 		 287 aa  187  3e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  39.65 
 
 		 280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  38.97 
 
 		 293 aa  185  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  38.41 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  38.41 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  37.98 
 
 		 298 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0822  thioredoxin  37.54 
 
 		 310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.606093  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  39.24 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  38.06 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1755  thioredoxin  37.85 
 
 		 287 aa  179  7e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0267329  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3331  thioredoxin  34.15 
 
 		 287 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5898  thioredoxin  39.51 
 
 		 282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.769716  normal  0.516195 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3219  thioredoxin  39.51 
 
 		 282 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2485  thioredoxin  39.16 
 
 		 282 aa  172  5e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.194267 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2614  thioredoxin  39.16 
 
 		 282 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  35.12 
 
 		 301 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0743  thioredoxin  39.86 
 
 		 282 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.328705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2665  thioredoxin-related  38.81 
 
 		 303 aa  170  4e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  36.93 
 
 		 285 aa  168  9e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0730  thioredoxin  39.16 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2102  thioredoxin  37.29 
 
 		 291 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2566  thioredoxin  37.89 
 
 		 282 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  33.68 
 
 		 290 aa  162  6e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2590  thioredoxin  37.41 
 
 		 282 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0943  thioredoxin domain-containing protein  33.92 
 
 		 286 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1955  thioredoxin  37.54 
 
 		 282 aa  161  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.180401  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  36.94 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0516  thioredoxin  38.54 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  35.86 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  37.46 
 
 		 280 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.45 
 
 		 290 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  38.08 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33.1 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.45 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  36.54 
 
 		 302 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  33.56 
 
 		 290 aa  155  9e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  37.41 
 
 		 301 aa  155  9e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.1 
 
 		 290 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  37.41 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  37.41 
 
 		 282 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.79 
 
 		 289 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  33.68 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  35.22 
 
 		 302 aa  154  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  31.01 
 
 		 289 aa  152  5e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  33.33 
 
 		 290 aa  151  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4628  thioredoxin  32.47 
 
 		 341 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1063  thioredoxin  37.41 
 
 		 918 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0719  thioredoxin  37.19 
 
 		 282 aa  150  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0060777  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  34.14 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2125  thioredoxin  36.46 
 
 		 286 aa  149  7e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0198  thioredoxin  33.55 
 
 		 326 aa  147  3e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  33 
 
 		 337 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1595  thioredoxin  31.25 
 
 		 287 aa  145  9e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.385204  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1535  thioredoxin  31.83 
 
 		 269 aa  144  1e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0993  thioredoxin  37.08 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  32.87 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  33.57 
 
 		 277 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  32.75 
 
 		 289 aa  142  5e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5094  thioredoxin  34.09 
 
 		 306 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.443129  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2614  thioredoxin family protein  35.48 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  32.18 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  32.82 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>