More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3191 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3191  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
254 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.1009  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1508  lytic transglycosylase, catalytic  68.5 
 
 
254 aa  311  5e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.324352 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2331  lytic transglycosylase, catalytic  58.23 
 
 
242 aa  248  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.194183  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3823  lytic transglycosylase catalytic  54.15 
 
 
310 aa  236  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.78856  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3847  lytic transglycosylase, catalytic  58.51 
 
 
240 aa  235  5e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.081015  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0704  lytic transglycosylase catalytic  55.92 
 
 
251 aa  232  4e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2873  lytic transglycosylase catalytic  59.67 
 
 
258 aa  231  1e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3185  lytic transglycosylase, catalytic  53.48 
 
 
268 aa  229  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0137  lytic transglycosylase, catalytic  57.6 
 
 
231 aa  226  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.158623  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0517  lytic transglycosylase, catalytic  52.97 
 
 
254 aa  223  2e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0493773  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3687  lytic transglycosylase, catalytic  56.82 
 
 
300 aa  216  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0754  lytic transglycosylase catalytic  56.74 
 
 
253 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3375  lytic transglycosylase, catalytic  51.94 
 
 
272 aa  213  3e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.877408  normal  0.240376 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3537  lytic transglycosylase catalytic  56.45 
 
 
259 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.401934  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1198  lytic transglycosylase catalytic  56.45 
 
 
259 aa  209  3e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7737  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  54.03 
 
 
257 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3082  Lytic transglycosylase catalytic  50.61 
 
 
257 aa  197  1e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0850  lytic transglycosylase, catalytic  48.24 
 
 
336 aa  187  1e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0266609 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2804  Lytic transglycosylase catalytic  50.41 
 
 
238 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0360  lytic transglycosylase, catalytic  62.84 
 
 
233 aa  179  3e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3554  lytic transglycosylase, catalytic  60.67 
 
 
241 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.930583  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0586  lytic transglycosylase catalytic  44.53 
 
 
261 aa  174  9e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.893043  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2492  lytic transglycosylase, catalytic  60.93 
 
 
242 aa  174  1e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.931024 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3009  lytic transglycosylase catalytic  46.03 
 
 
238 aa  171  9e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3905  lytic transglycosylase, catalytic  51 
 
 
301 aa  169  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1491  putative lytic transglycosylase  51.06 
 
 
338 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7436  putative soluble lytic murein transglycosylase precursor  50.26 
 
 
197 aa  169  5e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.467676 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1028  Lytic transglycosylase catalytic  46.67 
 
 
233 aa  166  3e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100392  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2620  lytic transglycosylase, catalytic  46.73 
 
 
262 aa  166  3e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1603  Lytic transglycosylase catalytic  47.26 
 
 
217 aa  165  7e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4010  lytic transglycosylase catalytic  41.96 
 
 
265 aa  162  4e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.132288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3350  putative lytic transglycosylase  51.16 
 
 
276 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.124334  normal  0.958591 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0976  Lytic transglycosylase catalytic  52.29 
 
 
223 aa  150  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0633  Lytic transglycosylase catalytic  55.56 
 
 
439 aa  143  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0452827 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2251  lytic transglycosylase catalytic  49.66 
 
 
276 aa  143  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.417194  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2124  Lytic transglycosylase catalytic  53.62 
 
 
460 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2657  lytic transglycosylase, catalytic  54.07 
 
 
484 aa  142  5e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.142351  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1820  lytic transglycosylase catalytic  56.8 
 
 
251 aa  130  1e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0181  lytic transglycosylase, catalytic  44.97 
 
 
234 aa  130  2e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2016  lytic transglycosylase catalytic  52.03 
 
 
210 aa  119  4e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.272435  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0177  lytic transglycosylase, catalytic  54.7 
 
 
120 aa  114  2e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.683318  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  46.22 
 
 
251 aa  104  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  47.93 
 
 
260 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  47.9 
 
 
260 aa  99.4  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  43.22 
 
 
191 aa  95.1  9e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  46.22 
 
 
282 aa  94  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4119  Lytic transglycosylase catalytic  44.72 
 
 
280 aa  92.8  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  7.67564e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  44.83 
 
 
206 aa  91.7  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 
258 aa  90.5  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  44.35 
 
 
174 aa  90.1  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1294  Lytic transglycosylase catalytic  41.33 
 
 
199 aa  89.7  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2003  Lytic transglycosylase catalytic  47.93 
 
 
217 aa  89  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  42.15 
 
 
196 aa  88.6  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2442  Lytic transglycosylase catalytic  44.35 
 
 
245 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  43.33 
 
 
226 aa  86.7  3e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  46.22 
 
 
196 aa  87  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  45.3 
 
 
241 aa  87  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 
198 aa  86.3  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  2.86118e-10 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  45.76 
 
 
207 aa  85.9  6e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1173  lytic transglycosylase catalytic  47.92 
 
 
195 aa  85.1  9e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.79573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  45.69 
 
 
233 aa  85.1  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 
235 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  43.8 
 
 
237 aa  84  2e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  37.11 
 
 
438 aa  82.8  5e-15  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0139  lytic transglycosylase catalytic  43.09 
 
 
299 aa  82.8  5e-15  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  42.28 
 
 
247 aa  82.4  7e-15  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  43.22 
 
 
188 aa  82  7e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3607  lytic transglycosylase, catalytic  41.46 
 
 
326 aa  82  8e-15  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0748  lytic transglycosylase, catalytic  40.83 
 
 
146 aa  81.6  1e-14  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00376609  normal  0.892869 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2926  putative transglycolase  41.54 
 
 
278 aa  81.6  1e-14  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3004  lytic transglycosylase catalytic  38.84 
 
 
278 aa  81.3  1e-14  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.210468 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 
189 aa  81.3  1e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  39.66 
 
 
202 aa  81.3  2e-14  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  40.34 
 
 
204 aa  80.1  3e-14  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  37.78 
 
 
209 aa  80.5  3e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4039  lytic transglycosylase, catalytic  41.46 
 
 
239 aa  79.7  4e-14  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6881  Lytic transglycosylase catalytic  43.48 
 
 
271 aa  79.7  4e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987079  normal  0.0912273 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  41.88 
 
 
212 aa  79.7  4e-14  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0096  lytic transglycosylase, catalytic  39.55 
 
 
249 aa  79.7  4e-14  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4244  lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 
251 aa  80.1  4e-14  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 
209 aa  79.7  4e-14  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4378  lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 
251 aa  79.7  4e-14  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2733  lytic transglycosylase, catalytic  39.52 
 
 
246 aa  79.7  4e-14  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.187494  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  39.1 
 
 
239 aa  79.7  4e-14  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 
209 aa  80.1  4e-14  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4205  Lytic transglycosylase catalytic  41.73 
 
 
251 aa  79.7  4e-14  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 
203 aa  79.3  5e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  5.18233e-15  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1332  Lytic transglycosylase catalytic  43.44 
 
 
194 aa  79.7  5e-14  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0695277  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3686  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
209 aa  79.3  5e-14  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  40.65 
 
 
243 aa  79.3  6e-14  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3923  lytic transglycosylase, catalytic  41.46 
 
 
239 aa  79  7e-14  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3830  lytic transglycosylase, catalytic  40.16 
 
 
239 aa  79  7e-14  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.582426 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  39.17 
 
 
247 aa  78.6  8e-14  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0159  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 
245 aa  78.2  1e-13  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 
260 aa  78.6  1e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1129  Lytic transglycosylase catalytic  37.3 
 
 
200 aa  78.6  1e-13  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5136  Lytic transglycosylase catalytic  41.18 
 
 
291 aa  77.8  1e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2210  lytic transglycosylase, catalytic  43.97 
 
 
218 aa  77.8  2e-13  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.270311  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2967  Lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 
451 aa  77.4  2e-13  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.335517  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 
204 aa  76.6  3e-13  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>