117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3167 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3167  nuclease  100 
 
 		 122 aa  243  4.9999999999999997e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139898  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  51.52 
 
 		 201 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2972  nuclease  38.46 
 
 		 273 aa  72.4  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4945  nuclease  39.37 
 
 		 170 aa  69.7  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.377656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  34.95 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3964  nuclease  45.1 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4764  nuclease  37.4 
 
 		 196 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00156339  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  33.98 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  33.98 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8127  nuclease  37.68 
 
 		 146 aa  67.8  0.00000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.129752  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4671  nuclease (SNase-like)  41.58 
 
 		 154 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0240  nuclease (SNase-like)  42.16 
 
 		 160 aa  62.8  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1250  nuclease (SNase-like)  41.75 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0557  nuclease (SNase-like)  35.92 
 
 		 143 aa  57.8  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.364333  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2567  nuclease  27.78 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.190384 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  30.63 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  35.54 
 
 		 171 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0817  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 		 182 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.113561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3415  nuclease (SNase-like)  37.38 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3139  nuclease (SNase-like)  35.29 
 
 		 158 aa  54.7  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2244  nuclease  36.73 
 
 		 534 aa  54.3  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.000544674  normal  0.0168792 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1966  putative transmembrane protein  36.54 
 
 		 252 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.113674  normal  0.424222 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  32.14 
 
 		 148 aa  52.8  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3035  nuclease (SNase-like)  31.34 
 
 		 143 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.376528  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0154  nuclease  38.18 
 
 		 190 aa  52  0.000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0141  thermonuclease family protein  28.26 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0088  SNase-like nuclease  31.15 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0272  thermonuclease family protein  28.26 
 
 		 214 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  0.843157 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.73 
 
 		 166 aa  50.4  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  30.77 
 
 		 158 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.04 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0324  thermonuclease  27.66 
 
 		 214 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0715  nuclease (SNase-like)  39.53 
 
 		 193 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.680905 
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4927  nuclease (SNase domain protein)  37.38 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  27.47 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3956  nuclease (SNase-like)  31.03 
 
 		 171 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1330  nuclease  41.96 
 
 		 159 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000000000142245 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.85 
 
 		 174 aa  49.3  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00761  hypothetical protein  32.97 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.489486 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06071  micrococcal nuclease  30.93 
 
 		 185 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.312315  normal  0.542138 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  28.23 
 
 		 166 aa  48.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9184  nuclease protein  35.58 
 
 		 127 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779909  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  31.87 
 
 		 216 aa  48.1  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0211  thermonuclease family protein  28.26 
 
 		 214 aa  48.1  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  33 
 
 		 172 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.36 
 
 		 164 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2354  nuclease (SNase-like)  30.19 
 
 		 164 aa  47.8  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.527166  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  40.43 
 
 		 214 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0576  Excalibur domain protein  34.07 
 
 		 212 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.00000012089  unclonable  0.00000255125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3319  SNase-like nuclease  33.05 
 
 		 158 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  29.06 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1722  nuclease (SNase domain protein)  35.56 
 
 		 273 aa  46.6  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0103  thermonuclease  30.69 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.244407  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0290  SNase-like nuclease  31.18 
 
 		 227 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1381  micrococcal nuclease-like protein  30.95 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0429202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  31.3 
 
 		 205 aa  46.2  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0816  micrococcal nuclease  30.69 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000405887  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0832  micrococcal nuclease  30.69 
 
 		 228 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000140573  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  31.91 
 
 		 211 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  26.44 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1084  nuclease (SNase domain protein)  29.47 
 
 		 333 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  31.53 
 
 		 191 aa  46.2  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.03 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  26.85 
 
 		 153 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  30.43 
 
 		 182 aa  45.1  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  40.22 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  35.71 
 
 		 153 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  35.71 
 
 		 175 aa  44.7  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1554  nuclease (SNase-like)  31.25 
 
 		 202 aa  44.7  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  29.36 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4496  nuclease  31.19 
 
 		 187 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.783898  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0018  nuclease (SNase domain protein)  34.74 
 
 		 372 aa  45.1  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00664076  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  29.41 
 
 		 238 aa  45.1  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  38.14 
 
 		 196 aa  44.7  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  32.98 
 
 		 178 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1889  nuclease (SNase domain protein)  36.46 
 
 		 224 aa  44.3  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.058729  normal  0.0179002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1025  nuclease  32.41 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0861238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  38.71 
 
 		 214 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  30.43 
 
 		 153 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  25.27 
 
 		 206 aa  43.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  30.77 
 
 		 258 aa  43.9  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3744  nuclease  35.87 
 
 		 161 aa  43.9  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.904151 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  28.97 
 
 		 187 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0400  nuclease  34.29 
 
 		 267 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  37.63 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2456  nuclease (SNase domain protein)  32.29 
 
 		 240 aa  42.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127297  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  35.35 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  33.68 
 
 		 158 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15970  micrococcal nuclease-like nuclease  34.25 
 
 		 388 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.339667  normal  0.0582928 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1218  micrococcal nuclease  36.56 
 
 		 284 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.340298  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  28.26 
 
 		 227 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0538  nuclease  33.94 
 
 		 266 aa  42.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  30.19 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1341  nuclease (SNase domain protein)  34.12 
 
 		 271 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.223732  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  27.2 
 
 		 232 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  35.11 
 
 		 138 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2051  nuclease (SNase-like)  34.45 
 
 		 228 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0268547  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0134  Excalibur  27.19 
 
 		 220 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.194412  normal  0.895355 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66700  putative nuclease  35.58 
 
 		 255 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5136  nuclease  33.64 
 
 		 273 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>