More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3096 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_3096  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4222  GntR family transcriptional regulator  75.95 
 
 		 254 aa  362  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.993949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2208  GntR family transcriptional regulator  47.32 
 
 		 223 aa  198  7.999999999999999e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.223397  normal  0.583334 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3062  GntR family transcriptional regulator  51.01 
 
 		 228 aa  192  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0583263  normal  0.817477 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1164  GntR family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 218 aa  185  7e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.720866  normal  0.242245 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3199  GntR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 222 aa  183  3e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.405937  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3053  GntR family transcriptional regulator  48.99 
 
 		 229 aa  182  4.0000000000000006e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.784851  normal  0.195009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2905  transcriptional regulator, GntR family  45.93 
 
 		 231 aa  182  6e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.839759  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1327  transcriptional regulator, GntR family  42.93 
 
 		 227 aa  180  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.349018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  42.13 
 
 		 226 aa  178  7e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  43.98 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 242 aa  176  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5730  GntR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 251 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2906  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 226 aa  172  5e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  44.44 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3389  GntR family transcriptional regulator  43 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 241 aa  169  5e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2754  GntR family transcriptional regulator  46.46 
 
 		 231 aa  169  5e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.287594 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5191  transcriptional regulator, GntR family  41.38 
 
 		 225 aa  168  7e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000155009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 241 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 241 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5631  GntR family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 229 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  41.38 
 
 		 230 aa  165  8e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3484  GntR family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294371  normal  0.809242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  41.38 
 
 		 230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4718  transcriptional regulator, GntR family  43.43 
 
 		 274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0061626 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4571  transcriptional regulator, GntR family  43.94 
 
 		 263 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0294362 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4201  regulatory protein GntR HTH  43.94 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.316316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2769  transcriptional regulator, GntR family  43.43 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1256  transcriptional regulator, GntR family  41.54 
 
 		 231 aa  159  5e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.586616  normal  0.233968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3139  GntR family transcriptional regulator  42.78 
 
 		 284 aa  158  1e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00307264  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0601  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 227 aa  154  1e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3401  transcriptional regulator, GntR family  42.21 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3422  GntR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3523  GntR family transcriptional regulator  40.7 
 
 		 275 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.33471  normal  0.169398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6547  GntR family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 246 aa  138  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.485064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1377  transcriptional regulator, GntR family  40.4 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322083  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7930  transcriptional regulator, GntR family  35.41 
 
 		 221 aa  132  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4989  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 232 aa  131  9e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.06037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  34.05 
 
 		 226 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  40 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4617  GntR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 229 aa  121  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  34.63 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 235 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2535  transcriptional regulator, GntR family  36.89 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7654  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0049  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 245 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 229 aa  115  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3889  putative transcriptional regulator  37.1 
 
 		 240 aa  115  7.999999999999999e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.570531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 222 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1484  transcriptional regulator, GntR family  35.36 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2293  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.235113  hitchhiker  0.00231289 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0466  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0135262 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 235 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 228 aa  113  4.0000000000000004e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2755  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 255 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253691 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  33.16 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1245  GntR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 242 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.65087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  109  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0233  GntR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 219 aa  109  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 233 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  32 
 
 		 211 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 229 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 233 aa  105  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 211 aa  105  6e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1811  transcriptional regulator GntR  32.66 
 
 		 249 aa  105  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.148562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1793  GntR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 254 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1632  GntR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 223 aa  104  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.592132  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1073  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1834  GntR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4132  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 295 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1891  transcriptional regulator, GntR family  27.94 
 
 		 223 aa  103  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0316867  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1271  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4019  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5133  GntR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.319425 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  34.8 
 
 		 239 aa  103  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2445  transcriptional regulator  36.82 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.247601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0081  GntR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0384322 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1708  transcriptional regulator, GntR family  32.86 
 
 		 212 aa  101  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.243048 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  32.04 
 
 		 232 aa  101  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5213  GntR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.380021  normal  0.310032 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1379  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 227 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.163127  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1218  GntR domain-containing protein  33.17 
 
 		 250 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.415589 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 235 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1582  GntR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1411  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0858429  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1773  transcriptional regulator, GntR family  28.43 
 
 		 223 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.851704  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2156  transcriptional regulator, GntR family  36.14 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.695514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1585  GntR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 263 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.640337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  33.16 
 
 		 226 aa  100  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44780  putative transcriptional regulator  30.7 
 
 		 259 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.13802  normal  0.152718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>