More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2983 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2983  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  626  1e-178  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  7.53467e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1608  protein of unknown function DUF6 transmembrane  54.11 
 
 
293 aa  315  5e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.646472  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1431  protein of unknown function DUF6 transmembrane  51.74 
 
 
293 aa  308  9e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.516158 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3386  hypothetical protein  52.38 
 
 
295 aa  299  4e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3854  hypothetical protein  50.52 
 
 
301 aa  292  5e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0943127  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0141  hypothetical protein  47.55 
 
 
289 aa  256  3e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0877  RhaT family transporter  49.29 
 
 
294 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.160305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2538  hypothetical protein  49.29 
 
 
294 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.228552  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0706  hypothetical protein  48.06 
 
 
319 aa  252  5e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227695  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0143  hypothetical protein  47.87 
 
 
294 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  48.25 
 
 
292 aa  244  1e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0148  hypothetical protein  45.65 
 
 
295 aa  235  9e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0292713  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2777  hypothetical protein  41.91 
 
 
320 aa  214  2e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2128  hypothetical protein  34.04 
 
 
295 aa  146  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00862531  normal  0.346233 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2344  hypothetical protein  33.21 
 
 
288 aa  134  1e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0323  hypothetical protein  30.86 
 
 
292 aa  135  1e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0577567  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2212  hypothetical protein  33.92 
 
 
315 aa  133  4e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.193478  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02970  hypothetical protein  30.69 
 
 
292 aa  133  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000670946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2443  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.41 
 
 
314 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2944  hypothetical protein  30.59 
 
 
311 aa  128  1e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0954249 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1133  hypothetical protein  30.39 
 
 
294 aa  128  1e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000153397  normal  0.186068 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3253  hypothetical protein  32.53 
 
 
310 aa  127  2e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4908  hypothetical protein  28.42 
 
 
292 aa  127  2e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4189  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.72 
 
 
313 aa  125  8e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.437089  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2825  hypothetical protein  32.4 
 
 
317 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1872  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
318 aa  124  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102364  normal  0.0795178 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0601  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.54 
 
 
305 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0826683 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0556  hypothetical protein  28.08 
 
 
297 aa  119  9e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0590  hypothetical protein  27.63 
 
 
309 aa  119  1e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2075  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.6 
 
 
306 aa  118  2e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3918  hypothetical protein  29.86 
 
 
285 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20856  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3656  hypothetical protein  28.28 
 
 
309 aa  117  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.896528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2643  hypothetical protein  30.66 
 
 
289 aa  116  4e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.432967  normal  0.0247231 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2233  hypothetical protein  28.93 
 
 
292 aa  115  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4418  hypothetical protein  31.14 
 
 
306 aa  115  1e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09840  hypothetical protein  31.1 
 
 
295 aa  115  1e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3670  hypothetical protein  28.06 
 
 
292 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.232107  normal  0.0162168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2229  hypothetical protein  28.06 
 
 
292 aa  112  7e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.551408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1796  hypothetical protein  31.54 
 
 
317 aa  112  8e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0618522 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4275  hypothetical protein  29.84 
 
 
331 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122751  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2059  hypothetical protein  27.6 
 
 
311 aa  111  2e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00805  integral membrane protein  32.09 
 
 
303 aa  109  5e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0905837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1274  hypothetical protein  31.14 
 
 
308 aa  109  7e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154699  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2504  permease  28.88 
 
 
312 aa  107  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.524899  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0796  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.24 
 
 
339 aa  107  3e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0746717 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2232  hypothetical protein  31.69 
 
 
295 aa  106  6e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0870  hypothetical protein  28.34 
 
 
347 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0477491 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0441  hypothetical protein  30 
 
 
317 aa  105  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.406892  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0315  hypothetical protein  29.23 
 
 
319 aa  105  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25781  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0830  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.99 
 
 
333 aa  104  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.181944 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1906  hypothetical protein  28.11 
 
 
304 aa  103  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1583  hypothetical protein  29.31 
 
 
302 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0899842  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02987  hypothetical protein  31.71 
 
 
316 aa  102  7e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0991563  normal  0.534543 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3713  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.991979  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3194  hypothetical protein  32.53 
 
 
310 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.684444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3486  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.22 
 
 
298 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.736924 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4573  hypothetical protein  33.5 
 
 
305 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.202635 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1323  hypothetical protein  28.47 
 
 
293 aa  100  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.10369  normal  0.959808 
 
 
-
 
NC_002978  WD0621  hypothetical protein  24.35 
 
 
304 aa  99.8  6e-20  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.182424  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1388  hypothetical protein  30.82 
 
 
337 aa  99.4  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1004  putative transmembrane protein  29.01 
 
 
301 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.583779  hitchhiker  0.00109211 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1548  hypothetical protein  25.69 
 
 
291 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.756376  normal  0.308445 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2120  hypothetical protein  29.21 
 
 
317 aa  97.1  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.495986 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0418  hypothetical protein  29.07 
 
 
306 aa  96.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5428  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.62 
 
 
305 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0743422  hitchhiker  0.00836248 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03092  integral membrane protein DUF6  31.36 
 
 
285 aa  96.7  5e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0131  hypothetical protein  30.21 
 
 
321 aa  96.3  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2483  hypothetical protein  35.96 
 
 
288 aa  95.5  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.941945  normal  0.050629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2264  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.62 
 
 
302 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0912257  normal  0.0283432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2623  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.44 
 
 
318 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.876782 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1798  hypothetical protein  34.43 
 
 
286 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.404133  normal  0.483155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49940  DUF6 family membrane protein  27.4 
 
 
288 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.363771  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5151  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.37 
 
 
305 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00128195  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0931  hypothetical protein  34.8 
 
 
294 aa  92.4  9e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2040  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.81 
 
 
302 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0382174  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1559  hypothetical protein  27.24 
 
 
316 aa  92  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38160  hypothetical protein  28.38 
 
 
288 aa  92  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.863568  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0929  hypothetical protein  29.03 
 
 
297 aa  91.7  1e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0374563 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1859  hypothetical protein  24.91 
 
 
285 aa  90.9  2e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00103759 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4050  membrane protein  29.24 
 
 
317 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.146235  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2883  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.94 
 
 
318 aa  91.3  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.750898  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3237  hypothetical protein  29.15 
 
 
300 aa  91.7  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2668  hypothetical protein  29.01 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28664  DMT family transporter: drug/metabolite  25.86 
 
 
309 aa  90.1  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0080  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.21 
 
 
328 aa  90.1  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.109193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5037  hypothetical protein  27.37 
 
 
295 aa  89.7  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.04 
 
 
325 aa  89.4  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0237  hypothetical protein  32.85 
 
 
279 aa  88.6  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2866  hypothetical protein  27.51 
 
 
293 aa  88.2  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0944442  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1160  hypothetical protein  33.01 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.565662  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2376  hypothetical protein  27.27 
 
 
317 aa  88.2  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.545392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0158  hypothetical protein  26.98 
 
 
301 aa  87.4  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2492  RhaT family protein  33.01 
 
 
294 aa  87  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.738577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04178  drug/metabolite transporter superfamily protein  27.11 
 
 
291 aa  87  4e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.291687  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1547  hypothetical protein  27.87 
 
 
289 aa  86.3  5e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.190164  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0573  hypothetical protein  33.94 
 
 
288 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0585  hypothetical protein  26.83 
 
 
306 aa  85.9  8e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0270  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.74 
 
 
301 aa  84.3  2e-15  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3761  hypothetical protein  25.54 
 
 
318 aa  84.3  2e-15  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0163  hypothetical protein  26.8 
 
 
317 aa  84.3  3e-15  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.397417  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>