180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2876 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1550 aa  2970    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  38.98 
 
 
2003 aa  444  1e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  37.16 
 
 
1119 aa  432  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  42.48 
 
 
3506 aa  423  1e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.79 
 
 
1029 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.28 
 
 
1227 aa  412  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  38.91 
 
 
995 aa  402  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.06 
 
 
1848 aa  398  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  38.44 
 
 
986 aa  392  1e-107  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.28 
 
 
1508 aa  358  2.9999999999999997e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.48 
 
 
1011 aa  335  4e-90  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  33.91 
 
 
2711 aa  335  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  36.03 
 
 
1782 aa  323  9.999999999999999e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.59 
 
 
1881 aa  316  1.9999999999999998e-84  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.27 
 
 
3629 aa  310  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  51.54 
 
 
2396 aa  305  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  56.68 
 
 
2365 aa  305  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  56.68 
 
 
2346 aa  305  5.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  55.28 
 
 
2366 aa  300  2e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.53 
 
 
972 aa  295  4e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  36.98 
 
 
2926 aa  294  8e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  31.55 
 
 
1519 aa  292  3e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  32.16 
 
 
4238 aa  288  5.999999999999999e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  32.16 
 
 
3822 aa  287  9e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  42.6 
 
 
1056 aa  287  1.0000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  32.86 
 
 
4238 aa  286  2.0000000000000002e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  32.83 
 
 
650 aa  283  2e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  36.52 
 
 
1001 aa  281  8e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.44 
 
 
919 aa  278  4e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  34.87 
 
 
1055 aa  277  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  31.88 
 
 
3954 aa  277  1.0000000000000001e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  36.33 
 
 
1001 aa  276  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  37.09 
 
 
3415 aa  273  2e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.72 
 
 
991 aa  273  2e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  37.09 
 
 
3420 aa  273  2.9999999999999997e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  34.17 
 
 
1006 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  35.45 
 
 
1004 aa  272  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  34.53 
 
 
1033 aa  271  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  36.21 
 
 
995 aa  270  2e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  51.21 
 
 
2371 aa  267  8.999999999999999e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  32.99 
 
 
990 aa  265  4.999999999999999e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  34.87 
 
 
1038 aa  263  2e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  35.2 
 
 
1028 aa  261  6e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  35.69 
 
 
983 aa  260  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  32.63 
 
 
1152 aa  254  1e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  35.66 
 
 
1571 aa  252  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  40.82 
 
 
1459 aa  248  8e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  35.7 
 
 
1062 aa  247  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.58 
 
 
2906 aa  245  6e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  35.41 
 
 
1053 aa  242  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  34.2 
 
 
1593 aa  239  3e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  34.64 
 
 
1164 aa  239  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.67 
 
 
2578 aa  229  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  30.97 
 
 
1861 aa  224  8e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.86 
 
 
1125 aa  223  1.9999999999999999e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.83 
 
 
677 aa  218  7e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  35.48 
 
 
1016 aa  217  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  33.58 
 
 
994 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.24 
 
 
985 aa  213  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  32.65 
 
 
980 aa  211  9e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  31.13 
 
 
1971 aa  205  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  31.01 
 
 
1333 aa  199  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  34.72 
 
 
1011 aa  183  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.12 
 
 
1322 aa  179  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  35.07 
 
 
1458 aa  169  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.02 
 
 
1081 aa  165  6e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  33.27 
 
 
1530 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  34.47 
 
 
1113 aa  157  2e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  35.17 
 
 
1172 aa  149  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  28.83 
 
 
1769 aa  141  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.95 
 
 
3089 aa  141  1e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  29.1 
 
 
816 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  35.7 
 
 
3391 aa  134  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  38.64 
 
 
3322 aa  132  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.17 
 
 
1694 aa  132  7.000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  32.41 
 
 
994 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.01 
 
 
1489 aa  128  8.000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  29.27 
 
 
1180 aa  127  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  42.22 
 
 
1108 aa  125  9e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  32.23 
 
 
1882 aa  123  3e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  29.43 
 
 
407 aa  118  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  34.78 
 
 
1130 aa  115  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  27.47 
 
 
1111 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.31 
 
 
1532 aa  108  8e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30 
 
 
488 aa  105  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.21 
 
 
1806 aa  103  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  36.21 
 
 
1632 aa  102  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  37.23 
 
 
1741 aa  94.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  49.22 
 
 
861 aa  94.4  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  36.49 
 
 
2407 aa  94.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  27.13 
 
 
1078 aa  91.7  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  34.63 
 
 
2057 aa  85.9  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  43.8 
 
 
2642 aa  83.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.87 
 
 
814 aa  82.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.84 
 
 
906 aa  82  0.00000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  33.57 
 
 
1099 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.92 
 
 
1369 aa  79.7  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  34.51 
 
 
852 aa  79  0.0000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.8 
 
 
1357 aa  79  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3186  putative autotransporter  44.12 
 
 
145 aa  78.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>