More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2842 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3733  sugar ABC transporter ATPase  72 
 
 		 497 aa  714    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0622691  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2301  ABC transporter component  64.8 
 
 		 521 aa  640    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2842  ABC transporter related  100 
 
 		 500 aa  1015    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3466  ABC transporter related  71.6 
 
 		 497 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.978102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3354  ABC-type xylose transport system periplasmic component-like protein  71.4 
 
 		 497 aa  685    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0716508 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0530  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transport system protein  49.7 
 
 		 498 aa  459  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3319  ABC transporter related  48.28 
 
 		 499 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.612021  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0365  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0432  ABC transporter related  46.14 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4694  ABC transporter-related protein  46.56 
 
 		 499 aa  427  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1230  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  46.14 
 
 		 498 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.241899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0346  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4062  ABC transporter related  43.28 
 
 		 522 aa  411  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0387  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0393  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  45.13 
 
 		 494 aa  409  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4370  ABC transporter related  43.35 
 
 		 520 aa  403  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.652509  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3638  ABC transporter related  45.95 
 
 		 508 aa  404  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1337  ABC transporter component  43.06 
 
 		 527 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.843363  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4616  ABC transporter related  44.54 
 
 		 504 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3560  ABC transporter related  46.09 
 
 		 520 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.79435  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5311  ABC transporter related  43.93 
 
 		 504 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.609241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5191  ABC transporter related  42.69 
 
 		 523 aa  393  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3820  ABC transporter related  43.46 
 
 		 528 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1404  ABC sugar transporter, ATPase subunit  43.35 
 
 		 545 aa  388  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.351158  normal  0.283269 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0031  sugar ABC transporter, ATP-binding  41.48 
 
 		 491 aa  383  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4658  ABC transporter related  42.06 
 
 		 510 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.349375  normal  0.643643 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3399  ABC transporter related  44.9 
 
 		 504 aa  378  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0928  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.383127 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3266  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  44.9 
 
 		 504 aa  377  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1269  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.6 
 
 		 516 aa  372  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.490766  normal  0.14862 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  38.72 
 
 		 505 aa  372  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3723  ABC transporter related protein  43.31 
 
 		 507 aa  369  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.96 
 
 		 516 aa  369  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0785  ABC transporter related  44.27 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4329  ABC transporter related  42.8 
 
 		 539 aa  372  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.572322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  40.41 
 
 		 524 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  40.42 
 
 		 503 aa  367  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  39.87 
 
 		 504 aa  365  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  37.7 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.7 
 
 		 499 aa  365  1e-99  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  40.41 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  40.41 
 
 		 524 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  40.75 
 
 		 527 aa  364  2e-99  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  40.96 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  38.87 
 
 		 501 aa  363  4e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  40.75 
 
 		 524 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  40.71 
 
 		 524 aa  362  1e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  40.61 
 
 		 499 aa  361  2e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  39.47 
 
 		 512 aa  361  2e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  39.84 
 
 		 505 aa  359  6e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1792  ABC transporter related  39.52 
 
 		 494 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0113555  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  39.96 
 
 		 519 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  39.43 
 
 		 501 aa  358  1.9999999999999998e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  39.47 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  39.47 
 
 		 512 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  39.51 
 
 		 512 aa  356  5e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  40.2 
 
 		 498 aa  356  5e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2604  ABC transporter related  38.98 
 
 		 522 aa  356  5.999999999999999e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.916852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  39.51 
 
 		 514 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  36.65 
 
 		 499 aa  354  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4447  ABC transporter related  39.51 
 
 		 513 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416844 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2308  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  39.63 
 
 		 525 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2409  ABC transporter related  39.63 
 
 		 525 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.518349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  39.2 
 
 		 518 aa  353  4e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3406  ABC transporter related  40.41 
 
 		 507 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.551553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  37.42 
 
 		 513 aa  353  4e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  38.77 
 
 		 511 aa  353  5e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  39.96 
 
 		 508 aa  353  5e-96  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  38.38 
 
 		 503 aa  352  7e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  39.31 
 
 		 513 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3048  ABC transporter related protein  36.93 
 
 		 513 aa  352  8.999999999999999e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182553  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  38.3 
 
 		 513 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  37.5 
 
 		 525 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  38.98 
 
 		 511 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  37.42 
 
 		 513 aa  350  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  36.9 
 
 		 510 aa  350  3e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  38.74 
 
 		 516 aa  350  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  37.91 
 
 		 525 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0544  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 521 aa  348  9e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0637  ABC transporter related  36.46 
 
 		 498 aa  348  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.011918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0426  ABC-type sugar (aldose) transport system, ATPase component  37.25 
 
 		 498 aa  347  3e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  39.29 
 
 		 515 aa  347  3e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  38.45 
 
 		 521 aa  347  3e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3851  ABC transporter related protein  38.63 
 
 		 521 aa  347  4e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  36.59 
 
 		 499 aa  346  4e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4900  D-ribose transporter ATP binding protein  37.27 
 
 		 501 aa  346  5e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.200163  hitchhiker  0.000000993507 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2401  ABC transporter related protein  38.06 
 
 		 505 aa  346  6e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4769  ABC transporter related  39.15 
 
 		 494 aa  345  8e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.132101  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  37.63 
 
 		 502 aa  345  1e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  37.47 
 
 		 495 aa  345  1e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4165  D-ribose transporter ATP binding protein  36.81 
 
 		 501 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.846402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4109  D-ribose transporter ATP binding protein  36.81 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114584  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  39.35 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0921  ABC transporter related  37.85 
 
 		 496 aa  344  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  38.06 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4215  D-ribose transporter ATP binding protein  37.32 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.777457 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  38.09 
 
 		 508 aa  344  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  37.58 
 
 		 512 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4094  D-ribose transporter ATP binding protein  36.81 
 
 		 516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4274  D-ribose transporter ATP binding protein  36.81 
 
 		 516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>