More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2640 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2640  SsrA-binding protein  100 
 
 
158 aa  322  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.506414  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0647  SsrA-binding protein  94.3 
 
 
158 aa  310  4.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.49338  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0641  SsrA-binding protein  93.67 
 
 
158 aa  306  5.9999999999999995e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0465  SsrA-binding protein  77.85 
 
 
158 aa  258  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.174489  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0990  SsrA-binding protein  71.97 
 
 
159 aa  238  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.910775  normal  0.605905 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1143  SsrA-binding protein  70.7 
 
 
159 aa  234  3e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1434  SsrA-binding protein  72.11 
 
 
158 aa  226  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.373269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0942  SsrA-binding protein  71.23 
 
 
155 aa  225  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0373189  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0847  SsrA-binding protein  66.03 
 
 
158 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.744704 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3832  SsrA-binding protein  63.92 
 
 
158 aa  216  7e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2631  SsrA-binding protein  65.58 
 
 
157 aa  216  7.999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0750238  normal  0.108359 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1927  SsrA-binding protein  66.89 
 
 
157 aa  216  1e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.289169 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2260  SsrA-binding protein  64.94 
 
 
157 aa  216  1e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2963  SsrA-binding protein  64.29 
 
 
157 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2642  SsrA-binding protein  64.94 
 
 
157 aa  215  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.122546  hitchhiker  0.0029074 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2604  SsrA-binding protein  64.29 
 
 
157 aa  214  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0711734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4692  SsrA-binding protein  64.29 
 
 
157 aa  214  5e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0948548 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1869  SsrA-binding protein  68.24 
 
 
158 aa  213  7e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.155972  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0674  SsrA-binding protein  68.79 
 
 
159 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27244  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0632  SsrA-binding protein  62.25 
 
 
156 aa  203  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.160357  normal  0.270611 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0516  SsrA-binding protein  58.33 
 
 
160 aa  201  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.760363 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2482  SsrA-binding protein  58.86 
 
 
158 aa  200  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.082086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0696  SsrA-binding protein  60.65 
 
 
157 aa  199  9e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.311551 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1730  SsrA-binding protein  61.07 
 
 
161 aa  199  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.890336  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1444  SsrA-binding protein  60.4 
 
 
160 aa  197  5e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1485  SsrA-binding protein  60.39 
 
 
157 aa  194  3e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.439757  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0031  SsrA-binding protein  55.06 
 
 
158 aa  194  6e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.891709 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2863  SsrA-binding protein  59.24 
 
 
165 aa  189  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.643018  normal  0.0844663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1864  SsrA-binding protein  58.5 
 
 
160 aa  189  2e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0883  SsrA-binding protein  56.95 
 
 
157 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3192  SsrA-binding protein  56.77 
 
 
157 aa  187  4e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393321  normal  0.919701 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2543  SsrA-binding protein  56.95 
 
 
157 aa  187  4e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.829865  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3085  SsrA-binding protein  61.07 
 
 
152 aa  187  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0708876  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3516  SsrA-binding protein  56.77 
 
 
157 aa  187  4e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal  0.0847481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3388  SsrA-binding protein  56.77 
 
 
157 aa  187  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0147  SsrA-binding protein  56.69 
 
 
160 aa  184  3e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.972615  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1891  SsrA-binding protein  56.13 
 
 
157 aa  184  4e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340867  hitchhiker  0.000798962 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0123  SsrA-binding protein  58.28 
 
 
157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.357206  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1582  SsrA-binding protein  55.06 
 
 
156 aa  177  8e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0563704  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  54.48 
 
 
150 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  54.48 
 
 
150 aa  170  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  53.74 
 
 
155 aa  165  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0104  SsrA-binding protein  53.06 
 
 
162 aa  164  4e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.283448  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  54.73 
 
 
153 aa  163  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
161 aa  163  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  55.17 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  54.55 
 
 
159 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
160 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0086  SsrA-binding protein  51.39 
 
 
148 aa  161  3e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0767  SsrA-binding protein  51.72 
 
 
149 aa  160  4.0000000000000004e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0984  SsrA-binding protein  51.68 
 
 
159 aa  160  9e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.458725  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  53.15 
 
 
159 aa  159  1e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
162 aa  158  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0801  SsrA-binding protein  51.03 
 
 
159 aa  158  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
160 aa  157  7e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  52.03 
 
 
150 aa  156  9e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  52.11 
 
 
165 aa  155  2e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  53.06 
 
 
152 aa  155  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1907  SsrA-binding protein  45.91 
 
 
159 aa  154  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.45258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  49.34 
 
 
176 aa  154  4e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1038  SsrA-binding protein  50.99 
 
 
177 aa  154  5.0000000000000005e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.102132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  51.41 
 
 
168 aa  154  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
155 aa  153  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3476  SsrA-binding protein  50.34 
 
 
150 aa  153  7e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0920584  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  53.1 
 
 
160 aa  152  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  52.05 
 
 
155 aa  152  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  51.03 
 
 
157 aa  152  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  51.37 
 
 
154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5790  SsrA-binding protein  52.98 
 
 
158 aa  151  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.84107  normal  0.636421 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1236  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
158 aa  151  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.114649  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1351  SsrA-binding protein  53.49 
 
 
153 aa  151  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1481  SsrA-binding protein  48.97 
 
 
155 aa  150  5e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.618224  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  51.06 
 
 
165 aa  150  5e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  48.73 
 
 
157 aa  150  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0811  SsrA-binding protein  47.18 
 
 
147 aa  150  5e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0135  SsrA-binding protein  52.78 
 
 
149 aa  150  5.9999999999999996e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.554782  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  50.35 
 
 
160 aa  150  7e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3101  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  150  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  48.65 
 
 
156 aa  150  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3020  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.631512  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  48.95 
 
 
161 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  51.39 
 
 
159 aa  149  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  50 
 
 
155 aa  149  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  49.32 
 
 
155 aa  149  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  48.68 
 
 
156 aa  148  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3451  SsrA-binding protein  51.05 
 
 
157 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  48.61 
 
 
157 aa  148  3e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1909  SsrA-binding protein  49.37 
 
 
160 aa  148  3e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2620  SsrA-binding protein  50 
 
 
157 aa  147  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  48.99 
 
 
167 aa  147  4e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  48.7 
 
 
155 aa  147  6e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0675  SsrA-binding protein  46.53 
 
 
154 aa  146  8e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00171749  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1272  SsrA-binding protein  52.14 
 
 
159 aa  147  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.352347  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1409  SsrA-binding protein  50 
 
 
158 aa  146  9e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1508  SsrA-binding protein  48.15 
 
 
149 aa  146  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  51.7 
 
 
153 aa  146  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  48.05 
 
 
155 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1247  SsrA-binding protein  50.68 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>