164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2601 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0687  hypothetical protein  88.03 
 
 
402 aa  722    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.658083  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0679  hypothetical protein  87.78 
 
 
402 aa  718    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2601  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 
402 aa  803    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0508  YjgP/YjgQ permease  53.3 
 
 
396 aa  424  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1212  permease YjgP/YjgQ family protein  47.76 
 
 
393 aa  370  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.205645  decreased coverage  0.00000154162 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1068  permease YjgP/YjgQ family protein  48.01 
 
 
393 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.388378  hitchhiker  0.0000584929 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0765  permease YjgP/YjgQ family protein  45.79 
 
 
390 aa  365  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.259826 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1543  hypothetical protein  45.14 
 
 
399 aa  356  5e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1757  permease YjgP/YjgQ  44.53 
 
 
416 aa  344  2e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00499873  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2340  permease YjgP/YjgQ  32.56 
 
 
389 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.545488  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3943  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3650  permease YjgP/YjgQ family protein  32.26 
 
 
389 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3933  permease YjgP/YjgQ family protein  31.35 
 
 
389 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0880082 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5836  permease YjgP/YjgQ family protein  33.99 
 
 
388 aa  193  4e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2313  permease YjgP/YjgQ  31.76 
 
 
388 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3831  putative permease  31.04 
 
 
389 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.223671 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1677  permease YjgP/YjgQ  32.26 
 
 
390 aa  191  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0556  permease YjgP/YjgQ family protein  30.94 
 
 
386 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.023803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5098  permease YjgP/YjgQ family protein  33.66 
 
 
388 aa  187  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950037  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2966  permease YjgP/YjgQ  32.58 
 
 
388 aa  187  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.827608 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2838  permease YjgP/YjgQ family protein  30.9 
 
 
405 aa  186  7e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579842  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2480  permease YjgP/YjgQ  32.28 
 
 
388 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3471  permease YjgP/YjgQ family protein  31.87 
 
 
388 aa  179  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.630057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3338  permease YjgP/YjgQ family protein  30.29 
 
 
388 aa  163  4.0000000000000004e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.303963 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1226  permease YjgP/YjgQ family protein  29.31 
 
 
373 aa  139  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0365933  normal  0.672462 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2943  permease YjgP/YjgQ  28.04 
 
 
396 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.263942  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3046  permease YjgP/YjgQ family protein  25.4 
 
 
398 aa  103  7e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.583583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1814  permease YjgP/YjgQ  25.61 
 
 
371 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.120366  normal  0.600316 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0902  permease YjgP/YjgQ family protein  25.61 
 
 
382 aa  96.7  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0497689 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2900  permease  25.27 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.675827  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1544  permease YjgP/YjgQ family protein  25.27 
 
 
376 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2530  permease YjgP/YjgQ family protein  26.57 
 
 
378 aa  93.2  7e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.749789  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1121  permease YjgP/YjgQ family protein  25.62 
 
 
376 aa  93.2  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.182226 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1190  permease YjgP/YjgQ family protein  26.55 
 
 
380 aa  90.1  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.504268  normal  0.434542 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1462  permease YjgP/YjgQ family protein  27.82 
 
 
495 aa  83.2  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0949  permease YjgP/YjgQ  20.69 
 
 
379 aa  81.6  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0162429  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1922  hypothetical protein  23.65 
 
 
418 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.1714400000000003e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3407  permease YjgP/YjgQ family protein  20.8 
 
 
391 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134453  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1249  permease YjgP/YjgQ  22.46 
 
 
418 aa  73.6  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103776  hitchhiker  0.00076385 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2628  permease YjgP/YjgQ family protein  23.81 
 
 
386 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1922  hypothetical protein  23.17 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3469  permease YjgP/YjgQ family protein  22.12 
 
 
391 aa  70.5  0.00000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1323  permease YjgP/YjgQ family protein  23.17 
 
 
478 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.976143 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1638  permease YjgP/YjgQ family protein  22.93 
 
 
382 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000229527  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3734  permease YjgP/YjgQ family protein  20.9 
 
 
389 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000306059  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1077  permease YjgP/YjgQ family protein  22.46 
 
 
370 aa  63.2  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.000191567  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2677  permease YjgP/YjgQ family protein  23.8 
 
 
392 aa  62.4  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00342239  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.3 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000695544  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1402  permease YjgP/YjgQ family protein  23.53 
 
 
370 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.999053 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03634  hypothetical protein  22.54 
 
 
366 aa  62.8  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3417  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0437  hypothetical protein  23.66 
 
 
443 aa  62  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002429  hypothetical protein  22.26 
 
 
366 aa  61.6  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000155201  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0723  hypothetical protein  25.11 
 
 
442 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.20608  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2115  permease YjgP/YjgQ  24.61 
 
 
373 aa  60.8  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3562  permease YjgP/YjgQ family protein  21.08 
 
 
480 aa  60.8  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.326279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1394  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 
371 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00373064  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3065  permease YjgP/YjgQ family protein  24.58 
 
 
396 aa  60.8  0.00000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.2421 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1490  permease YjgP/YjgQ family protein  24.77 
 
 
371 aa  60.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.857253  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1627  permease YjgP/YjgQ family protein  25.33 
 
 
403 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00813484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3081  permease YjgP/YjgQ  24.32 
 
 
360 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.770978  normal  0.0713723 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2465  permease YjgP/YjgQ  24.16 
 
 
371 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.174888  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2407  permease YjgP/YjgQ  22.58 
 
 
376 aa  57.4  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.481022  normal  0.64368 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1679  permease YjgP/YjgQ family protein  26.85 
 
 
409 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.164561  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2786  permease YjgP/YjgQ family protein  27.6 
 
 
360 aa  57  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.577495  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06260  hypothetical protein  28.69 
 
 
456 aa  57  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0371515  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2176  permease YjgP/YjgQ  21.79 
 
 
402 aa  57  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.668049 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0402  permease YjgP/YjgQ  21.71 
 
 
358 aa  56.6  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.0017509  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1425  permease YjgP/YjgQ family protein  23.79 
 
 
380 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.308886  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3118  permease YjgP/YjgQ family protein  23.93 
 
 
370 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000110304  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0741  putative permease  22.75 
 
 
388 aa  55.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0376  permease YjgP/YjgQ family protein  25.29 
 
 
379 aa  55.1  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.116859 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3905  permease YjgP/YjgQ family protein  22.49 
 
 
400 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0179565  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0940  permease YjgP/YjgQ family protein  26.75 
 
 
442 aa  54.7  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3108  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000374217  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1258  permease YjgP/YjgQ family protein  23.61 
 
 
370 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000016572  hitchhiker  0.000115983 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3261  permease YjgP/YjgQ family protein  23.28 
 
 
370 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000653775  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0221  permease YjgP/YjgQ  26.29 
 
 
361 aa  54.3  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.651861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0527  putative permease  22.87 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0167564  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0445  permease YjgP/YjgQ family protein  19.94 
 
 
370 aa  53.1  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1747  permease YjgP/YjgQ  19.94 
 
 
369 aa  52.4  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  23.2 
 
 
358 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3752  permease YjgP/YjgQ family protein  24.26 
 
 
388 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994672 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1059  permease YjgP/YjgQ family protein  23.74 
 
 
498 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546166  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  28.7 
 
 
364 aa  51.6  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1015  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  normal  0.473888 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1374  permease YjgP/YjgQ family protein  21.67 
 
 
363 aa  51.2  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0111  permease YjgP/YjgQ family protein  23.84 
 
 
364 aa  50.4  0.00005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.482303  hitchhiker  0.000636313 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0517  permease  22.69 
 
 
367 aa  50.8  0.00005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0300348  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1234  permease YjgP/YjgQ family protein  25.09 
 
 
371 aa  50.4  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.132199  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1431  permease YjgP/YjgQ family protein  18.04 
 
 
391 aa  50.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  25.38 
 
 
792 aa  50.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2170  permease YjgP/YjgQ family protein  25.43 
 
 
373 aa  50.1  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.233438 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1984  permease YjgP/YjgQ family protein  28.43 
 
 
501 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000194355  normal  0.0100498 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0911  permease YjgP/YjgQ family protein  20.18 
 
 
371 aa  50.1  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000466343  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0796  hypothetical protein  22.79 
 
 
369 aa  50.1  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.211721  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2589  permease YjgP/YjgQ family protein  20.86 
 
 
379 aa  50.1  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00221006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  25.6 
 
 
358 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  27.35 
 
 
366 aa  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5426  hypothetical protein  22.54 
 
 
230 aa  50.1  0.00008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.521103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>