More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2485 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_2485  extracellular solute-binding protein  100 
 
 		 415 aa  852    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00421769  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2588  extracellular solute-binding protein  55.61 
 
 		 419 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.000485668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  45.8 
 
 		 415 aa  343  5e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  45.63 
 
 		 414 aa  335  7e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.87 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  29.48 
 
 		 410 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  28.8 
 
 		 441 aa  124  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  28.93 
 
 		 423 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 410 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.57 
 
 		 415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 414 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.35 
 
 		 423 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 410 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.73 
 
 		 410 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.73 
 
 		 410 aa  116  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0721  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 437 aa  115  2.0000000000000002e-24  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.540981  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0753  extracellular solute-binding protein  27.57 
 
 		 437 aa  112  9e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0289  extracellular solute-binding protein  26.55 
 
 		 437 aa  111  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.00000019091  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1696  extracellular solute-binding protein  27.56 
 
 		 436 aa  108  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00506774  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.39 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  28.43 
 
 		 393 aa  107  4e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2614  extracellular solute-binding protein family 1  26.57 
 
 		 461 aa  106  9e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000017055  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  29.46 
 
 		 431 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2574  extracellular solute-binding protein family 1  27.06 
 
 		 453 aa  104  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.61 
 
 		 403 aa  104  3e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  29.47 
 
 		 422 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0523  extracellular solute-binding protein  32.75 
 
 		 416 aa  103  6e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  29.56 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  27.64 
 
 		 417 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18880  carbohydrate-binding protein  27.86 
 
 		 460 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal  0.173455 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0955  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.152307 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0322  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 419 aa  98.2  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6240  ABC transporter substrate binding protein (maltose)  26.28 
 
 		 407 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0994607  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1748  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 481 aa  97.8  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.922527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.2 
 
 		 406 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2049  extracellular solute-binding protein family 1  29.65 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.266449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20470  extracellular solute-binding protein family 1  25.19 
 
 		 406 aa  95.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000403753  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3386  extracellular solute-binding protein family 1  30.29 
 
 		 440 aa  94.4  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 		 431 aa  94.4  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 444 aa  94  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3962  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0256  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 439 aa  93.6  6e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0340  extracellular solute-binding protein  26.28 
 
 		 419 aa  93.2  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 420 aa  93.2  7e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3655  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 439 aa  93.6  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 437 aa  93.2  8e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  31.74 
 
 		 420 aa  93.2  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0656  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 431 aa  92.8  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.31335 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  29.49 
 
 		 420 aa  92.4  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  26.88 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0405  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.2 
 
 		 438 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6631  extracellular solute-binding protein family 1  25.12 
 
 		 410 aa  92.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.325237 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3216  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 		 425 aa  92  2e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.949389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 427 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1453  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0104666  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  28.57 
 
 		 455 aa  91.3  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  36.02 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 		 420 aa  90.5  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6751  extracellular solute-binding protein family 1  29.01 
 
 		 441 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1702  extracellular solute-binding protein  23.8 
 
 		 422 aa  90.1  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.57478  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2659  extracellular solute-binding protein family 1  26.38 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00136924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3771  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 421 aa  89.7  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5306  extracellular solute-binding protein  25.71 
 
 		 431 aa  89.7  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457023 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3931  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 438 aa  89.7  9e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03302  glycerol-3-phosphate transporter subunit  25.79 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0262  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3928  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0263  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3306  extracellular solute-binding protein  27.04 
 
 		 431 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4767  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.552805 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03255  hypothetical protein  25.79 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2627  extracellular solute-binding protein family 1  27.69 
 
 		 434 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00662506  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4644  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 409 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0265502  normal  0.0904039 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3650  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 438 aa  89.4  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3759  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3869  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3826  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 438 aa  88.2  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2420  extracellular solute-binding protein  26.62 
 
 		 420 aa  88.2  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.228974 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0354  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 419 aa  88.6  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.188589  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1392  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 445 aa  88.2  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1732  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 415 aa  87.8  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000368486  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6664  extracellular solute-binding protein  27.73 
 
 		 452 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0689323 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3732  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.8 
 
 		 438 aa  88.2  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5687  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 401 aa  87.4  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.627079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3870  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 438 aa  87  5e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0125  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 444 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3183  extracellular solute-binding protein family 1  24.7 
 
 		 411 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.641192  normal  0.908857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4566  extracellular solute-binding protein  26.51 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5852  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3748  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  24.65 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0117  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 444 aa  85.1  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.71 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3856  glycerol-3-phosphate transporter periplasmic binding protein  25.21 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.64819 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1017  extracellular solute-binding protein  26.03 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0416471  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  26.06 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.51 
 
 		 426 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0648  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 447 aa  84.3  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.14 
 
 		 443 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>